Skip to main content
. 2016 Aug 31;9(1):475. doi: 10.1186/s13071-016-1769-x

Table 2.

Properties of protein-coding genes, length of the mt genomes and rRNA genes and AT content of cestode mt genomes

Gene Species
T. s. T. a. E. g. E. m. H. k. H. p. V. m. D. c. A. p. A. m. H. d. C. v.
Number of aa
cox3 214 214 215 215 214 214 215 215 214 214 216 214
cytb 355 355 355 355 355 354 355 360 366 366 365 364
nad4L 86 86 86 86 86 86 86 86 86 86 86 86
nad4 403 417 419 404 416 416 419 415 415 415 409 414
atp6 171 171 170 171 172 171 171 171 171 171 171 171
nad2 293 293 293 293 295 294 291 290 291 291 293 291
nad1 297 297 297 297 297 298 297 297 296 296 296 296
nad3 115 115 115 115 113 113 115 114 115 115 115 115
cox1 539 539 557 535 543 538 539 580 530 529 517 527
cox2 193 191 193 193 194 194 192 191 191 191 192 193
nad6 150 150 151 151 150 149 152 151 152 152 152 151
nad5 522 522 523 524 522 524 522 521 526 526 524 522
Length of rRNA gene (bp)
rrnL 980 975 967 983 960 961 963 970 981 973 967 964
rrns 705 731 726 704 728 730 727 729 724 724 709 715
Deduced initiation codon
cox3 ATG ATG ATG ATG ATG ATG ATG ATG ATG ATG ATG GTG
cytb ATG ATG ATG ATG ATG ATG ATG ATG GTG GTG ATG ATG
nad4L ATG ATG GTG GTG ATG ATG ATG ATG ATG GTG ATG ATG
nad4 GTG ATG ATG ATG GTG ATG ATG GTG ATG GTG ATT GTG
atp6 ATG ATG ATG ATG ATG ATG ATG ATG ATG ATG ATG ATG
nad2 ATG ATG ATG ATG ATG ATG ATG ATG ATG ATG ATG ATG
nad1 ATG ATG GTG ATG GTG ATG ATG ATG ATG GTG ATG ATG
nad3 ATG ATG ATG ATG ATG ATG ATG ATG ATG ATG ATG GTG
cox1 ATG ATG ATG ATG ATG ATG ATG ATG ATG ATG TTT GTG
cox2 ATG ATG GTG GTG ATG ATG ATG ATG ATG ATG ATG GTG
nad6 ATG GTG ATG ATG GTG ATG ATG ATG ATG ATG ATG ATG
nad5 ATG ATG ATG ATG ATG ATG ATG ATG ATG ATG ATG ATG
Deduced termination codon
cox3 TAG TAG TAG TAG TAA TAA TAG T TA TA TAG TAA
cytb TAA TAA TAA TAA TAA TAA TAA TAG TAG TAA TAG TA
nad4L TAA TAG TAA TAG TAG TAA TAG TAG TAG TAG TAG TAA
nad4 TAG TAG TAG TAG TAG TAA TAA TAA TAA TAG TAG TAA
atp6 TAA TAA TAG TAG TAG TAG TAA TAG TAG TAG TAG TAA
nad2 TAA TAA TAG TAG TAA TAA TAG T TAG TAG TAG TAA
nad1 T T TAA TAG TAG TAG TAG TAA TAA TAA TAG TAA
nad3 TAG TAG TAG TAA T TAG TAG TAG TAA TAA TAG TAG
cox1 TAG TAA TAA TAG TAA TAG TAG TAA TAA TAG T TAG
cox2 TAG TAG TAG TAG T T TAG TAG TAG TAG TAA TAA
nad6 TAG TAA TAG TAA TAG TAA TAA TAG TAG TAG TAA TAG
nad5 TAA TAA TAA TAA TAG TAA TAA TAA TAG TAA TAG TAA
Length of mt genome (bp)
– 13,709 13,703 13,610 13,738 13,792 13,482 13,582 14,296 14,459 13,759 13,900 13,411
AT content of complete mt genome (%)
– 72.05 71.40 67.02 69.04 72.77 71.40 71.37 72.89 71.05 70.80 71.04 74.64

Note: Results obtained from GenBank accessions

Abrreviations: T. s. Taenia solium, T. a. Taenia asiatica, E. g. Echinococcus granulosus, E. m. Echinococcus multilocularis, H. k. Hydatigera krepkogorski, H. p. Hydatigera parva, V. m. Versteria mustelae, D. c. Dipylidium caninum, A. p. Anoplocephala perfoliata, H. d. Hymenolepis diminuta, D. n. Diphyllobothrium nihonkaiense, D. l. Diphyllobothrium latum, D. g. Diplogonoporus grandis, D. b. Diplogonoporus balaenopterae, S. e. Spirometra erinaceieuropaei, C. v. Cladotaenia vulturi