Table 1.
Species | Culture/strain code | NCBI GenBank accession No.a | |
---|---|---|---|
ITS | tef1 | ||
Locationb A | |||
T. atroviride | AN497 | JX184119 | JX184096 |
T. citrinoviride | AN393 c, AN490, AN710 | JX184109 | JX184086 |
T. cremeum | AN392 | JX184117 | JX184094 |
T. harzianum complex: (T. harzianum) | AN394 | JX184113 | JX184090 |
T. longibrachiatum | AN488 | JX184118 | JX184095 |
T. koningii | AN398, AN399 | JX184126 | JX184106 |
T. paraviridescens | AN387, AN405, AN492, AN494, AN709 | JX184127 | JX184103 |
T. trixiae | AN388 | JX184128 | JX184104 |
T. viride | AN397, AN402, AN493, AN496 | JX184121 | JX184098 |
AN389, AN395, AN401 | JX184122 | JX184099 | |
AN390, AN487 | JX184123 | JX184101 | |
Location B | |||
T. citrinoviride | AN499, AN500 | JX184109 | JX184086 |
T. atroviride | AN240 | JX184119 | JX184096 |
T. koningiopsis | AN251 | HQ292939 | HQ292993 |
T. viridescens complex: (T. paraviridescens) | AN241, AN243, AN245, AN609 | JX184127 | JX184103 |
(T. trixiae) | AN248 | JX184128 | JX184104 |
(T. viridarium) | AN605 | JX184125 | JX184102 |
T. viride | AN242, AN250, AN255, AN604 | JX184121 | JX184098 |
AN244, AN249, AN810, AN813, AN826 | JX184122 | JX184099 | |
AN247, AN252, AN253, AN802, AN806, AN814, AN827 | JX184123 | JX184101 | |
Location C | |||
T. atroviride | AN705 | JX184119 | JX184097 |
T. citrinoviride | AN303b, AN477 | JX184109 | JX184086 |
T. gamsii | AN327, AN385 | JX184130 | JX184107 |
T. harzianum complex: (T. harzianum) | AN312, AN360, AN367,AN369, AN373, AN381, AN415, AN479, | JX184113 | JX184090 |
AN349, AN480 | JX184111 | JX184089 | |
(T. atrobrunneum) | AN364, AN699, AN370, AN704, AN706 | JX184112 | JX184088 |
T. longipile | AN359, AN414 | JX184115 | JX184091 |
T. viridescens complex: (T. paraviridescens) | AN322, AN323, AN328, AN334, AN702 | JX184127 | JX184103 |
(T. trixiae) | AN308, AN366, AN416 | JX184128 | JX184104 |
T. viride | AN310, AN330, AN350, AN332, AN340, AN357, AN356, AN358, AN361, AN378, AN384, AN419, AN421, AN478 | JX184123 | JX184101 |
AN315, AN320, AN351, AN352, AN355, AN354, AN371, AN374, AN376, AN377, AN379, AN382, AN383, AN472, AN474, AN475, AN485, AN484, AN687, AN690, AN701 | JX184121 | JX184098 | |
AN346 | JX184124 | JX184100 | |
AN347, AN420 | JX184122 | JX184099 | |
Trichoderma sp. | AN471 | JX184114 | JX184093 |
athe same NCBI GenBank Accession number assigned to the isolates possessing identical alleles in the locus ITS or tef1
bLocation A—Gorce Mountains, location B—Karkonosze Mountains, location C—Tatra Mountains
cunderline indicates the isolates identified previously at the species level by a combination of morphological and molecular analyses by Jeleń et al. (2014)