Table 3.

Multiplex PCR based fingerprints of vancomycin-resistance and multiple-virulence-markers in E. faecalis isolates from river Gomti

E. faecalis isolates	Target genes
	Housekeeping gene	Antimicrobial resistance and Virulence genes
	sodA (E. faecalis)	vanB	gelE	ace	efaA	Esp
E. faecalis ATCC 51299 (ATCC, USA) (positive control)	+	+	+P	+	+	+
Site #1
2E	+	−	+	−	+	+
AE	+	−	+P	−	+	+
BE	+	−	+P	+	+	+
FE	+	+	+	−	+	+
GE	+	+	+P	−	+	+
Site #2
4E	+	+	+P	+	+	+
HE	+	+	+P	−	+	+
CE	+	+	+P	+	+	+
G2A	+	−	+P	−	+	+
G2B	+	−	+	+	+	+
Site #3
9E	+	−	+P	−	+	+
IE	+	−	+	−	+	+
16E	+	−	+P	+	+	+
G3A	+	−	+P	+	+	+
G3B	+	−	+P	+	+	+
G3C	+	−	+	−	+	+
G3D	+	−	+	−	+	+
Site #4
11E	+	−	+P	+	+	+
17E	+	−	+	+	+	+
18E	+	+	+P	+	+	+
19E	+	−	+P	−	+	+
20E	+	+	+P	−	−	+
G4A	+	−	+	+	+	+
G4B	+	−	+	+	+	+
Site #5
15E	+	−	+P	−	+	+
21E	+	−	+	+	+	+
22E	+	+	+P	−	+	+
23E	+	+	+P	+	+	+
24E	+	−	+	+	+	+
G5A	+	−	+P	+	+	+
G5B	+	−	+P	+	+	+
G6A	+	−	+	+	+	+
G6B	+	−	+P	+	+	+

ATCC American Type Culture Collection, USA

+P denotes E. faecalis isolates exhibiting gelatinase phenotype