Table 1.

16S rRNA gene sequencing assignment of non-tuberculous mycobacteria (NTM).

Concordant identifications from NTM PCR positive and NTM culture positive specimens (n = 191)	NTM from PCR positive and culture negative specimens considered clinically not relevant (n = 130)	NTM from PCR positive and culture negative specimens considered pathogenic NTM (n = 139)	NTM from PCR negative and culture positive specimens
M. abscessus complex (n = 57)	M. gordonae (n = 36)	M. abscessus complex (n = 59)	M. gordonae (n = 19)
M. avium (n = 35)	M. gilvum (n = 17)	M. avium (n = 26)	M. avium (n = 17)
M. kansasii/gastri (n = 29)	M. frederiksbergense (n = 18)	M. mucogenicum (n = 9)	M. kansasii/gastri (n = 11)
M. intracellulare (n = 14)	M. llatzerense (n = 16)	M. kansasii/gastri (n = 8)	M. xenopi (n = 10)
M. chimaera (n = 14)	M. phlei (n = 16)	M. salmoniphilum (n = 8)	M. chimaera (n = 9)
M. fortuitum (n = 7)	M. neoaurum complex (n = 15)	M. fortuitum (n = 7)	M. abscessus complex (n = 7)
M. xenopi (n = 12)	M. vaccae (n = 4)	M. xenopi (n = 4)	M. fortuitum (n = 6)
M. malmoense (n = 4)	M. aurum (n = 2)	M. malmoense (n = 2)	M. interjectum (n = 4)
M. gordonae (n = 4)	M. chlorophenolicum (n = 1)	M. goodii (n = 2)	M. senegalense (n = 3)
M. marinum/ulcerans (n = 4)	M. fluoranthenivorans (n = 1)	M. chimaera (n = 1)	M. conceptionense (n = 2)
M. interjectum (n = 3)	M. sacrum (n = 1)	M. fortuitum complex (n = 1)	M. intracellulare (n = 2)
M. salmoniphilum (n = 3)	M. monacense (n = 1)	M. parafortuitum (n = 1)	M. marseillense (n = 2)
M. vulneris (n = 3)	M. murale/M. tokaiense (n = 1)	M. smegmatis (n = 1),	M. celatum (n = 2)
M. haemophilum (n = 1)	M. rufum (n = 1)	M. hassiaticum (n = 1)	M. terrae complex (n = 2)
M. simiae (n = 1)		M. asiaticum (n = 1)	M. marinum (n = 1)
		M. tusciae (n = 1)	M. palustre (n = 1)
		M. setense (n = 1)	M. porcinum (n = 1),
		M. szulgai (n = 1)	M. bohemicum (n = 1)
		Potentially novel slow growing species (n = 5)	M. colombiense (n = 1)
			M. simiae (n = 1)