Skip to main content
. 2016 Jun 28;7:1008. doi: 10.3389/fmicb.2016.01008

Table 4.

List of strains carrying the TnSha1 element on the chromosome.

Species GenBank ID Strain name Insertion MLST
site
S. argenteus CCEM01000001 Sa_LBSA043 M
S. aureus AIDT01000009 DR10 H 398
S. aureus AUPV01000018 S100 H 398
S. aureus CAVU010000033 S1805 E 80
S. aureus CAWA010000053 S2396 E 1
S. aureus CFPN01000018 USFL079 L 8
S. aureus CGGX01000004 USFL145 A 8
S. aureus CIAK01000002 USFL234 J 8
S. aureus CIGG01000001 USFL129 C 8
S. aureus CP003045 71193 H 398
S. aureus CSDA01000011 USFL101 L 8
S. aureus CSDP01000002 USFL046 J 8
S. aureus CSEJ01000001 USFL123 C 8
S. aureus CSEV01000003 USFL189 A2 828
S. aureus CSFL01000012 USFL078 L 8
S. aureus CSHX01000003 USFL190 A2 828
S. aureus CSJZ01000023 USFL050 nd 8 slv*
S. aureus CTWU01000023 M705 K 239
S. aureus CTWW01000088 H211 K 239
S. aureus CTXO01000001 M1229 K 239
S. aureus CTXZ01000061 H216 K 239
S. aureus CTYD01000081 H202 K 239
S. aureus CVOP01000018 SH3 M 630
S. aureus CVOU01000018 SH1 M 630
S. aureus CVRW01000028 M170 K 239
S. aureus JBFG01000011 KINW6058 I 5
S. aureus JBGB01000006 FVRH6130 nd 8
S. aureus JBGS01000014 GGMC6026 I 5
S. aureus JBLE01000006 SCOA6048 H 8
S. aureus JBMX01000012 SCOA6012 H 8
S. aureus JDLS01000019 T78544 I 5
S. aureus JDOK01000060 F35307 nd 5
S. aureus JDOU01000017 H27862 I 5
S. aureus JDOV01000017 H27872 I 5
S. aureus JDPI01000020 H67656 I 5
S. aureus JECS01000014 T34011 I 5
S. aureus JEDV01000017 H64967 I 5
S. aureus JETJ01000039 T22051 nd 5
S. aureus JGNE01000030 W41757 nd 5
S. aureus JHTT01000046 CO-86 L 8
S. aureus JIXI01000011 PA57 H 398
S. aureus JIYX01000004 C5086 H 398 slv
S. aureus JJDE01000001 122 H 398
S. aureus JURB01000090 84_SAUR F 5
S. aureus JUTG01000033 78_SAUR F 5
S. aureus JVUC01000150 1315_SAUR nd 15
S. aureus JZAL01000002 LHSKBClinical C 8
S. aureus LAMP01000014 99-06 L 8
S. aureus LAMS01000038 99-48 L 8
S. epidermidis ACHE01000003 BCM-HMP0060 59
S. epidermidis AGUC01000094 14.1.R1.SE
S. epidermidis AHLC01000060 VCU120 22
S. epidermidis AHLF01000017 VCU125 384
S. epidermidis AKGM01000041 NIHLM067 333
S. epidermidis AKGN01000056 NIHLM061 332
S. epidermidis AKGW01000049 NIHLM020 7
S. epidermidis APHT01000038 528m 2
S. epidermidis APHU01000037 41tr 2
S. epidermidis ARWU01000031 UC7032 595
S. epidermidis JUMV01000141 938_SEPI 59
S. epidermidis JUNI01000550 926_SEPI 59
S. epidermidis JUVK01000069 73_SEPI 16
S. epidermidis JUYJ01000034 655_SEPI 59
S. epidermidis JUYK01000190 654_SEPI 59
S. epidermidis JVQK01000079 196_SEPI 59
S. epidermidis JVSC01000077 154_SEPI 59
S. epidermidis JVSC01000077 154_SEPI 59
S. epidermidis JVSZ01000046 134_SEPI 59
S. epidermidis JVTV01000122 1321_SEPI 59
S. epidermidis JWBR01000039 114_SEPI
S. epidermidis JWCR01000091 1115_SEPI 88
S. epidermidis JWEH01000024 1063_SEPI 2
S. epidermidis JWFU01000070 1024_SEPI 2
S. epidermidis JWFV01000104 1023_SEPI 2
S. epidermidis JZUK01000044 NGS-ED-1107 2
S. epidermidis JZUL01000024 NGS-ED-1109 439
S. haemolyticus CP011116 Sh29/312/L2
S. haemolyticus CUEZ01000014 CN1197
S. saprophyticus JXBG01000015 SU8
S. warneri CANQ01000015 A487
S. warneri JPOW01000002 NGS-ED-1001
*

slv = single locus variant; targets A–G from our genome sequences; targets H–Z from Genbank, nd not determined.