Skip to main content
. 2016 Jun 8;4(6):apps.1500137. doi: 10.3732/apps.1500137

Table 2.

Recommended use of primers for different families, based on BLAST matches with no mismatches.a

Order Family Appropriate forward primer Appropriate reverse primer
Alismanthales Alismataceae matK-413f-2 matK-1227r-1, matK-1227r-3
Araceae matK-413f-2, matK-413f-5 matK-1227r-1
Apiales Araliaceae matK-413f-2, matK-413f-5 matK-1227r-1, matK-1227r-4
Apiaceae matK-413f-7 matK-1227r-1, matK-1227r-5
Aquifoliales Aquifoliaceae matK-413f-1 matK-1227r-1, matK-1227r-3
Cardiopteridaceae (Gonocaryum minus) matK-413f-1 matK-1227r-1, matK-1227r-3
Stemonuraceae matK-413f-1 matK-1227r-1, matK-1227r-3
Arecales Arecaceae (Arecaceae sp.) matK-413f-2 matK-1227r-1, matK-1227r-3
Asparagales Amaryllidaceae matK-413f-6 matK-1227r-1, matK-1227r-3
Asparagaceae matK-413f-6 matK-1227r-1, matK-1227r-4,
matK-1227r-5
Hyacinthaceae matK-413f-6 matK-1227r-1, matK-1227r-3
Iridaceae matK-413f-6 matK-1227r-1, matK-1227r-3,
matK-1227r-5
Orchidaceae (Polystachya humbertii) matK-413f-1, matK-413f-2, matK-1227r-1, matK-1227r-2,
matK-413f-3, matK-413f-6 matK-1227r-3
Tecophilaeaceae matK-413f-6 matK-1227r-1
Xanthorrhoeaceae matK-413f-6 matK-1227r-1, matK-1227r-5
Asterales Asteraceae (Leontodon hispidus) matK-413f-1 matK-1227r-1, matK-1227r-2,
matK-1227r-3, matK-1227r-4,
matK-1227r-5
Campanulaceae matK-413f-2 matK-1227r-1,matK-1227r-5
Goodeniaceae matK-413f-4 matK-1227r-1
Austrobaileyales Austrobaileyaceae matK-413f-2 matK-1227r-2
Schisandraceae matK-413f-2 matK-1227r-2
Trimeniaceae matK-413f-2 matK-1227r-2
Berberidopsidales Berberidopsidaceae matK-413f-1 matK-1227r-1
Boraginales Boraginaceae matK-413f-1, matK-413f-4 matK-1227r-1, matK-1227r-3,
matK-1227r-5
Ehretiaceae matK-413f-1 matK-1227r-1
Brassicales Brassicaceae matK-413f-1, matK-413f-4, matK-413f-6 matK-1227r-1, matK-1227r-5
Capparaceae matK-413f-1 matK-1227r-1
Caricaeae matK-413f-1 matK-1227r-1
Cleomaceae matK-413f-1, matK-413f-3, matK-1227r-1, matK-1227r-2,
matK-413f-4, matK-413f-7 matK-1227r-4, matK-1227r-5
Moringaceae matK-413f-1 matK-1227r-1, matK-1227r-5
Resedaceae matK-413f-1 matK-1227r-1
Bruniales Brunelliaceae matK-413f-1 matK-1227r-1
Buxales Bucaceae matK-413f-1 matK-1227r-1
Caryophyllales Amaranthaceae matK-413f-1 matK-1227r-1
Cactaceae matK-413f-1 matK-1227r-1
Polygonaceae matK-413f-1 matK-1227r-1, matK-1227r-2,
matK-1227r-5
Simmondsiaceae matK-413f-1 matK-1227r-3
Tamaricaceae matK-413f-1 matK-1227r-1
Celastrales Celastraceae matK-413f-1, matK-413f-4, matK-1227r-1, matK-1227r-2,
matK-413f-6 matK-1227r-3, matK-1227r-4,
matK-1227r-5
Lepidobotryaceae matK-413f-1 matK-1227r-5
Chloranthales Chloranthaceae matK-413f-2 matK-1227r-1, matK-1227r-5
Commelinales Commelinaceae matK-413f-2 matK-1227r-1
Haemodoraceae matK-413f-2 matK-1227r-1, matK-1227r-2,
matK-1227r-5
Cornales Cornaceae (Alangium cf. javanicum, Mastixia sp.) matK-413f-1, matK-413f-3 matK-1227r-1, matK-1227r-3,
matK-1227r-4, matK-1227r-5
Grubbiaceae matK-413f-1 matK-1227r-1
Hydrangeaceae matK-413f-1 matK-1227r-1, matK-1227r-4
Loasaceae matK-413f-1, matK-413f-7 matK-1227r-1, matK-1227r-4
Crossosomatales Stachyuraceae matK-413f-1 matK-1227r-1
Staphyleaceae matK-413f-1 matK-1227r-1, matK-1227r-5
Strasburgeriaceae matK-413f-1 matK-1227r-1
Cucurbitales Anisophylleaceae (Anisophyllea sp.) matK-413f-1, matK-413f-6 matK-1227r-1
Begoniaceae matK-413f-1, matK-413f-6 matK-1227r-1
Coriariaceae matK-413f-2 matK-1227r-1
Cucurbitaceae matK-413f-2 matK-1227r-1, matK-1227r-3,
matK-1227r-4, matK-1227r-5
Datiscaceae matK-413f-1 matK-1227r-1
Tetramelaceae matK-413f-1 matK-1227r-3, matK-1227r-5
Dipsacales Adoxaceae matK-413f-4 matK-1227r-1
Caprifoliaceae matK-413f-1, matK-413f-5 matK-1227r-1
Ericales Ebenaceae (Diospyros sp.) matK-413f-1 matK-1227r-1, matK-1227r-3,
matK-1227r-6
Ericaceae matK-413f-1, matK-413f-4 matK-1227r-1, matK-1227r-5
Lecythidaceae (Barringtonia curranii) matK-413f-5 matK-1227r-1
Pentaphylacaceae matK-413f-1 matK-1227r-1
Primulaceae (Ardisia sp.) matK-413f-1, matK-413f-2 matK-1227r-3, matK-1227r-1,
matK-1227r-5, matK-1227r-7
Styracaceae matK-413f-1 matK-1227r-1
Symplocaceae (Symplocos crassipes) matK-413f-1 matK-1227r-1
Theaceae matK-413f-1 matK-1227r-4
Escalloniales Escalloniaceae matK-413f-1 matK-1227r-1
Fabales Fabaceae (Fordia splendidissima) matK-413f-1, matK-413f-2, matK-1227r-1, matK-1227r-3,
matK-413f-4, matK-413f-6, matK-1227r-5
matK-413f-7
Polygalaceae (Xanthophyllum beccarianum) matK-413f-1, matK-413f-2 matK-1227r-1
Fagales Betulaceae matK-413f-2 matK-1227r-1
Casuarinaceae matK-413f-2 matK-1227r-1
Fagaceae (Lithocarpus sp.) matK-413f-2 matK-1227r-1, matK-1227r-3,
matK-1227r-5
Juglandaceae matK-413f-1 matK-1227r-1, matK-1227r-6
Garryales Garryaceae matK-413f-1 matK-1227r-1, matK-1227r-4,
matK-1227r-6
Gentianales Apocynaceae (Tabernaemontana sp.) matK-413f-1, matK-413f-3, matK-1227r-1, matK-1227r-2,
matK-413f-4, matK-413f-5, matK-1227r-6
matK-413f-6
Loganiaceae matK-413f-1 matK-1227r-1, matK-1227r-5
Rubiaceae (Urophyllum sp., Psychotria sp.) matK-413f-1, matK-413f-5 matK-1227r-1, matK-1227r-2
Geraniales Geraniaceae matK-413f-1, matK-413f-6 matK-1227r-1
Melianthaceae matK-413f-1, matK-413f-6 matK-1227r-1
Gunnerales Gunneraceae matK-413f-1, matK-413f-2 matK-1227r-1
Huerteales Dipentodontaceae matK-413f-1 matK-1227r-1
Gerrardinaceae matK-413f-1 matK-1227r-1
Tapisciaceae matK-413f-1 matK-1227r-1, matK-1227r-5
Icacinales Icacinaceae matK-413f-1 matK-1227r-1, matK-1227r-3
Lamiales Acanthaceae matK-413f-1 matK-1227r-1, matK-1227r-2,
matK-1227r-4, matK-1227r-5
Gesneriaceae matK-413f-1 matK-1227r-1, matK-1227r-2,
matK-1227r-5
Lamiaceae (Teijsmanniodendron sp.) matK-413f-1 matK-1227r-1, matK-1227r-2,
matK-1227r-5
Lentibulariaceae matK-413f-1 matK-1227r-1
Myrsinaceae matK-413f-1 matK-1227r-1
Oleaceae matK-413f-1 matK-1227r-1, matK-1227r-2,
matK-1227r-3, matK-1227r-4
Orobanchaceae matK-413f-1 matK-1227r-1, matK-1227r-3,
matK-1227r-4
Laurales Hernandiaceae matK-413f-2 matK-1227r-1
Lauraceae (Litsea sarawacensis) matK-413f-2 matK-1227r-1, matK-1227r-3
Siparunaceae matK-413f-2 matK-1227r-3
Liliales Smilacaceae matK-413f-2 matK-1227r-1, matK-1227r-5
Magnoliales Annonaceae matK-413f-2 matK-1227r-1, matK-1227r-4,
matK-1227r-5
Degeneriaceae matK-413f-2 matK-1227r-1
Eupomatiaceae matK-413f-2 matK-1227r-1
Himantandraceae matK-413f-2 matK-1227r-1
Magnoliaceae (Magnolia sp.) matK-413f-2, matK-413f-6 matK-1227r-1
Myristicaceae matK-413f-2, matK-413f-4 matK-1227r-1, matK-1227r-5
Malpighiales Clusiaceae (Garcinia sp.) matK-413f-1 matK-1227r-1, matK-1227r-3,
matK-1227r-4, matK-1227r-5
Euphorbiaceae matK-413f-1 matK-1227r-1, matK-1227r-3,
(Antidesma sp., Drypetes sp., Koilodepas sp., Macaranga hosei, Mallotus sp.) matK-1227r-4, matK-1227r-5
Linaceae matK-413f-1 matK-1227r-1
Passifloraceae matK-413f-1 matK-1227r-1
Phyllanthaceae matK-413f-1, matK-413f-2, matK-1227r-1
matK-413f-7
Putranjivaceae matK-413f-1 matK-1227r-5 Rhizophoraceae
matK-413f-5 matK-1227r-1, matK-1227r-3 Salicaceae
matK-413f-1 matK-1227r-1, matK-1227r-5 Violaceae (Rinorea sp.)
matK-413f-1 matK-1227r-1, matK-1227r-6 Malvales
Elaeocarpaceae matK-413f-1
matK-1227r-1 Malvaceae (Durio griffithii, Leptonychia sp., Sterculia sp.) matK-413f-1 matK-1227r-1
Myrtales Lythraceae matK-413f-1, matK-413f-5 matK-1227r-1, matK-1227r-3
Melastomataceae matK-413f-7 matK-1227r-1, matK-1227r-4
Myrtaceae (Syzygium sp.) matK-413f-1, matL-413f-4, matK-1227r-1, matK-1227r-3,
matK-413f-6 matK-1227r-4, matK-1227r-5
Onagraceae matK-413f-3 matK-1227r-1
Oxalidales Brunelliaceae matK-413f-1
Cunoniaceae matK-413f-1 matK-1227r-1
Huaceae matK-413f-6 matK-1227r-1
Pandanales Cyclanthaceae matK-413f-2 matK-1227r-1
Pandanaceae matK-413f-2 matK-1227r-1
Paracryphiales Paracryphiaceae matK-413f-1 matK-1227r-1
Piperales Aristolochiaceae matK-413f-2 matK-1227r-1, matK-1227r-5
Piperaceae matK-413f-2 matK-1227r-3
Saururaceae matK-413f-2 matK-1227r-1
Poales Bromeliaceae (Tillandsia cf. caloura) matK-413f-2, matK-413f-6 matK-1227r-1, matK-1227r-3
Typhaceae matK-413f-2 matK-1227r-1, matK-1227r-3
Proteales Nelumbonaceae matK-413f-1 matK-1227r-1
Platanaceae matK-413f-1 matK-1227r-1
Proteaceae matK-413f-1, matK-413f-2, matK-1227r-1, matK-1227r-3,
matK-413f-3 matK-1227r-4, matK-1227r-5
Ranunculales Berberidaceae matK-413f-3 matK-1227r-1
Eupteleaceae matK-413f-1, matK-413f-2 matK-1227r-1
Lardizabalaceae matK-413f-1 matK-1227r-1, matK-1227r-5
Papaveraceae matK-413f-1, matK-413f-2, matK-1227r-1, matK-1227r-3,
matK-413f-3, matK-413f-5 matK-1227r-5
Ranunculaceae matK-413f-4 matK-1227r-1, matK-1227r-6,
matK-1227r-4, matK-1227r-5
Rosales Cannabaceae (Gironniera nervosa) matK-413f-1, matK-413f-3 matK-1227r-1, matK-1227r-3
Moraceae (Artocarpus elasticus) matK-413f-1 matK-1227r-3
Rhamnaceae (Ziziphus angustifolius) matK-413f-1, matK-413f-7 matK-1227r-1, matK-1227r-3
Rosaceae matK-413f-1, matK-413f-2, matK-1227r-1, matK-1227r-3,
matK-413f-6 matK-1227r-4, matK-1227r-5
Ulmaceae matK-413f-1 matK-1227r-3
Urticaceae matK-413f-1 matK-1227r-3
Sabilales Sabiaceae (Meliosma sumatrana) matK-413f-1, matK-413f-2 matK-1227r-1, matK-1227r-4
Santalales Loranthaceae matK-413f-4 matK-1227r-1, matK-1227r-4
Opiliaceae matK-413f-1, matK-413f-2 matK-1227r-1
Santalaceae matK-413f-1, matK-413f-2 matK-1227r-1, matK-1227r-5
Schoepfiaceae matK-413f-1 matK-1227r-1, matK-1227r-4
Sapindales Meliaceae (Aglaia sp.) matK-413f-1, matK-413f-7 matK-1227r-1, matK-1227r-5
Rutaceae (Glycosmis macrantha) matK-413f-1 matK-1227r-1, matK-1227r-6,
matK-1227r-5
Sapindaceae (Lepisanthes sp.) matK-413f-4 matK-1227r-1, matK-1227r-3,
matK-1227r-5
Saxifragales Cercidiphyllaceae matK-413f-1, matK-413f-7 matK-1227r-1
Haloragaceae matK-413f-1 matK-1227r-1
Hamamelidaceae matK-413f-1, matK-413f-5 matK-1227r-1
Paeoniaceae matK-413f-1 matK-1227r-1
Saxifragaceae matK-413f-1, matK-413f-4, matK-1227r-1
matK-413f-5
Solanales Montiniaceae matK-413f-1 matK-1227r-1
Solanaceae matK-413f-1, matK-413f-3 matK-1227r-3
Trochodendrales Trochodendraceae matK-413f-1, matK-413f-6 matK-1227r-1
Vitales Vitaceae matK-413f-1 matK-1227r-1, matk-1227r-2,
matK-1227r-5
a

Species/genera in parentheses were successfully amplified in the family using the primer cocktail C_MATK_F/C_MATK_R.