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. 2016 Sep 15;6:33363. doi: 10.1038/srep33363

Table 1. Suggestively significant interactions between Y-hg O3e* and SNPs in control and case groups.

Chr SNPa MAFb MAFc ORSNP PSNP ORO3e* PO3e* ORinter Pinter R2
2 rs13017562 0.38 0.36 0.93 0.26 0.31 3.63 × 10−8 2.22 2.62 × 10−5 0.064
2 rs869633 0.38 0.36 0.93 0.26 0.31 3.72 × 10−8 2.22 2.69 × 10−5 0.064
2 rs869632 0.38 0.36 0.94 0.29 0.32 4.69 × 10−8 2.18 3.68 × 10−5 0.063
2 rs815808 0.06 0.09 0.91 0.37 0.45 1.10 × 10−7 3.42 3.05 × 10−5 0.065
2 rs815807 0.05 0.08 0.91 0.40 0.46 2.08 × 10−7 3.36 6.83 × 10−5 0.063
2 rs1723493 0.04 0.08 0.91 0.45 0.47 2.28 × 10−7 3.34 9.03 × 10−5 0.063
2 rs11678378 0.44 0.43 1.00 0.99 1.12 0.560 0.46 7.63 × 10−5 0.063
3 rs17217643 0.31 0.33 0.87 0.03 0.35 5.42 × 10−8 2.26 5.25 × 10−5 0.063
3 rs6774209 0.31 0.33 0.87 0.03 0.34 4.45 × 10−8 2.24 9.16 × 10−5 0.065
3 rs10513814 0.19 0.20 0.86 0.07 0.41 1.08 × 10−7 2.30 9.75 × 10−5 0.062
4 rs17005650 0.33 0.37 1.05 0.44 0.32 5.99 × 10−8 2.26 3.47 × 10−5 0.066
5 rs11135482 0.39 0.42 0.83 4.93 × 10−3 0.31 1.02 × 10−7 2.07 9.11 × 10−5 0.064
5 rs11135484 0.39 0.43 0.80 9.09 × 10−4 0.31 1.56 × 10−7 2.07 9.89 × 10−5 0.065
5 rs12520985 0.23 0.24 1.11 0.14 0.89 0.455 0.38 7.15 × 10−5 0.064
5 rs13181162 0.41 0.41 0.94 0.31 0.30 1.36 × 10−7 2.10 9.36 × 10−5 0.062
6 rs16891417 0.09 0.06 0.91 0.44 0.49 5.41 × 10−7 4.52 7.07 × 10−5 0.063
6 rs3818947 0.08 0.06 0.89 0.38 0.49 5.54 × 10−7 4.58 6.26 × 10−5 0.063
6 rs16891497 0.09 0.06 0.95 0.69 0.48 3.37 × 10−7 4.45 4.41 × 10−5 0.063
6 rs16891501 0.09 0.06 0.86 0.25 0.49 5.48 × 10−7 4.23 7.95 × 10−5 0.062
6 rs9452333 0.34 0.42 1.02 0.77 1.04 0.847 0.47 9.88 × 10−5 0.063
7 rs17139327 0.22 0.25 0.85 0.03 0.39 5.83 × 10−8 2.42 6.11 × 10−5 0.064
8 rs10957317 0.15 0.15 0.86 0.08 0.42 5.78 × 10−8 2.79 3.05 × 10−5 0.063
8 rs12545097 0.15 0.15 0.86 0.09 0.41 3.63 × 10−8 2.95 1.20 × 10−5 0.064
8 rs2385127 0.15 0.15 0.85 0.07 0.42 4.95 × 10−8 2.88 1.92 × 10−5 0.064
9 rs2117103 0.18 0.19 0.93 0.34 0.40 6.98 × 10−8 2.37 6.17 × 10−5 0.063
9 rs1368677 0.18 0.19 0.91 0.26 0.40 6.65 × 10−8 2.40 4.77 × 10−5 0.063
9 rs12555036 0.42 0.44 0.94 0.29 0.29 1.36 × 10−7 2.08 8.48 × 10−5 0.063
11 rs4757259 0.30 0.26 0.86 0.04 0.38 6.48 × 10−8 2.40 7.45 × 10−5 0.063
11 rs4757260 0.30 0.26 0.87 0.06 0.38 6.01 × 10−8 2.43 5.82 × 10−5 0.063
11 rs12286075 0.32 0.36 0.93 0.28 0.32 5.98 × 10−8 2.20 4.92 × 10−5 0.063
11 rs4923182 0.42 0.46 0.98 0.70 0.24 1.12 × 10−8 2.51 4.12 × 10−6 0.067
11 rs4923186 0.42 0.46 0.99 0.85 0.24 1.83 × 10−8 2.50 5.04 × 10−6 0.066
12 rs10841420 0.44 0.46 0.89 0.07 0.29 5.66 × 10−8 2.13 5.78 × 10−5 0.064
12 rs10437774 0.43 0.44 0.90 0.09 0.31 1.05 × 10−7 2.09 8.46 × 10−5 0.063
13 rs9510242 0.33 0.31 1.08 0.23 0.96 0.790 0.43 8.02 × 10−5 0.063
15 rs16968382 0.03 0.05 0.81 0.15 0.50 6.47 × 10−7 4.09 9.73 × 10−5 0.062
15 rs8035166 0.36 0.35 0.85 0.01 0.34 9.47 × 10−8 2.15 8.29 × 10−5 0.063
20 rs12625552 0.03 0.06 0.85 0.23 0.47 2.19 × 10−7 3.99 2.87 × 10−5 0.064

OR for odds ratio, P for P value and R2 for goodness of fit of logistic regression models.

aOnly those suggestively significant SNPs with a Pinter < 1 × 10−4 were shown.

bMAF for minor allele frequency in Chinese in 1000 Genomes, cMAF in this study controls.