Table 4. Diversity and frequency of single-nucleotide polymorphisms displayed by Giardia duodenalis sub-assemblage BIV isolates at the glutamate dehydrogenase locus (partial sequence between positions 80 to 467) identified in the present study.

Novel sub-types were shown underlined. Transversion mutations were highlighted in bold. Point mutations inducing amino-acid substitutions were marked as superscript indicating the amino-acid change.

		Nucleotide at position of reference sequence L40508
		87	105	123	135	183	186	201	228	231	255	258	273	282	291	295	300	327	336	345	366	372	387	396	423	432	438	450	462
		C	C	C	T	T	G	G	C	G	C	C	C	G	C	G	C	C	T	C	T	C	T	C	C	C	A	A	T
Sub-type	Number of isolates
KP899852	1	T	.	.	C	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	C	T	C	.	.	.	G	.	.
KP899853	1	.	Y	Y	Y	.	.	.	.	.	Y	.	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	C	.	.	.	.	.	.
KP899854	1	.	.	Y	.	Y	.	.	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	.	.	C	.	.	.	R	.	.
KP899855	1	.	.	.	Y	Y1	R	.	.	.	Y	.	Y	.	.	.	.	.	.	.	Y	.	C	.	.	.	G	.	.
KP899856	1	.	.	.	Y	.	.	.	.	.	Y	.	Y	.	.	.	.	.	.	Y	Y	.	C	Y	.	.	R	.	.
KP899857	1	.	.	.	Y	.	.	.	.	.	.	.	T	.	.	.	.	.	.	Y	.	.	Y	.	.	.	R	.	.
KP899858	1	.	.	.	.	C	A	.	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
KP899859	1	.	.	.	.	C	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	C	.	.	.	R	.	.
KP899860	1	.	.	.	.	C	.	A	.	A	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	C	T	.	.	.	.	.
KP899861	1	.	.	.	.	C	.	.	Y	.	Y	.	Y	.	.	.	.	Y	.	Y	C	Y	C	.	.	.	R	.	.
KP899862	1	.	.	.	.	Y	.	.	Y	.	Y	.	Y	.	.	.	.	Y	.	.	Y	.	C	.	.	.	.	.	.
KP899863	1	.	.	.	.	Y	.	.	Y	.	Y	.	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	C	.	.	.	.	.	.
KP899864	1	.	.	.	.	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	.	C	.	.	.	R	.	.
KP899865	1	.	.	.	.	C	.	.	.	.	.	.	T	.	.	A2	.	.	.	.	.	.	C	.	.	T	.	.	.
KP899866	1	.	.	.	.	Y	.	.	.	.	.	.	.	R	.	.	.	.	.	.	.	.	C	.	.	.	.	.	.
KP899867	1	.	.	.	.	C	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	.	.	Y	Y	.	C	Y	Y	.	.	.	.
KP899868	1	.	.	.	.	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	Y	.	Y	Y	.	.	R	R	Y
KP899869	2	.	.	.	.	C	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	C	.	.	.	.	.	.
KP899870	1	.	.	.	.	C	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	C	Y	Y	.	R	.	.
KP899871	1	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	C	.	.	.	.	.	.
KP899872	1	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	Y	.	S	.	.	.	.	.	.	.	C	.	.	.	R	.	.
KP899873	1	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	C	.	C	.	.	.	G	.	.
KP899874	1	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	.	.	.	C	.	.	.	.	.	.

R: A/G; S: G/C; Y: C/T.

¹ p.M63X.

² p.A99T.