Skip to main content
. 2004 Aug;42(8):3594–3599. doi: 10.1128/JCM.42.8.3594-3599.2004

TABLE 3.

Large sequence polymorphisms among isolates of M. africanum subjected to GeneChip analysisa

Sample Presence of region
RD9 RD7 RD8 RD10 RD724 RD727 RD720 RD728 RD721 RD722 RD735 RD711 RD713 RD743 RD715 RD701 RD702 RD742 RD3 RD11
K100/RIVM13876 + + + + + + − − + + + + + + + + + + − +
D2169_99 + + + + − − + + − + + + + + + + + + − +
D2285_99 + + + + − − + + + − + + + + + + + + + +
D2241_99 + + + + − − + + + + − + + + + + + + + +
D10409_02 − + + + + + + + + + + − − − −* + + − + +
CPHL_A − + + + + + + + + + + − − − − + + + + +
D10415_02 − − − − + + + + + + + + + + + − − + − −
K6/RIVM17316 − − − − + + + + + + + + + + + − − + − −
K85/RIVM17902 − − − − + + + + + + + + + + + − − + − −
SN68 − − − − + + + + + + + + + + + − − − − −
ATCC 25420 − − − − + + + + + + + + + + + − − − − −
ATCC 35711 − − − − + + + + + + + + + + + − − − − −
a

Distribution of regions (RD) present (+) or absent (−) in M. africanum isolates subject to GeneChip interrogation. Isolates are grouped according to the presence or absence of RD9 and then RD7, RD8, and RD10. The asterisk * indicates that although RD715 is putatively deleted from D10409_02, its sequence was not confirmed.