Table 3.
Variable haplotypes found in the alignment of species of Phlebotomus and Sergentomyia based on molecular analyses of the EF-1α nuclear gene obtained from Iran-Iraq boundaries
| Gene | Species | Origin | Haplotype (GenBank acc. no.) | Position of nucleotide substitution | |||||||||||||||||||
| EF-1α | P. papatasi | 1 | 1 | 2 | 2 | 2 | 3 | 3 | 3 | 3 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | ||||
| 3 | 7 | 0 | 6 | 0 | 2 | 7 | 3 | 8 | 8 | 9 | 0 | 0 | 1 | 1 | 2 | 2 | 2 | 3 | 3 | ||||
| 9 | 8 | 8 | 2 | 4 | 2 | 0 | 9 | 6 | 7 | 5 | 7 | 9 | 5 | 9 | 0 | 2 | 4 | 0 | 2 | ||||
| Abadan | KH382 (KX099735) | T | C | C | A | A | T | T | C | T | C | C | A | G | C | A | G | T | T | A | G | ||
| KH421 (KX099736) | G | T | A | G | G | C | C | T | G | A | A | T | A | G | T | C | A | G | T | A | |||
| P. alexandri | O | H | 2 | 2 | 2 | 2 | 3 | 3 | 3 | 3 | |||||||||||||
| 4 | 4 | 9 | 9 | 0 | 1 | 5 | 8 | ||||||||||||||||
| 3 | 9 | 1 | 7 | 6 | 8 | 5 | 1 | ||||||||||||||||
| Abadan | KH384 (KX099733) | A | G | T | G | T | T | C | A | ||||||||||||||
| Howeyzeh | KH408 (KX099734) | G | A | A | C | C | A | T | G | ||||||||||||||
| S. sintoni | O | H | 2 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | |||||||||||||||
| 3 | 4 | 9 | 4 | 5 | 6 | 6 | 7 | ||||||||||||||||
| 6 | 2 | 7 | 7 | 9 | 2 | 8 | 1 | ||||||||||||||||
| Shadegan | KH133 (KX099722) | C | A | T | T | C | G | T | A | ||||||||||||||
| Bostan | KH322 (KX099723) | . | . | . | C | . | . | . | . | ||||||||||||||
| Shadegan | KH134 (KX099724) | G | C | G | . | A | C | G | C | ||||||||||||||
| Bostan | KH327 (KX099725) | . | A | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||
| S. tiberiadis | O | H | 2 | 3 | 3 | ||||||||||||||||||
| 5 | 9 | 1 | 9 | ||||||||||||||||||||
| 7 | 4 | 5 | 0 | ||||||||||||||||||||
| Haft tappeh | KH305 (KX099726) | T | C | C | G | ||||||||||||||||||
| Hanush | KH307 (KX099727) | C | T | T | A | ||||||||||||||||||