Table 1.
MSP1a tandem repeats reported worldwide. The wide genetic diversity observed is result, in most cases, of cattle movements, veterinary practices, and vector population dynamics.
Anaplasma marginale strain | Structure of msp1a tandem repeats | Ref. | ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Argentina | ||||||||||
Virasoro | Σ | B | Q | B | C | [40] | ||||
Salta | B | B | M | |||||||
Entre Ríos 1 | F | M | M | |||||||
Entre Ríos 2 | F | M | M | |||||||
Entre Ríos 3 | F | M | M | |||||||
Entre Ríos 4 | F | M | M | |||||||
Santa Fe 37 | α | β | β | β | Γ | |||||
Santa Fe 43 | α | β | β | β | Γ | |||||
Santa Fe 50 | α | β | β | β | Γ | |||||
Santa Fe 59 | α | β | β | β | Γ | |||||
Santa Fe 111 | B | B | M | |||||||
Santa Fe 473 | B | B | M | |||||||
Santa Fe 532 | B | B | M | |||||||
Santa Fe 116 | B | B | M | |||||||
Chaco 2 var1 | τ | 22 | 13 | 18 | ||||||
Chaco 2 var2 | α | β | Γ | Γ | β | β | Γ | |||
Chaco 3 var1 | τ | 22 | 13 | 18 | ||||||
Chaco 3 var2 | τ | 11 | 10 | 10 | 11 | 10 | 15 | |||
Chaco 5 | τ | 10 | 15 | |||||||
Chaco 7 | τ | 22 | 13 | 18 | ||||||
Chaco 8 | τ | 22 | 13 | 18 | ||||||
Córdoba 1 | 23 | 24 | 25 | 26 | 27 | 27 | ||||
Córdoba 2 | 23 | 24 | 25 | 26 | 27 | 27 | ||||
Quitilipi | 28 | 29 | m | 29 | M | F | ||||
Mercedes | 23 | 30 | 31 | 31 | 31 | |||||
Corrientes | α | β | β | β | ||||||
| ||||||||||
Australia | ||||||||||
Australia F12 | 8 | [30] | ||||||||
Australia F72 | 8 | |||||||||
Australia Darwin | 8 | |||||||||
Australia WA | 8 | |||||||||
| ||||||||||
Brazil | ||||||||||
Minas-1 | τ | 57 | β | β | γ | [33] | ||||
Minas-2 | Is9 | 24 | 24 | 25 | 31 | |||||
Minas-3 | α | β | β | γ | ||||||
Minas-4 | B | Q | B | M | ||||||
Minas-5 | 13 | 27 | 27 | 27 | ||||||
Minas-6–10 | 72 | 62 | 61 | |||||||
Minas-11 | τ | 57 | 13 | 18 | ||||||
Minas-12 | 72 | 62 | 61 | |||||||
Minas-13 | α | β | β | 13 | ||||||
Brazil | B | B | Q | μ | ||||||
Brazil 5 | C | F | N | |||||||
Brazil 9 | α | β | τ | M | ||||||
Brazil 12 | α | β | β | N | ||||||
UFMG-1 | 13 | 42 | 13 | 18 | ||||||
UFMG-2 | 13 | 27 | 27 | |||||||
Paraná | α | β | β | β | β | Γ | [43] | |||
Paraná 2 | 16 | F | 17 | 13 | 18 | |||||
Paraná 3 | τ | 10 | 15 | |||||||
Lins SP/7 | τ | 10 | 15 | [35] | ||||||
Lins SP/10 | τ | 10 | 15 | |||||||
Lins SP/16 | τ | 10 | 15 | |||||||
Lins SP/11 | 191 | 13 | 18 | |||||||
Lins SP/12 | α | β | β | |||||||
Lins SP/110 | α | β | β | β | 13 | |||||
Lins SP/703 | α | β | β | 192 | ||||||
Lins SP/1136 | τ | β | 100 | |||||||
Lins SP/1228 | α | β | β | Γ | ||||||
Lins SP/1450 | 193 | β | 100 | |||||||
Lins SP/1453 | 191 | 13 | Γ | |||||||
Mambaí GO/1017B | α | β | β | β | Γ | |||||
Mambaí GO/1568B | α | β | β | β | Γ | |||||
Mambaí GO/1806B | E | F | φ | φ | F | F | ||||
AmRio1 | 162 | F | 17 | F | F | [36] | ||||
AmRio2 | α | β | β | β | F | |||||
| ||||||||||
Canada | ||||||||||
Canadian bison | D | Q | Q | R | [30] | |||||
| ||||||||||
China | ||||||||||
HB-A8 | 19 | 20 | 19 | 21 | [30] | |||||
| ||||||||||
Cuba | ||||||||||
Havana | A | B | B | B | B | [34] | ||||
| ||||||||||
Israel | ||||||||||
Israel tailed 1FM3 | 1 | F | M | 3 | [30] | |||||
Israel nontailed | 1 | 4 | ||||||||
Israel tailed 12M3 | 1 | 2 | M | 3 | ||||||
Azaria | 1 | F | M | 3 | 3 | |||||
Lhavot-Habasan | M | F | F | F | ||||||
Or-Haner | M | F | F | |||||||
| ||||||||||
Italy | ||||||||||
Italy 6 | Q | M | Q | Q | M | [30] | ||||
Italy 8 | Q | N | N | N | ||||||
Italy 30 | M | M | M | Q | ||||||
Italy 31 | M | M | M | Q | ||||||
Italy 32 | 5 | Γ | Γ | Γ | ||||||
Italy 47 | 6 | 7 | 7 | 7 | ||||||
| ||||||||||
Mexico | ||||||||||
Mex-31-096-01 | T | C | B | B | C | B | π | [32] | ||
Mex-30-130-01 | T | C | B | B | C | B | C | |||
Mex-30-184-03 | T | C | B | B | C | C | ||||
Mex-15-099-01 | α | β | β | Γ | ||||||
Mex-17-030-01 | α | β | β | Γ | ||||||
Mex-30-193-01 | α | β | β | Γ | ||||||
Mex-18-017-01 | α | β | β | Γ | ||||||
Mex-07-068-01 | α | β | β | Γ | β | Γ | ||||
Mex-07-068-02 | α | β | β | Γ | β | |||||
Tamaulipas 17, 18 | α | β | β | β | Γ | [41] | ||||
Mex-07-065-01 | β | β | β | β | Γ | [32] | ||||
Mex-30-184-02 | 73 | β | β | β | Γ | |||||
Tamaulipas 15 (G9) | τ | 57 | 13 | 18 | [41] | |||||
Mex-14-010-01 | τ | 57 | 13 | 18 | [32] | |||||
Mex-28-037-01 | τ | 57 | 13 | 18 | ||||||
Mex-28-037-02 | 28 | 29 | 74 | 29 | M | F | ||||
Mex-30-184-01 | 72 | C | F | |||||||
Mex-31-089-01 | F | M | M | |||||||
Mex-17-017-01 | 12 | 13 | 14 | |||||||
Mex-01-001-01 | 4 | 9 | 10 | 11 | 9 | |||||
Tamaulipas 1 (G1) | 56 | 57 | 58 | 59 | [41] | |||||
Tamaulipas 13 (G2) | 4 | 9 | 10 | 10 | 9 | |||||
Tamaulipas 4 (G3) | 60 | 61 | 61 | 62 | 61 | |||||
Tamaulipas 7, 9, 10, 12 (G4) | 4 | 63 | 63 | 27 | 12 | |||||
Tamaulipas 11 (G5) | 67 | 68 | 63 | 27 | 12 | |||||
Tamaulipas 14 (G6) | 69 | 61 | 70 | 71 | 61 | |||||
Tamaulipas 5 (G7) | 64 | 65 | D | 65 | 66 | |||||
Tamaulipas 6, 8 (G8) | D | 65 | D | 65 | 66 | |||||
| ||||||||||
Philippines | ||||||||||
Batangas | Ph1 | β | β | Γ | β | β | Γ | [42] | ||
Me1 | 4 | M | M | 4 | 4 | 4 | ||||
Ph11 | Ph11 | Ph11 | Ph11 | M | ||||||
Ph1 | 27 | 27 | ||||||||
13 | 13 | |||||||||
13 | 27 | |||||||||
46 | F | |||||||||
| ||||||||||
Cebu | 13 | 13 | 14 | 14 | 13 | 14 | 14 | |||
Ph4 | 17 | Ph5 | Ph6 | Ph5 | Ph7 | |||||
13 | 13 | 13 | 14 | 14 | ||||||
Ph12 | M | Ph12 | M | M | ||||||
13 | 13 | 13 | MGl10 | |||||||
Ph9 | Is1 | Is1 | Ph10 | |||||||
13 | 14 | 14 | ||||||||
13 | 27 | 14 | ||||||||
13 | 27 | 27 | ||||||||
21 | M | M | ||||||||
46 | Ph20 | 46 | ||||||||
13 | 27 | |||||||||
13 | MGl10 | |||||||||
46 | 46 | |||||||||
46 | F | |||||||||
14 | ||||||||||
17 | ||||||||||
Me1 | ||||||||||
Ph8 | ||||||||||
13 | ||||||||||
| ||||||||||
Iloilo | Ph4 | 17 | Ph5 | Ph7 | Ph5 | Ph7 | ||||
Ph12 | M | 3 | 3 | M | ||||||
Ph4 | 17 | Ph5 | Ph5 | Ph7 | ||||||
Me1 | 4 | 4 | 4 | |||||||
Ph16 | Ph17 | MGl10 | ||||||||
Ph19 | M | F | ||||||||
13 | 27 | 13 | 14 | |||||||
| ||||||||||
Negros Occidental | Me1 | 4 | M | M | 4 | 4 | ||||
Ph21 | 62 | 61 | 62 | 61 | 62 | |||||
Me1 | 4 | M | M | 4 | ||||||
Ph2 | Is1 | Is1 | Is1 | |||||||
Ph18 | MGl10 | |||||||||
Ph3 | ||||||||||
13 | 14 | |||||||||
| ||||||||||
Negros Oriental | Ph4 | 17 | Ph5 | Ph7 | Ph5 | Ph7 | ||||
13 | 27 | |||||||||
| ||||||||||
Puerto Rico | ||||||||||
Puerto Rico | E | Φ | Φ | Φ | Φ | Φ | [30] | |||
| ||||||||||
South Africa | ||||||||||
SA12 | 34 | 13 | 4 | 37 | [30] | |||||
SW82 | 34 | 13 | 4 | 37 | ||||||
SW62 | 34 | 13 | 4 | 37 | ||||||
SW162 | 34 | 13 | 4 | 37 | ||||||
SW134 | 34 | 13 | 4 | 37 | ||||||
SA66 | 34 | 13 | 4 | 37 | ||||||
SA193 | 34 | 4 | 37 | |||||||
SW32 | 34 | 13 | 13 | 37 | ||||||
SA14 | 34 | F | 4 | H | ||||||
SA10 | 33 | 35 | 35 | |||||||
SW29 | 3 | 3 | 38 | |||||||
SA71 | 3 | 3 | 38 | |||||||
SA302 | 3 | 3 | 38 | |||||||
SA196 | 3 | 3 | 38 | |||||||
SW114 | 3 | 13 | 4 | 4 | 37 | |||||
SW109 | 27 | 4 | 13 | 13 | 37 | |||||
SW44 | 27 | 4 | 4 | 4 | 37 | |||||
SW90 | 27 | 13 | 4 | 13 | 4 | |||||
SA239 | 27 | 4 | 13 | 4 | 4 | |||||
SA183 | 27 | 13 | 4 | 44 | ||||||
SW34 | 34 | 45 | 45 | 46 | 37 | |||||
SA191 | 27 | 37 | ||||||||
SA189 | 27 | 37 | ||||||||
SA4 | 27 | 18 | ||||||||
SA63 | 39 | 37 | 13 | 13 | 13 | 13 | 37 | |||
SA240 | 40 | Q | Q | |||||||
SW113 | 41 | 13 | 13 | 13 | 4 | 37 | ||||
SW112 | 42 | 43 | 25 | 31 | ||||||
SA243 | 3 | 36 | 3 | 36 | 36 | 3 | 36 | 38 | ||
LP-7 | 34 | 159 | [37] | |||||||
LP-10 | 27 | 13 | 3 | 36 | ||||||
LP-30 | 27 | 13 | 3 | |||||||
LP-34 | 34 | 13 | 3 | 38 | ||||||
LP-37 | 27 | 13 | 13 | 37 | ||||||
LP-46 | 3 | 38 | ||||||||
LP-50 | 34 | 13 | 13 | |||||||
MP-C2 | 34 | 13 | 158 | 37 | ||||||
MP-C5 | 15 | 15 | 100 | 83 | ||||||
NW-C2 | 27 | 13 | 4 | 4 | 37 | |||||
NW-C4 | 27 | 13 | 4 | 37 | ||||||
NW-C5 | 82 | 13 | 79 | 4 | 37 | |||||
NW-CA-160312 | 34 | 13 | 3 | 36 | 38 | |||||
NW-C4-160312 | 34 | 36 | 38 | 3 | ||||||
GP-C1 | 82 | 13 | 4 | 4 | 37 | |||||
GP-C2 | 34 | 27 | 3 | 38 | 13 | 3 | 38 | |||
GP-C5 | 3 | 4 | 4 | 4 | 37 | |||||
GP-C112105 | 34 | 37 | ||||||||
GP-C4117105 | 3 | 36 | 38 | |||||||
GP-C7117105 | 34 | 13 | 13 | |||||||
GP-C1817105 | 34 | 13 | 37 | |||||||
KZN-D | 42 | 43 | 25 | 161 | 31 | |||||
KZN-F | 42 | 43 | 25 | 31 | 31 | |||||
KZN-K | 27 | 13 | 4 | 4 | 37 | |||||
KZN-Y | 143 | 144 | 145 | 146 | ||||||
KZN-MM | 42 | 43 | 25 | 31 | ||||||
KZN-14 | 142 | 43 | 25 | 31 | ||||||
KZN-19 | 141 | 140 | 140 | |||||||
KZN-49 | 147 | 148 | 149 | 150 | ||||||
KZN-51 | 147 | |||||||||
EC-22 | 27 | 13 | 4 | 4 | 37 | |||||
EC-23 | 151 | 152 | 4 | 4 | 153 | |||||
EC-24 | 27 | 13 | 4 | |||||||
WC-4 | 40 | Q | Q | m | ||||||
WC-6 | 3 | 4 | 4 | 37 | ||||||
WC-7 | M | M | M | M | ||||||
WC-8 | 34 | 4 | 37 | |||||||
WC-10 | 154 | |||||||||
WC-11 | 40 | Q | Q | Q | Q | 37 | ||||
WC-12 | 27 | 13 | 37 | |||||||
WC-12 | M | Q | M | Q | M | |||||
WC-14 | 155 | 36 | 38 | |||||||
WC-15 | 160 | 13 | 37 | 4 | 161 | |||||
WC-16 | 34 | 13 | 4 | 13 | 13 | 4 | 37 | |||
| ||||||||||
Spain | ||||||||||
Va-48 | 40 | 47 | 47 | 32 | C | C | [30] | |||
| ||||||||||
United States | ||||||||||
Florida | A | B | B | B | B | B | B | B | [30] | |
California | B | B | C | |||||||
Okeechobee, FL | L | B | C | B | C | |||||
Illinois | M | N | B | M | H | |||||
Idaho | D | D | D | D | D | E | ||||
Virginia | A | B | ||||||||
Wetumka, OK | K | C | H | |||||||
Cushing, OK | L | C | B | C | ||||||
Cushing 2, OK | K | N | N | F | H | |||||
Glencoe 1, OK | K | F | N | F | H | |||||
Glencoe 2, OK | B | M | F | H | ||||||
Glencoe 3, OK | T | B | C | |||||||
Stillwater, OK | K | F | F | F | H | |||||
Stillwater 2, OK | L | B | C | C | ||||||
Stillwater 68, OK | K | B | M | F | H | |||||
Stillwater 483, OK | K | B | M | H | ||||||
Oklahoma City, OK | U | |||||||||
Okmulgee, OK | K | B | V | C | ||||||
Stigler, OK | T | B | B | C | ||||||
Pawhuska, OK | I | H | ||||||||
New Castle, OK | L | B | C | B | ||||||
St. Maries | J | B | B | |||||||
Mississippi | D | D | D | D | E | |||||
Oregon | G | |||||||||
Oregon, Rasmusen | A | F | H | |||||||
US bison (buffalo) | K | B | M | F | W | |||||
Washington | B | B | B | C | ||||||
Missouri | B | B | B | B | ||||||
Texas | O | B | M | P | ||||||
Texas 198 | B | B | m | B | m | |||||
South Dakota | A | F | H | |||||||
Kansas 3261 | B | B | ||||||||
Kansas 4102 | B | B | B | |||||||
Kansas 2267 | B | B | B | B | ||||||
Kansas 0141 | B | B | B | B | B | |||||
Kansas 0063 | B | B | B | B | B | B | ||||
Kansas 5076 | D | D | D | D | D | |||||
Kansas 7042 | D | D | E | |||||||
Kansas 4318 | D | D | D | D | D | E | ||||
Kansas 2070 | D | D | D | D | D | D | E | |||
Kansas 7030 | D | D | D | D | D | D | D | D | D | |
Kansas 0050 | E | M | Φ |