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. Author manuscript; available in PMC: 2016 Dec 8.
Published in final edited form as: Nature. 2016 Jun 8;534(7607):412–416. doi: 10.1038/nature17962

Extended Data Table 2. Oligonucleotides used for plasmid construction.

Product Template Primer #1 Sequence (5〿〿3〿) Primer #2 Sequence (5〿〿3〿)
pHM453 Genomic DNA oHM319 AATAATGACGTCGGCAAATTGTTTGAATTTGTC oHM320 AATAATAGACGTCAGCCCGACACGCAGTTCATC
pHM492 Genomic DNA oHM313 AATAATGAATTCTTAATTATCTAACCAATTATAAAACGGCAC oHM315 AATAATCTCGAGCGCTTGGCAGCACCTGAGCAAACC
pHM560 Genomic DNA oHM510 AATAATGATATCTATAATGGTACCTATATAAGGCCTAGATTGTGACAACCATTG oHM511 AATATAAAGCTTAGAGGAAAGGTAGGATTAG
pTR54 pHM327 oTR36 CTTCTACCATTATCCGTTAGGAGGATAAAAATGAAATTCAC oTR37 GGATAATGGTAGAAGTAATAGTAGGGCCTGTGGATTTG
pTR72 pGS43 oTR156 CAGCTTAAATGAGATCCGGCTGCTAACAAAGCCCGAAAGG oTR157 CGGATCTCATTTAAGCTGTTCTTTAATTTCTTTTACATGC
pTR73 pTR72 oTR158 CATCATCATCATCATCACAGCGAAAATATATTAGACCTGTGGAACCAAGCCCTTGCTCAAATC oTR159 GCTGTGATGATGATGATGATGCATGGTATATCTCCTTCTTAAAGTTAAACAAAATTATTTC
pTR74 pTR102 oTR189 ATTCAAGGTCGCATGGAAAATATATTAGACCTGTGGAACCAAGCCCTTG oTR190 TTTCCATGCGACCTTGAATGCCGCTGCTGTGATGATGATGATGATGCATG
pTR83 pHM327 oTR82 CACAGTCTTCCTTGCTGTGGATAGGCTGTGTTTCCTGTCTTTTTC oTR83 ATCCACAGCAAGGAAGACTGTGTATGACTTCCGAAAAGTTATTC
pTR84 pHM328 oTR66 GCCCATGATAATGAAGATGATATTTTTATAAATATATATATTAATACATTATCCGTTAG oTR67 AAAATATCATCTTCATTATCATGGGCCTGTGGATTTGTGGATAAGTTG
pTR85 pHM327 oTR118 GAAAGGCAAGGAAGCTTTTCGGAAGTCATACACAGTCTGTC oTR119 AAAGCTTCCTTGCCTTTCCCCGATTGATCCCCGGTCCTG
pTR86 pHM327 oTR123 GAAGCTTCCTTGCGTCTGTCCACATGTGGATAGGCTGTGTTTCC oTR124 AGACGCAAGGAAGCTTCCGAAAAGTTATTCACACTTTCCCCGATTG
pTR87 pHM327 oTR125 ACAGCAAGGAAGGCTGTGTTTCCTGTCTTTTTCACAACTTATC oTR126 CAGCCTTCCTTGCTGTGGACAGACTGTGTATGACTTCCGAAAAG
pTR88 pHM327 oTR86 CCTGTCCTTCCTTGCACTTATCCACAAATCCACAGGCCCTACTATTAC oTR87 GGATAAGTGCAAGGAAGGACAGGAAACACAGCCTATCCAC
pTR89 pHM327 oTR88 TCACAACCTTCCTTGCAATCCACAGGCCCTACTATTACTTCTAC oTR89 GTGGATTGCAAGGAAGGTTGTGAAAAAGACAGGAAACACAGCCTATC
pTR90 pHM327 oTR090 CCACATTCCTTGCGGCCCTACTATTACTTCTAC oTR091 GGGCCGCAAGGAATGTGGATAAGTTGTGAAAAAGACAGGAAAC
pTR102 pTR73 oTR187 CAGCAGCGGCATTCGAAAATATATTAGACCTGTGGAACCAAGCCCTTG oTR188 TTTCGAATGCCGCTGCTGTGATGATGATGATGATGCATGGTATATC
pTR127 pHM327 oTR219 TTTGTGGATAAGGCCCTACTATTACTTCTAC oTR220 CCTTATCCACAAATCCACAGTTGTGAAAAAGAC
pTR146 pHM327 oTR247 CAGGCCCATGTATTACTTCTACTATTTTTTATAAATATATATATTAATAC oTR248 AATACATGGGCCTGTGGATTTGTGGATAAGTTGTG
pTR147 pHM327 oTR249 GCCCTACATATACTTCTACTATTTTTTATAAATATATATATTAATACATTATC oTR250 AGTATATGTAGGGCCTGTGGATTTGTGGATAAGTTGTG
pTR148 pHM327 oTR251 CCCTACTATATGTTCTACTATTTTTTATAAATATATATATTAATACATTATCCGTTAG oTR252 GAACATATAGTAGGGCCTGTGGATTTGTGGATAAGTTGTG
pTR149 pHM327 oTR254 AGTACTTGTAATAGTAGGGCCTGTGGATTTGTGGATAAG oTR263 CTACTATTACAAGTACTATTTTTTATAAATATATATATTAATACATTATCCGTTAGGAG
pTR150 pHM327 oTR255 TACTTCATGTATTTTTTATAAATATATATATTAATACATTATCCGTTAGGAG oTR256 AATACATGAAGTAATAGTAGGGCCTGTGGATTTGTG
pTR153 pHM327 oTR261 GATCAATCGGTATCCGTTAGGAGGATAAAAATGAAATTC oTR262 CTAACGGATACCGATTGATCCCCGGTCCTGCTATTTAAG
pTR168 pTR74 oTR299 GAATTCGCCTGCTCTATCCGAGATAATAAATGC oTR300 GAGCAGGCGAATTCGTTTGTAAATTTCTCAGAAG
pTR189 pHM327 oTR217 CAACTGTGGATAAAATCCACAGGCCCTACTATTACTTCTAC oTR218 GATTTTATCCACAGTTGTGAAAAAGACAGGAAACACAG
pTR208 pTR74 oTR384 TCAAGGTCGCATGAACAAAACAGAACTTATCAATG oTR385 CGGATCTTATTTTCCGGCAACTGCGTCTTTAAGC
pTR208 Genomic DNA oTR386 TTTTGTTCATGCGACCTTGAATGCCGCTGCTG oTR387 CGGAAAATAAGATCCGGCTGCTAACAAAGCCCGAAAG
pTR284 pHM327 oTR449 GGCCCAACTATTACTTCTACTATTTTTTATAAATATATATATTAATACATTATC oTR450 GTAATAGTTGGGCCTGTGGATTTGTGGATAAG
pTR285 pHM327 oTR451 GGCCCTTCTATTACTTCTACTATTTTTTATAAATATATATATTAATACATTATC oTR452 GTAATAGAAGGGCCTGTGGATTTGTGGATAAG
pTR286 pHM327 oTR453 GGCCCTAGTATTACTTCTACTATTTTTTATAAATATATATATTAATACATTATCCG oTR454 GTAATACTAGGGCCTGTGGATTTGTGGATAAG
pTR287 pHM327 oTR455 CCCTACAATTACTTCTACTATTTTTTATAAATATATATATTAATACATTATCCGTTAG oTR456 AGTAATTGTAGGGCCTGTGGATTTGTGG
pTR288 pHM327 oTR457 CCCTACTTTTACTTCTACTATTTTTTATAAATATATATATTAATACATTATCCGTTAG oTR458 GAAGTAAAAGTAGGGCCTGTGGATTTGTGGATAAG
pTR289 pHM327 oTR459 CCCTACTAATACTTCTACTATTTTTTATAAATATATATATTAATACATTATCCGTTAG oTR460 GTATTAGTAGGGCCTGTGGATTTGTGGATAAG
pTR301 pHM327 oTR469 CTTCTACTTTTTATAAATATATATATTAATACATTATCCGTTAGGAGGATAAAAATG oTR470 TATAAAAAGTAGAAGTAATAGTAGGGCCTGTGG
pTR302 pHM327 oTR471 TTACTTCTTTTTATAAATATATATATTAATACATTATCCGTTAGGAGGATAAAAATG oTR472 TATAAAAAGAAGTAATAGTAGGGCCTGTGGATTTG
pTR303 pHM327 oTR473 CTATTACTTTTTATAAATATATATATTAATACATTATCCGTTAGGAGGATAAAAATG oTR474 TATAAAAAGTAATAGTAGGGCCTGTGGATTTG
pTR304 pHM327 oTR475 CAGGCCCTACTATTTTTTATAAATATATATATTAATACATTATCCGTTAGGAG oTR476 AATAGTAGGGCCTGTGGATTTGTGGATAAG
pTR305 pHM327 oTR477 GCCCTACTTTTTATAAATATATATATTAATACATTATCCGTTAGGAGGATAAAAATG oTR478 TTATAAAAAGTAGGGCCTGTGGATTTGTG
pTR306 pHM327 oTR479 GGCCCTTTTTATAAATATATATATTAATACATTATCCGTTAGGAGGATAAAAATG oTR480 TATAAAAAGGGCCTGTGGATTTGTGG
pTR346 pHM327 oTR490 GGCCCACTATTACTTCTACTATTTTTTATAAATATATATATTAATAC oTR491 GAAGTAATAGTGGGCCTGTGGATTTGTGGATAAGTTG
pTR348 pHM327 oTR494 GGCCCTATTACTTCTACTATTTTTTATAAATATATATATTAATACATTATC oTR495 AGAAGTAATAGGGCCTGTGGATTTGTGGATAAGTTG
pTR349 pTR54 oTR496 ATTACTTCCATTATCCGTTAGGAGGATAAAAATGAAATTC oTR497 GATAATGGAAGTAATAGTAGGGCCTGTGGATTTG
pTR350 pTR54 oTR498 ACTATTACCATTATCCGTTAGGAGGATAAAAATG oTR499 GGATAATGGTAATAGTAGGGCCTGTGGATTTGTG
pTR377 pHM327 oTR539 GGCCCTATATTACTTCTACTATTTTTTATAAATATATATATTAATACATTATC oTR540 GTAATATAGGGCCTGTGGATTTGTG
pTR441 pHM327 oTR659 CCCTACATTACTTCTACTATTTTTTATAAATATATATATTAATACATTATC oTR660 GTAGAAGTAATGTAGGGCCTGTGGATTTGTG
pTR443 pHM327 oTR663 CCCTACTACTTCTACTATTTTTTATAAATATATATATTAATACATTATC oTR664 GTAGAAGTAGTAGGGCCTGTGGATTTGTG
pTR452 pHM326 oTR698 GGCCGTACTATTACTTCTACTATTTTTTATAAATATATATATTAATAC oTR699 GTAATAGTACGGCCTGTGGATTTGTGG
pTR453 pHM327 oTR700 AGGCCTACTATTACTTCTACTATTTTTTATAAATATATATATTAATAC oTR701 GTAATAGTAGGCCTGTGGATTTGTGG
pTR456 pHM327 oTR706 GCCCTCTATTACTTCTACTATTTTTTATAAATATATATATTAATACATTATC oTR707 AAGTAATAGAGGGCCTGTGGATTTGTG
pTR457 pHM327 oTR708 CCCTACTTTACTTCTACTATTTTTTATAAATATATATATTAATACATTATCC oTR709 GAAGTAAAGTAGGGCCTGTGGATTTG
pTR458 pHM327 oTR710 CCTACTATACTTCTACTATTTTTTATAAATATATATATTAATACATTATCC oTR711 TAGAAGTATAGTAGGGCCTGTGGATTTG
pTR475 pHM327 oTR795 CTACTATAACTTCTACTATTTTTTATAAATATATATATTAATACATTATCCGTTAG oTR796 TAGAAGTTATAGTAGGGCCTGTGGATTTGTG
pTR476 pHM327 oTR797 TACTATTTCTTCTACTATTTTTTATAAATATATATATTAATACATTATCCGTTAG oTR798 GTAGAAGAAATAGTAGGGCCTGTGGATTTGTG
pTR477 pHM327 oTR799 ACTATTAGTTCTACTATTTTTTATAAATATATATATTAATACATTATCCGTTAG oTR800 AGTAGAACTAATAGTAGGGCCTGTGGATTTGTG
pTR478 pHM327 oTR801 TACTATTCTTCTACTATTTTTTATAAATATATATATTAATACATTATCCGTTAG oTR802 GTAGAAGAATAGTAGGGCCTGTGGATTTGTG
pTR541 Genomic DNA oTR535 ATTACGCCAGCTAGTGCTTTTATTTCTTGCAACCATAATAG oTR536 ATTAATGCAGTTTTATCCTCCTAACGGATAATG
pTR541 pSG1301 oTR537 AAAGCACTAGCTGGCGTAATAGCGAAGAGG oTR538 GAGGATAAAACTGCATTAATGAATCGGCCAACG
pTR542 pTR84 oTR535 ATTACGCCAGCTAGTGCTTTTATTTCTTGCAACCATAATAG oTR536 ATTAATGCAGTTTTATCCTCCTAACGGATAATG
pTR542 pSG1301 oTR537 AAAGCACTAGCTGGCGTAATAGCGAAGAGG oTR538 GAGGATAAAACTGCATTAATGAATCGGCCAACG