TABLE 5.
Presence of antimicrobial resistance genes identified by in silico analysis in the genomes of the strains analyzed in this studya
| Strainb | aadAc | aph3c | aph6c | strAc | strBc | blaTEMd | floRe | sul2f | tetAg | tetBg | tetCg | tetMg |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1357-A | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − |
| 1676-A | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − |
| 1692-A | − | + | + | − | − | − | − | − | − | + | − | − |
| 1740-A-A | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − |
| 1740-A-B | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − |
| 1802-A | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − |
| 1895-A | − | − | − | + | + | − | − | − | + | − | − | − |
| 1914-A | − | − | − | + | + | − | − | − | + | − | − | − |
| 1958-A-B | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − |
| 2139-A | − | − | − | + | + | − | − | − | − | − | − | − |
| 2152-B | − | − | − | + | + | − | + | + | − | − | − | − |
| 2194-B | − | − | − | + | + | − | − | + | − | + | − | − |
| 2228-A | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − |
| 3674-A | − | − | − | + | + | − | + | + | − | − | − | − |
| 4170 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − |
| 4196 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − |
| 4271-C | − | − | − | − | − | + | − | − | + | − | − | + |
| 4277-H-A | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − |
| 4368-A | − | − | − | + | + | − | + | + | − | − | − | − |
| 4435-B | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − |
| 4592-A | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − |
| 4730-C | − | − | − | + | + | − | − | + | − | + | − | − |
| 4822-A | − | − | − | − | − | + | − | − | − | − | − | + |
| 4848-A-B | − | − | − | − | − | + | − | − | + | − | − | + |
| 4860-A | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − |
| 5019-A | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − |
| 5196-B | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − |
| 5583-H | − | − | − | + | + | − | − | − | − | + | − | − |
| 5687-B | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − |
| ATCC BAA-2196 | − | − | − | + | + | − | − | + | − | − | − | − |
| CVM10026 | − | − | − | + | + | + | − | + | − | + | − | − |
| CVM9942 | + | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − |
| CVM9952 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − |
| 2010C-4788 | − | − | − | − | − | + | − | − | − | − | − | − |
| 2011C-3274 | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | − |
a
+, present; −, absent.
b
The strains sequenced in this study are shown in boldface. Only strains that carried antimicrobial resistance genes are shown.
c
Aminoglycoside resistance.
d
Beta-lactamase resistance.
e
Phenicol resistance.
f
Sulfonamide resistance.
g
Tetracycline resistance.