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. 2016 Sep 29;90(20):9364–9382. doi: 10.1128/JVI.01211-16

TABLE 1.

SLA haplotypes of infected pigs

Pig Trial Day of euthanasia SLA class I
SLA class II
Haplotype SLA allele specificity
Haplotype SLA allele specificity
SLA-1 SLA-3 SLA-2 DRB1 DQB1 DQA
1 1 2 Lr-28.0 09XX, 15XX 07XX 05XX Lr-0.23 10XX 06XX 01XX
Lr-24.0 Blank 04XX 06XX Lr-0.19a 04XX 07XX 03XX
2 1 4 Lr-01.0 01XX 01XX 01XX Lr-0.15b 04XX 02XX 02XX
Lr-67.0 15XX 05XX 10XX Lr-0.20 06XX 03XX 01XX
3 2 4 Lr-04.0 04XX 04XX 04XX Lr-0.01 04XX 08XX 03XX
Lr-43.0 11XX 04XX 04XX Lr-0.29 Blank 09XX 04XX
4 2 4 Lr-28.0 09XX, 15XX 07XX 05XX Lr-0.23 10XX 06XX 01XX
Lr-24.0 Blank 04XX 06XX Lr-0.20 06XX 03XX 01XX
5 3 4 Lr-04.0 04XX 04XX 04XX Lr-0.23 10XX 06XX 01XX
Lr-28.0 09XX, 15XX 07XX 05XX Lr-0.11 09XX 04XX 03XX
6 3 4 Lr-04.0 04XX 04XX 04XX Lr-0.23 10XX 06XX 01XX
Lr-28.0 09XX, 15XX 07XX 05XX Lr-0.11 09XX 04XX 03XX
7 1 6 Lr-24.0 Blank 04XX 06XX Lr-0.15b 04XX 02XX 02XX
Lr-05.0 04XX 05XX w08XX Lr-0.19a 04XX 07XX 03XX
8 2 6 Lr-32.0 07XX 04XX 02XX Lr-0.23 10XX 06XX 01XX
Lr-32.0 07XX 04XX 02XX Lr-0.15b 04XX 02XX 02XX
9 2 6 Lr-43.0 11XX 04XX 04XX Lr-0.08b 08XX 0203 02XX
Lr-07.0 08XX 07XX 05XX Lr-0.11 09XX 04XX 03XX
10 3 6 Lr-26.0 08XX 05XX 10XX Lr-0.23 10XX 06XX 01XX
Lr-28.0 09XX, 15XX 07XX 05XX Lr-0.20 06XX 03XX 01XX
11 3 6 Lr-24.0 Blank 04XX 06XX Lr-0.11 09XX 04XX 03XX
Lr-43.0 11XX 04XX 04XX Lr-0.23 10XX 06XX 01XX
12 1 9 Lr-28.0 09XX, 15XX 07XX 05XX Lr-0.23 10XX 06XX 01XX
Lr-59.0 11XX 05XX jh02 Lr-0.23 10XX 06XX 01XX
13 2 9 Lr-28.0 09XX, 15XX 07XX 05XX Lr-0.23 10XX 06XX 01XX
Lr-04.0 04XX 04XX 04XX Lr-0.26 11XX 04XX 02XX
14 2 9 Lr-05.0 04XX 05XX w08XX Lr-0.11 09XX 04XX 03XX
Lr-43.0 11XX 04XX 04XX Lr-0.20 06XX 03XX 01XX
15 3 9 Lr-66.0 15XX 04XX 04XX Lr-0.11 09XX 04XX 03XX
Lr-43.0 11XX 04XX 04XX Lr-0.15b 04XX 02XX 02XX
16 3 9 Lr-28.0 09XX, 15XX 07XX 05XX Lr-0.23 10XX 06XX 01XX
Lr-24.0 Blank 04XX 06XX Lr-0.6 05XX 08XX 01XX
17 1 12 Lr-24.0 Blank 04XX 06XX Lr-0.19a 04XX 07XX 03XX
Lr-24.0 Blank 04XX 06XX Lr-0.23 10XX 06XX 01XX
18 2 12 Lr-04.0 04XX 04XX 04XX Lr-0.23 10XX 06XX 01XX
Lr-28.0 09XX, 15XX 07XX 05XX Lr-0.23 10XX 06XX 01XX
19 2 12 Lr-05.0 04XX 05XX w08XX Lr-0.11 09XX 04XX 03XX
Lr-43.0 11XX 04XX 04XX Lr-0.15b 04XX 02XX 02XX
20 3 12 Lr-29.0 Blank (08XX?) 05XX w09XX Lr-0.23 10XX 06XX 01XX
Lr-35.0 12XX, 13XX 05XX 10XX Lr-0.23 10XX 06XX 01XX
21 3 12 Lr-01.0 01XX 01XX 01XX Lr-0.15b 04XX 02XX 02XX
Lr-39.0 Blank 05XX 10XX Lr-0.23 10XX 06XX 01XX
22 1 15 Lr-01.0 01XX 01XX 01XX Lr-0.15b 04XX 02XX 02XX
Lr-67.0 15XX 05XX 10XX Lr-0.20 06XX 03XX 01XX
23 1 15 Lr-26.0 08XX 05XX 10XX Lr-0.23 10XX 06XX 01XX
Lr-28.0 09XX, 15XX 07XX 05XX Lr-0.20 06XX 03XX 01XX
24 2 15 Lr-28.0 09XX, 15XX 07XX 05XX Lr-0.23 10XX 06XX 01XX
Lr-35.0 12XX, 13XX 05XX 10XX Lr-0.23 10XX 06XX 01XX
25 2 15 Lr-04.0 04XX 04XX 04XX Lr-0.08b 08XX 02XX 02XX
Lr-34.0 Blank (15XX, 11XX) 04XX 05XX Lr-0.11 09XX 04XX 03XX
26 3 15 Lr-28.0 09XX, 15XX 07XX 05XX Lr-0.23 10XX 06XX 01XX
Lr-43.0 11XX 04XX 04XX Lr-0.11 09XX 04XX 03XX
27 2 42 Lr-07.0 08XX 07XX 05XX Lr-0.23 10XX 06XX 01XX
Lr-28.0 09XX, 15XX 07XX 05XX Lr-0.08b 08XX 0203 02XX
28 2 44 Lr-66.0 15XX 04XX 04XX Lr-0.26 11XX 04XX 02XX
Lr-25.0 11XX 03XX 07XX Lr-0.19a 04XX 07XX 03XX
29 2 44 Lr-66.0 15XX 04XX 04XX Lr-0.11 09XX 04XX 03XX
Lr-35.0 12XX, 13XX 05XX 10XX Lr-0.26 11XX 04XX 02XX
30 2 46 Lr-04.0 04XX 04XX 04XX Lr-0.11 09XX 04XX 03XX
Lr-25.0 11XX 03XX 07XX Lr-0.15b 04XX 02XX 02XX
31 2 46 Lr-01.0 01XX 01XX 01XX Lr-0.14 09XX 08XX 03XX
Lr-43.0 11XX 04XX 04XX Lr-0.24 07XX 02XX 02XX