Skip to main content
. 2016 Jun 29;10(6):e0004790. doi: 10.1371/journal.pntd.0004790

Table 1. Genotyping analysis with 15 microsatellite markers of 3 reference type I, II, and III strains, the HTI01 strain isolated in the present study, and 43 strains collected in human cases of toxoplasmosis from South America and the Caribbean region by the French national reference center for toxoplasmosis.

Microsatellite markers
Isolate Year BRCa code Data TUB2 W35 TgM-A B18 B17 M33 MIV.1 MXI.1 M48 M102 N60 N82 AA N61 N83
GT1 1980 TgA00004 REF I 291 248 209 160 342 169 274 358 209 168 145 119 265 087 306
ME49 1965 TgA00001 REF II 289 242 207 158 336 169 274 356 215 174 142 111 265 091 310
VEG 1988 TgH00005 REF III 289 242 205 160 336 165 278 356 213 188 153 111 267 089 312
HTI01 2009 TgH40001 TIb 289 242 207 162 336 169 274 356 237 166 142 111 281 093 312
AMZ01 2003 TgH18005 AMZTc 289 242 203 160 344 165 276 356 211 168 142 109 271 087 320
AMZ02 2002 TgH18002 AMZT 289 246 203 160 337 165 274 356 209 172 136 111 251 109 310
AMZ03 2001 TgH18001 AMZT 289 246 203 160 344 167 272 356 229 176 142 113 263 085 312
AMZ04 2004 TgH18009 AMZT 291 242 203 160 338 167 274 356 209 188 138 115 263 091 312
AMZ05 2002 TgH18003 AMZT 291 242 203 160 339 165 272 358 221 174 138 107 277 095 312
AMZ06 2004 TgH18013 AMZT 291 242 203 160 346 167 272 356 217 170 147 127 257 085 310
AMZ07 1997 TgH00009 AMZT 291 242 203 162 344 167 276 356 217 170 142 113 277 091 308
AMZ08 2011 TgH18051 AMZT 291 242 205 160 340 165 276 356 211 176 138 105 269 087 316
AMZ09 2010 TgH42001 AMZT 291 246 203 158 346 169 272 356 229 172 142 105 261 105 316
AMZ10 2007 TgH18028 AMZT 291 246 203 160 326 167 276 356 211 178 147 111 259 087 306
AMZ11 2009 TgH18039 AMZT 291 246 203 160 342 171 274 356 213 172 149 105 273 089 318
AMZ12 2012 TgH19006 AMZT 293 246 203 162 344 171 272 356 211 182 138 105 267 091 302
AMZ13 2012 TgH19008 AMZT 291 246 203 160 334 167 274 356 209 174 142 109 201 085 306
AMZ14 2003 TgH18004 AMZT 291 246 205 166 338 165 274 356 213 172 138 119 259 083 312
AMZ15 2011 TgH18048 AMZT 293 242 203 162 344 167 274 358 217 176 138 115 273 085 316
AMZ16 2003 TgH18007 AMZT 289 242 203 158 344 171 272 356 209 182 149 121 265 089 317
AMZ17 2004 TgH18008 AMZT 289 246 203 158 338 167 276 354 213 168 138 111 281 093 318
AMZ18 2006 TgH18021 AMZT 291 246 205 166 334 167 272 356 213 174 151 107 267 087 325
BRA01 2009 TgH23028 CTd 289 242 205 160 342 165 278 358 233 164 145 111 316 089 308
BRA02 2000 TgH24001 CT 289 242 205 160 342 165 278 358 237 164 145 111 316 089 308
BRA03 2012 TgH14011 CT 289 242 205 162 334 169 272 356 227 164 142 117 334 087 308
BRA04 2014 TgH34032 TI 289 242 205 162 344 165 278 358 223 164 142 111 263 105 312
BRA05 2005 TgH25010 CT 289 242 205 162 344 165 278 358 225 164 142 111 263 111 312
BRA06 2009 TgH23018 TI 289 242 205 162 344 165 278 358 225 164 142 111 269 089 312
BRA07 2011 TgH13117 TI 289 242 205 162 344 165 278 358 227 164 142 111 263 119 312
BRA08 1994 TgH32005 CT 291 242 205 160 362 165 278 356 225 174 140 111 265 091 314
BRA09 2006 TgH32069 CT 291 242 205 162 362 165 278 356 223 166 151 111 263 093 337
BRA10 1991 TgH00006 CT 291 242 205 162 362 169 272 358 221 166 142 111 332 095 339
GLP01 2010 TgH40002 CT 291 242 205 162 336 165 278 356 211 164 147 109 277 087 312
GLP02 1992 TONT CT 289 242 205 162 336 165 278 356 213 164 142 111 279 087 312
GLP03 2009 TgH29086 TI 291 242 205 162 342 165 278 356 211 164 142 109 277 087 312
GLP04 2002 TgH29005 TI 291 242 205 162 342 165 278 356 211 164 142 109 277 087 312
GLP05 2005 TgH13006 TI 291 242 205 162 342 165 278 356 213 164 142 109 277 087 312
GUF01 2002 TgH20001 CT 291 242 205 162 336 165 278 356 213 164 142 109 267 089 312
GUF02 2004 TgH13013 TI 289 242 205 162 336 165 278 356 229 164 147 111 261 089 312
GUF03 2014 TgH18057 CT 291 248 209 160 342 165 278 354 209 166 140 113 277 095 304
GUF04 2014 TgH19010 CT 289 242 205 160 336 165 278 356 209 190 147 111 265 089 312
GUF05 2007 TgH18022 NRe 289 248 209 160 336 165 278 356 209 166 149 121 271 087 306
MTQ01 2007 TgH16001 TI 289 242 207 158 336 169 274 356 213 174 147 119 271 089 335
MTQ02 2007 TgH16003 TI 291 242 205 162 342 165 278 356 211 164 142 109 277 087 312
MTQ03 2010 TgH16004 CT 289 244 207 158 336 169 274 356 211 176 140 113 259 101 310
MTQ04 2013 TgH16008 CT 291 242 205 162 336 165 278 356 213 164 142 111 277 087 312
MTQ05 2013 TgH16010 CT 291 242 205 162 336 165 278 356 213 164 142 111 283 085 312

aBRC, Toxoplasma Biological Resource Center.

bTI, toxoplasmosis in patient with immunosuppression.

cAMZT, Amazonian toxoplasmosis.

dCT, congenital toxoplasmosis.

eNR, not reported.