Skip to main content
. 2016 Jun 28;7:1008. doi: 10.3389/fmicb.2016.01008

Table 6.

Sh-fabI nucleotide sequence of 89 TnSha1 and TnSha2 elements.

Species Strain Polymorphic sites in sh-fabI* Phenotype** Comment
1 5 5 5 6
8 0 7 7 9 1
1 6 7 8 3 1
S. haemolyticus JCSC1435 T G A T C T S Reference strain***
S. haemolyticus 0281 . . . . . . S Triclosan susceptible clinical isolate***
S. aureus T22051 . . . . . . S wt sequence
S. aureus KINW6058 C . T . . . R GTA81GCA V27A; ATT577TTT I193F
S. epidermidis 354_SEPI . A . . . C R GTT106ATT V36I; TC611TCC F204S
S. epidermidis 422.rep1_SEPI . A . . . C R GTT106ATT V36I; TC611TCC F204S
S. epidermidis 422.rep2_SEPI . A . . . C R GTT106ATT V36I; TC611TCC F204S
S. epidermidis 493_SEPI . A . . . C R GTT106ATT V36I; TC611TCC F204S
S. epidermidis 568_SEPI . A . . . C R GTT106ATT V36I; TC611TCC F204S
S. epidermidis 623_SEPI . A . . . C R GTT106ATT V36I; TC611TCC F204S
S. epidermidis 634_SEPI . A . . . C R GTT106ATT V36I; TC611TCC F204S
S. epidermidis 656_SEPI . A . . . C R GTT106ATT V36I; TC611TCC F204S
S. epidermidis 749_SEPI . A . . . C R GTT106ATT V36I; TC611TCC F204S
S. epidermidis 890_SEPI . A . . . C R GTT106ATT V36I; TC611TCC F204S
S. epidermidis 1013_SEPI . A . . . C R GTT106ATT V36I; TC611TCC F204S
S. epidermidis 1021.rep2_SEPI . A . . . C R GTT106ATT V36I; TC611TCC F204S
S. epidermidis 1022_SEPI . A . . . C R GTT106ATT V36I; TC611TCC F204S
S. epidermidis 1088_SEPI . A . . . C R GTT106ATT V36I; TC611TCC F204S
S. epidermidis 1143_SEPI . A . . . C R GTT106ATT V36I; TC611TCC F204S
S. aureus F12753 . . T . . . ATT577TTT I193F
S. aureus F70077 . . T . . . ATT577TTT I193F
S. aureus GGMC6026 . . T . . . ATT577TTT I193F
S. aureus H27862 . . T . . . ATT577TTT I193F
S. aureus H27872 . . T . . . ATT577TTT I193F
S. aureus H64967 . . T . . . ATT577TTT I193F
S. aureus H67656 . . T . . . ATT577TTT I193F
S. aureus pHMPREF1625_3 . . T . . . ATT577TTT I193F
S. aureus pVR_MSSA_01 . . T . . . ATT577TTT I193F
S. aureus QBR-102278-1619 . . T . . . ATT577TTT I193F
S. aureus T34011 . . T . . . ATT577TTT I193F
S. aureus T78544 . . T . . . ATT577TTT I193F
S. aureus USFL050 . . T . . . ATT577TTT I193F
S. aureus USFL145 . . T . . . ATT577TTT I193F
S. epidermidis 134_SEPI . . T . . . ATT577TTT I193F
S. epidermidis 154_SEPI . . T . . . ATT577TTT I193F
S. epidermidis 196_SEPI . . T . . . ATT577TTT I193F
S. epidermidis SAP110A . . T . . . ATT577TTT I193F
S. aureus F77919 . . . A . . ATT578AAT I193N
S. aureus LPIH6008 . . . A . . ATT578AAT I193N
S. aureus W21479 . . . A . . ATT578AAT I193N
S. aureus QBR-102278-1203 . . . . G . R GCT593GGT A198G
S. aureus S1805 . . . . G . R GCT593GGT A198G
S. aureus S2396 . . . . G . R GCT593GGT A198G
S. argenteus pST75 . . . . . G R TTC611TGC F204C
S. argenteus Sa_LBSA043 . . . . . G R TTC611TGC F204C
S. aureus 122 . . . . . G R TTC611TGC F204C
S. aureus 1299_SAUR . . . . . G R TTC611TGC F204C
S. aureus 1315_SAUR . . . . . G R TTC611TGC F204C
S. aureus 71193 . . . . . G R TTC611TGC F204C
S. aureus 78_SAUR . . . . . G R TTC611TGC F204C
S. aureus 84_SAUR . . . . . G R TTC611TGC F204C
S. aureus C5086 . . . . . G R TTC611TGC F204C
S. aureus CO-86 . . . . . G R TTC611TGC F204C
S. aureus H202 . . . . . G R TTC611TGC F204C
S. aureus H216 . . . . . G R TTC611TGC F204C
S. aureus LHSKBClinical . . . . . G R TTC611TGC F204C
S. aureus M1229 . . . . . G R TTC611TGC F204C
S. aureus QBR-102278-1091 . . . . . G R TTC611TGC F204C
S. aureus QBR-102278-1107 . . . . . G R TTC611TGC F204C
S. aureus QBR-102278-2210 . . . . . G R TTC611TGC F204C
S. aureus QBR-102278-2365 . . . . . G R TTC611TGC F204C
S. aureus QBR-102278-2376 . . . . . G R TTC611TGC F204C
S. aureus SH1 . . . . . G R TTC611TGC F204C
S. aureus SH3 . . . . . G R TTC611TGC F204C
S. aureus USA300_2014.C02 . . . . . G R TTC611TGC F204C
S. aureus USFL046 . . . . . G R TTC611TGC F204C
S. aureus USFL123 . . . . . G R TTC611TGC F204C
S. aureus USFL129 . . . . . G R TTC611TGC F204C
S. aureus USFL234 . . . . . G R TTC611TGC F204C
S. epidermidis 1249_SEPI . . . . . G R TTC611TGC F204C
S. epidermidis 14.1.R1.SE . . . . . G R TTC611TGC F204C
S. epidermidis NIHLM020 . . . . . G R TTC611TGC F204C
S. haemolyticus Sh29/312/L2 . . . . . G R TTC611TGC F204C
S. aureus QBR-102278-2092 . . . . . C R TTC611TCC F204S
S. aureus QBR-102278-2351 . . . . . C R TTC611TCC F204S
S. aureus QBR-102278-2605 . . . . . C R TTC611TCC F204S
S. aureus M0277 . . . . . C R TTC611TCC F204S
S. aureus USFL189 . . . . . C R TTC611TCC F204S
S. aureus USFL190 . . . . . C R TTC611TCC F204S
S. aureus W41757 . . . . . C R TTC611TCC F204S
S. epidermidis 1026_SEPI . . . . . C R TTC611TCC F204S
S. haemolyticus 25-38 . . . . . C R TTC611TCC F204S
S. haemolyticus 25-60 . . . . . C R TTC611TCC F204S
S. haemolyticus 51-11 . . . . . C R TTC611TCC F204S
S. haemolyticus 51-13 . . . . . C R TTC611TCC F204S
S. haemolyticus 51-43 . . . . . C R TTC611TCC F204S
S. haemolyticus 51-41 . . . . . C R TTC611TCC F204S
S. haemolyticus 113101 . . . . . C R TTC611TCC F204S
S. haemolyticus 127925 . . . . . C R TTC611TCC F204S
S. warneri NGS-ED-1001 . . . . . C R TTC611TCC F204S
*

Polymorphic sites are indicated with respect to the sh-fabI sequence of S. haemolyticus strain JCSC1435.

**

Phenotype as defined in references: (Ciusa et al., 2012; Grandgirard et al., 2015).

***

These wt S. haemolyticus strains do not carry the TnSha1 element, therefore the fabI sequence reported is the one of the core genome.