TABLE 2.
Primers used in this study
| Primer | Sequence (forward primer)a |
|---|---|
| papCΔ2-11 | 5′-CGCAGCCAGTGCCGTTGACAAGAAAAATATTGACTTCACC-3′ |
| papCE2A | 5′-GCAGCCAGTGCCGTTGCGTTTAATACAGATGTAC-3′ |
| papCF3A | 5′-GCCAGTGCCGTTGAGGCTAATACAGATGTACTTGACGC-3′ |
| papCN4A | 5′-GCCAGTGCCGTTGAGTTTGCTACAGATGTACTTGACGCAGCGG-3′ |
| papCT5A | 5′-GCCGTTGAGTTTAATGCAGATGTACTTGACGCAGCG-3′ |
| papCD6A | 5′-GCCGTTGAGTTTAATACAGCTGTACTTGACGCAGCGG-3′ |
| papCV7A | 5′-GTTGAGTTTAATACAGATGCACTTGACGCAGCGGAC-3′ |
| papCL8A | 5′-CCGCAGGCCTGTGCGACATCAGATATG-3′ |
| papCD9A | 5′-GAGTTTAATACAGATGTACTTGCCGCAGCGGACAAG-3′ |
| papCC70A | 5′-GCCGCAGGCCGCTCTGACATCAGATATGGTCAG-3′ |
| papCC97A | 5′-CTGGCATGATGGTCAGGCTGCGGATTTTCATGGG-3′ |
| fimDΔ3-12 | 5′-CATCTGCCGACCTCCCCCAGGCTGTGGCC-3′ |
| papC10-fimD | 5′-CATCTGCCGACCTCGAGTTTAATACGGACGTTTTAGACGCTGCTCCCCAGGCTGTGGCC-3′ |
| papC25-fimD | 5′-GGTGCGTGGCGCCTACGCGACAATACCACC-3′ |
| papC180-fimD | 5′-GATTTATCGCGTTTTGAAAATGCCGGCGAATTACCGCCAGGGACG-3′ |
a
The reverse primer is the reverse complement of the forward primer.