Table 5. Diversity and frequency of single-nucleotide polymorphisms displayed by Giardia duodenalis assemblage B isolates at the beta giardin locus (partial sequence between positions 108 to 573) identified in the present study.

Novel sub-types were shown underlined. Point mutations inducing amino-acid substitutions were marked as superscript indicating the amino-acid change.

		Nucleotide at position of reference sequence AY072727
		120	156	165	183	228	240	282	294	309	312	333	339	343	375	378	415	429	432	435	450	474	507	519	540	543
		C	C	C	A	A	T	C	C	C	T	C	C	A	C	C	C	G	A	C	C	C	C	T	C	C
Sub-type	Number of isolates
KP899886	1	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
KP899887	1	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
KP899888	2	.	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	.	.	.	.	.
KP899889	3	.	.	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
KP899890	3	.	.	Y	.	.	.	.	.	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
KP899891	1	.	.	Y	.	.	.	.	.	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T
KP899892	1	.	.	T	.	.	.	.	.	T	.	.	.	.	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T
KP899893	1	.	.	Y	R	.	.	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	.	.	.	.	.
KP899894	1	.	.	T	R	.	.	.	.	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y
KP899895	1	.	.	Y	.	.	Y	.	.	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
KP899896	1	.	.	T	.	.	.	.	.	T	.	.	.	.	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
KP899897	1	.	.	Y	.	.	.	.	.	.	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
KP899898	1	.	.	T	.	.	.	.	.	.	.	T	.	R1	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	.
KP899899	1	.	.	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	.	A	G	.	.	.	.	.	.	.
KP899900	1	.	.	.	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
KP899901	1	.	.	.	R	.	.	.	.	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	.	.	.	.
KP899902	1	.	.	.	.	R	.	.	.	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	.	.	.	.	.	.
KP899903	1	.	.	.	.	.	C	.	.	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	C	.	.
KP899904	1	.	.	.	.	.	.	.	Y	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
KP899905	1	.	.	.	.	.	.	.	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	.	.	.
KP899906	13	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
KP899907	1	.	.	.	.	.	.	.	.	T	.	Y	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
KP899908	1	.	.	.	.	.	.	.	.	T	.	.	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
KP899909	1	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	.	.	.	.	.	.	Y	.	.	.	Y2	.	.	.	.	.
KP899910	1	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	C	.	.

R: A/G; Y: C/T

¹ p.T115A.

² p.L139X.