Table S2.
PP5 amino acid | Ala | Cys | Asp | Glu | Phe | Gly | His | Ile | Leu | Met | Asn | Pro | Gln | Arg | Ser | Thr | Val | Trp | Tyr | Maximum, % identity/similarity |
PP5 family* | ||||||||||||||||||||
R275 | 100 | R 100.000 | ||||||||||||||||||
N308 | 7.246 | 1.449 | 62.319 | 4.348 | 18.841 | 4.348 | 1.449 | N 62.319 | ||||||||||||
M309 | 100 | M 100.000 | ||||||||||||||||||
I312 | 49.275 | 1.449 | 46.377 | 2.899 | I/M/V 98.511 | |||||||||||||||
Y313 | 100 | Y 100.000 | ||||||||||||||||||
P375 | 1.449 | 98.551 | P 98.551 | |||||||||||||||||
P376 | 1.449 | 98.551 | P 98.551 | |||||||||||||||||
W386 | 1.449 | 98.551 | W 98.551 | |||||||||||||||||
R400 | 100 | R 100.000 | ||||||||||||||||||
E428 | 100 | E 100.000 | ||||||||||||||||||
V429 | 1.471 | 1.471 | 97.059 | V 97.059 | ||||||||||||||||
Y451 | 100 | Y 100.000 | ||||||||||||||||||
PPP superfamily† | ||||||||||||||||||||
R275 | 100 | R 100.000 | ||||||||||||||||||
N308 | 20.69 | 5.747 | 39.08 | 31.034 | 1.149 | 1.149 | 1.149 | Q 39.080 | ||||||||||||
M309 | 1.149 | 67.816 | 20.69 | 10.345 | I/L/M 98.851 | |||||||||||||||
I312 | 34.483 | 5.747 | 39.08 | 20.69 | I/M/V 79.31 | |||||||||||||||
Y313 | 20.69 | 79.31 | Y 79.310 | |||||||||||||||||
P375 | 14.943 | 29.885 | 55.172 | I/V 70.115 | ||||||||||||||||
P376 | 100 | P 100.000 | ||||||||||||||||||
W386 | 100 | W 100.000 | ||||||||||||||||||
R400 | 100 | R 100.000 | ||||||||||||||||||
E428 | 32.184 | 67.816 | Q/E 100.00 | |||||||||||||||||
V429 | 20.69 | 1.149 | 40.23 | 37.931 | L/V 78.161 | |||||||||||||||
Y451 | 100 | Y 100.000 |
Numbering is the same as for PP5 catalytic domain.
In total, 69 homologs were identified using BLAST with identity greater than 56% throughout both the TPR and catalytic domains.
In total, 87 homologs were identified using UniProt (>10 homologs for each of the PPP family members). The exception is PP7, for which only Arabidopsis was included.