. Author manuscript; available in PMC: 2016 Jul 25.

Published in final edited form as: Methods Enzymol. 2015 Sep 11;563:623–642. doi: 10.1016/bs.mie.2015.07.030

Table 1.

pdb	Rotamers in crystal structure	SS predicted
*T4 lysozyme*
82-1zyt	*MMP*P	*MMP*,MPP,MTP
131-2cuu-a	*TPP*	MMP,*TPP*
131-3g3v-a	TP	MMP,TPP
151-3g3w	MM	TTP,MTP,MMP,TPP,TTM
151-3g3x	*MMP*	*MMP*,MTP,TPP
115-2igc	MMMPP	MMP,MTP
membrane proteins
177-3mpn	MM	MMP,MTP,TPP,TTP
55-2xiu-A	*MMM*MT	*MMM*,MMP,MTP
19-2xga-A	*MMP*MM	*MMP*,MMM,MTP
156-3rgm	TMMMT	TTP,TTM