Table 3. Estimation of likelihood ratios of gene families related to sugar metabolism and transport using the M3 and M3 + S1 Models in Fitmodel.

		Gene family/subfamily
Model Parameter		SUT1	SUT2	SUT4	VGT	STP	TMT	PMT	INT	pGlcT	ERD6-like	HK	NI	SUSY	SPS
M3	-In L	14922.22	24210.88	7853.05	23354.78	15805.81	61719.92	51067.07	31257.70	19149.30	16142.70	63731.74	66066.34	73873.57	84870.00
	p1	0.38	0.21	0.20	0.37	0.46	0.15	0.17	0.03	0.06	0.44	0.32	0.08	0.15	0.14
	p2	0.39	0.49	0.60	0.35	0.35	0.50	0.48	0.63	0.67	0.39	0.35	0.47	0.37	0.46
	p3	0.23	0.30	0.21	0.28	0.18	0.35	0.35	0.34	0.27	0.17	0.33	0.46	0.48	0.40
	ω1	0.02	0.14	0.14	0.02	0.01	0.12	0.07	0.23	0.35	0.01	0.22	0.31	0.06	0.06
	ω2	0.27	0.77	2.74	0.24	0.14	0.83	0.47	1.97	1.98	0.15	0.16	1.41	0.50	0.52
	ω3	0.95	2.14	20.00	0.95	1.57	1.77	1.22	4.38	5.28	0.56	0.42	3.38	0.70	0.79
M3 + S1	-In L	14891.35	24166.60	7857.14	23250.22	15728.80	61624.07	50952.59	31239.20	19145.40	16035.70	63271.47	65900.66	73744.10	84666.08
	p1	0.44	0.20	0.20	0.50	0.58	0.18	0.22	0.05	0.06	0.60	0.41	0.09	0.20	0.20
	p2	0.34	0.50	0.60	0.35	0.31	0.53	0.52	0.67	0.67	0.36	0.34	0.52	0.35	0.48
	p3	0.23	0.30	0.20	0.15	0.10	0.28	0.26	0.28	0.27	0.29	0.25	0.39	0.45	0.32
	ω1	0.00	0.02	0.12	0.01	0.00	0.03	0.03	0.12	0.18	0.00	0.00	0.06	0.03	0.01
	ω2	0.28	0.72	2.76	0.39	0.24	0.87	0.53	2.03	1.94	0.02	0.16	1.35	0.51	0.55
	ω3	1.13	2.32	20.00	1.78	1.80	2.08	1.61	5.40	5.66	2.02	0.64	4.14	0.95	0.98