TABLE 2.
Identification of enterococci by different identification methods
| Source | Sample | Species determination
|
|||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Standard | PCR | BBL | Vitek | ID 32 Strep | Consensus ID | ||
| Swine feces | 110 | E. hirae | E. hirae | E. durans | E. hirae | E. hirae | E. hirae |
| 113 | E. hirae | E. hirae | E. durans | E. hirae | E. hirae | E. hirae | |
| 124 | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | |
| 126 | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | |
| 127 | E. faecalis | E. faecalis | E. faecium | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | |
| 188 | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | |
| 190 | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. hirae | E. faecalis | |
| 186 | E. hirae | E. hirae | E. durans | E. hirae | E. gallinarum | E. hirae | |
| 165 | E. durans | E. hirae | E. durans | E. hirae | E. hirae | E. hirae | |
| 166 | E. hirae | E. hirae | E. durans | E. hirae | E. hirae | E. hirae | |
| 170 | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | |
| 135 | E. durans | E. hirae | E. hirae | E. hirae | E. hirae | E. hirae | |
| 134 | E. faecium | E. faecium | E. faecium | E. faecium | E. gallinarum | E. faecium | |
| 133 | E. faecium | E. faecium | E. faecium | E. faecalis | E. gallinarum | E. faecium | |
| 131 | E. hirae | E. hirae | E. faecium | E. hirae | E. hirae | E. hirae | |
| 130 | E. faecium | E. casseliflavus | E. casseliflavus | E. casseliflavus | E. gallinarum | E. casseliflavus | |
| 125 | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | |
| 128 | E. faecium | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | |
| 129 | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | |
| 141 | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. hirae | E. faecalis | |
| 107 | E. faecium | E. faecium | E. faecium | E. faecium | E. faecium | E. faecium | |
| 108 | E. faecium | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | |
| 109 | E. faecium | E. faecium | E. faecium | E. faecium | E. gallinarum | E. faecium | |
| 151 | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | |
| 152 | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | |
| Poultry carcass | A1 | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis |
| A2 | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | |
| A3 | E. faecium | E. faecium | E. faecium | E. faecium | E. faecium | E. faecium | |
| A4 | E. faecium | E. faecium | E. hirae | E. faecium | E. faecalis | E. faecium | |
| A5 | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | |
| A6 | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | |
| A7 | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | |
| A8 | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | |
| A9 | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | |
| A10 | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | |
| A11 | E. hirae | E. hirae | E. durans | E. hirae | E. hirae | E. hirae | |
| A12 | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | |
| B1 | E. faecium | E. faecium | E. durans | E. faecium | E. gallinarum | E. faecium | |
| B2 | E. hirae | E. hirae | E. durans | E. hirae | E. hirae | E. hirae | |
| B3 | E. faecium | E. faecalis | E. faecium | E. faecium | E. gallinarum | E. faecium | |
| B4 | E. faecium | E. casseliflavus | E. casseliflavus | E. casseliflavus | E. casseliflavus | E. casseliflavus | |
| B5 | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | |
| B6 | E. casseliflavus | E. casseliflavus | E. casseliflavus | E. casseliflavus | E. casseliflavus | E. casseliflavus | |
| B7 | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | |
| B8 | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | |
| B9 | E. hirae | E. hirae | E. durans | E. hirae | E. hirae | E. hirae | |
| B10 | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | |
| B11 | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | |
| B12 | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. gallinarum | E. faecalis | E. faecalis | |
| C1 | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | |
| Park | |||||||
| Sand | Mem-9 | E. casseliflavus | E. casseliflavus/flav | E. casseliflavus | E. casseliflavus | E. casseliflavus | E. casseliflavus |
| Fly strip | Mem-18 | E. casseliflavus | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis |
| Metal picnic table | Bish-1 | E. mundtii | E. mundtii | E. faecium | E. faecium | E. casseliflavus | NDa |
| Metal picnic table | Bish-2 | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis |
| Metal trash can | Bish-3 | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis |
| Rubber swing | Bish-4 | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis |
| Ladder bar | Bish-10 | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis |
| Plastic slide | Bish-12 | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis |
| Steering wheel | Bish-13 | E. gallinarum | E. gallinarum | E. gallinarum | E. gallinarum | E. gallinarum | E. gallinarum |
| Plastic slide | Bish-14 | E. hirae | E. hirae | E. hirae | E. hirae | E. hirae | E. hirae |
| Plastic slide | Bish-15 | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis |
| Metal picnic table | Bish-17 | E. casseliflavus | E. casseliflavus | E. casseliflavus | E. casseliflavus | E. casseliflavus | E. casseliflavus |
| Plastic slide | Bish-19 | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis |
| Plastic slide | Bish-20 | E. casseliflavus | E. casseliflavus | E. casseliflavus | E. casseliflavus | E. casseliflavus | E. casseliflavus |
| Sand | Bish-21 | E. casseliflavus | E. casseliflavus | E. casseliflavus | E. casseliflavus | E. casseliflavus | E. casseliflavus |
| Sand | Bish-22 | E. hirae | E. hirae | E. hirae | E. hirae | E. hirae | E. hirae |
| Sand | Bish-23 | E. hirae | E. hirae | E. hirae | E. hirae | E. hirae | E. hirae |
| Sand | Bish-24 | E. hirae | E. hirae | E. hirae | E. hirae | E. hirae | E. hirae |
| Fly strip | Bish-25 | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis |
| Fly strip | Bish-26 | E. faecium | E. faecium | E. faecium | E. faecium | E. faecium | E. faecium |
| Plastic slide | SC-5 | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis |
| Plastic slide | SC-6 | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis |
| Tic-tac-toe wheels | SC-9 | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis |
| Step vine climber | SC-10 | E. mundtii | E. mundtii | E. faecium | E. faecium | E. casseliflavus | ND |
| Plastic slide | SC-11 | E. casseliflavus | E. casseliflavus | E. casseliflavus | E. gallinarum | E. casseliflavus | E. casseliflavus |
| Retail foods | |||||||
| Red potato | BSM 36 | E. casseliflavus | E. casseliflavus/flav | E. casseliflavus | E. casseliflavus | E. casseliflavus | E. casseliflavus |
| Chicken | BSM 35 | E. casseliflavus | E. casseliflavus | E. casseliflavus | E. casseliflavus | E. casseliflavus | E. casseliflavus |
| Red potato | BSM 37 | E. casseliflavus | E. casseliflavus | E. casseliflavus | E. casseliflavus | E. casseliflavus | E. casseliflavus |
| Beef | BSM 29 | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis |
| Red potato | BSM 34 | E. casseliflavus | E. casseliflavus | E. casseliflavus | E. casseliflavus | E. casseliflavus | E. casseliflavus |
| Lettuce | KSM 24 | E. mundtii | E. mundtii | E. casseliflavus/gallinarum | E. faecium | E. casseliflavus | ND |
| Turkey | KSM 28 | E. faecium | E. faecium | E. faecium | E. faecium | E. faecium | E. faecium |
| Turkey | KSM 29 | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis |
| Lettuce | KSM 25 | E. mundtii | E. mundtii | E. faecium | E. faecium | E. casseliflavus | ND |
| Chicken | KSM 26 | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis |
| Cucumber | WSM 17 | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis |
| Beef | WSM 29 | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis |
| Pork | WSM 32 | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis |
| Chicken | WSM 26 | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis |
| White potato | ISM 42 | E. mundtii | E. mundtii | E. faecium | E. faecium | E. casseliflavus | ND |
| Pork | ISM 30 | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. gallinarum | E. faecalis | E. faecalis |
| Red potato | ISM 32 | E. casseliflavus | E. casseliflavus | E. casseliflavus | E. casseliflavus | E. casseliflavus | E. casseliflavus |
| Red potato | ISM 36 | E. casseliflavus | E. casseliflavus | E. casseliflavus | E. casseliflavus | E. casseliflavus | E. casseliflavus |
| Apple | ISM 1 | E. casseliflavus | E. casseliflavus | E. casseliflavus | E. casseliflavus | E. casseliflavus | E. casseliflavus |
| Turkey | ISM 26 | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis |
| Pork | FSM 29 | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis |
| White potato | FSM 38 | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis |
| Beef | FSM 26 | E. faecium | E. faecium | E. faecium | E. faecium | E. faecium | E. faecium |
| Red potato | FSM 32 | E. casseliflavus | E. casseliflavus | E. casseliflavus | E. casseliflavus | E. casseliflavus | E. casseliflavus |
| Chicken | FSM 23 | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis | E. faecalis |
a
ND, not determined.