Table 2.

Genes, SNP selection, their location, minor allele frequencies in cases and controls of each ethnic/race group

Gene	SNP	Position	Function SNP	Minor Allele	Caucasians			Hispanics			African Americans
					MAF case	MAF control	P*	MAF case	MAF control	P*	MAF case	MAF control	P*
RNASEL	rs17568993	chr1:180804117		A	0.126	0.135	0.503	0.08	0.061	0.226	0.073	0.117	0.129
	rs12757998	chr1:180805101		A	0.284	0.309	0.149	0.198	0.198	0.999	0.177	0.139	0.270
	rs635261	chr1:180805664		C	0.383	0.37	0.484	0.402	0.406	0.901	0.287	0.262	0.569
	rs10911099	chr1:180806772		G	0.115	0.116	0.934	0.085	0.062	0.154	0.049	0.028	0.232
	rs1048260	chr1:180809474	3′UTR	G	0.296	0.287	0.628	0.304	0.295	0.752	0.213	0.194	0.621
	rs11072	chr1:180809954	3′UTR	G	0.302	0.297	0.768	0.31	0.304	0.827	0.216	0.201	0.692
	rs1048254	chr1:180810289	3′UTR	C	0.298	0.293	0.756	0.265	0.266	0.987	0.213	0.207	0.865
	rs533259	chr1:180815642		A	0.069	0.064	0.619	0.028	0.043	0.211	0.213	0.238	0.548
	rs627928	chr1:180817960	Glu541Asp	G	0.543	0.553	0.678	0.513	0.467	0.244	0.329	0.314	0.767
	rs516134	chr1:180820316		G	0.03	0.032	0.703	0.008	0.018	0.174	0.152	0.198	0.223
	rs486907	chr1:180821180	Gln462Arg	A	0.351	0.337	0.528	0.313	0.244	0.052	0.236	0.119	0.004
	rs3738579	chr1:180822659	5′UTR	G	0.343	0.338	0.759	0.265	0.216	0.061	0.134	0.133	0.965
	rs682585	chr1:180826133		A	0.382	0.39	0.673	0.446	0.486	0.196	0.146	0.108	0.220
MSR1	rs918	chr8:16011449	3′UTR	A	0.055	0.057	0.792	0.098	0.107	0.637	0.189	0.148	0.247
	rs1904577	chr8:16016055		G	0.126	0.128	0.843	0.273	0.302	0.315	0.396	0.444	0.310
	rs11780669	chr8:16018641		G	0.083	0.095	0.247	0.039	0.028	0.325	0.012	0.028	0.273
	rs12114368	chr8:16025334		A	0.035	0.036	0.832	0.169	0.208	0.117	0.08	0.071	0.713
	rs12681382	chr8:16029033		G	0.029	0.031	0.714	0.102	0.129	0.178	0.018	0.019	0.986
	rs2127565	chr8:16030930		G	0.119	0.131	0.355	0.29	0.312	0.445	0.644	0.614	0.528
	rs4333601	chr8:16042345	3′UTR	C	0.234	0.239	0.745	0.418	0.443	0.412	0.433	0.54	0.025
	rs12718376	chr8:16042516	3′UTR	A	0.107	0.153	0.002	0.301	0.235	0.092	0.46	0.524	0.430
	rs17484273	chr8:16044606		A	0.315	0.335	0.255	0.284	0.299	0.584	0.207	0.207	0.989
	rs17484315	chr8:16055103		C	0.043	0.047	0.606	0.008	0.009	0.843	0.012	0	0.046
	rs3747531	chr8:16057019	Ala275Pro	G	0.047	0.058	0.216	0.142	0.179	0.104	0.073	0.075	0.957
	rs351572	chr8:16065839		G	0.438	0.404	0.067	0.265	0.239	0.327	0.341	0.256	0.049
	rs754331	chr8:16067989		A	0.465	0.484	0.310	0.363	0.361	0.926	0.256	0.247	0.825
	rs13251251	chr8:16073863		A	0.064	0.06	0.655	0.031	0.031	0.977	0	0.006	0.313
	rs614794	chr8:16085228		G	0.12	0.119	0.894	0.365	0.398	0.277	0.366	0.358	0.865†
	rs3789015	chr8:16087084		G	0.039	0.045	0.461	0.137	0.177	0.079	0.079	0.08	0.970
	rs6530946	chr8:16099299		G	0.14	0.158	0.335	0.392	0.442	0.132	0.594	0	0
ELAC2	rs2072262	chr17:12833668		G	0.129	0.116	0.315	0.104	0.111	0.694	0.134	0.167	0.349
	rs2072261	chr17:12833814		A	0.237	0.239	0.871	0.227	0.25	0.381	0.119	0.108	0.724
	rs2523	chr17:12836540	3′UTR	G	0.349	0.345	0.805	0.381	0.402	0.497	0.476	0.515	0.406
	rs1044564	chr17:12836709	3′UTR	G	0.35	0.348	0.917	0.381	0.401	0.514	0.481	0.534	0.275
	rs17552022	chr17:12839020	Thr631Thr	G	0.122	0.091	0.018	0.077	0.059	0.291	0.013	0.01	0.826
	rs11545302	chr17:12840688	Thr520Thr	G	0.268	0.189	9.1 × 10−6	0.259	0.263	0.888	0.2	0.068	2.0 × 10−4
	rs11658321	chr17:12855209		A	0.35	0.341	0.604	0.41	0.408	0.957	0.665	0.698	0.459
	rs2051974	chr17:12862370		A	0.233	0.242	0.601	0.22	0.198	0.382	0.427	0.466	0.411
	rs8077923	chr17:12864712		C	0.14	0.158	0.194	0.179	0.18	0.964	0.201	0.176	0.496
	rs7218504	chr17:12868379		C	0.309	0.315	0.737	0.302	0.27	0.253	0.39	0.41	0.676
	rs12943765	chr17:12868955		G	0.059	0.048	0.201	0.062	0.039	0.087	0.055	0.049	0.795

NOTE: Significant P values are in bold.

^*Assumes Hardy-Weinberg equilibrium.

^†SNP not in Hardy-Weinberg equilibrium (P < 0.01).