Table S4. Correlations among immunohistochemical stainings (first line: correlation coefficient; second line: correspondent P value).

Correlations	CD117	CD5	p63	p40	p21n	p21c	p27n	p27c	p53	Bcl-2	Ki67	Podoplanin	Synaptophysin	PTEN	Pax8n	Pax8c
CD117	1	Pos	Neg	Neg	Pos	Pos	Pos	Pos	Pos	Pos	Pos			Pos	Pos	Pos
		0.005	0.892	0.446	0.090	0.090	0.022	0.047	0.190	<0.001*	0.105	0.368	0.045*	0.069	0.353	0.018*
CD5	Pos	1	0.049	0.058	0.445	0.467	0.534	0.463	0.149	0.583	0.477	Pos	Pos	−0.384	0.403	0.580
	0.005*		0.846	0.807	0.049*	0.038*	0.015*	0.040*	0.530	0.007*	0.033*	0.487	0.104	0.095	0.078	0.007*
p63	Neg	0.049	1	0.816	0.026	0.364	0.514	0.560	0.112	0.138	0.173	Neg	Pos	0.577	0.588	0.497
	0.892	0.846		<0.001*	0.918	0.137	0.029*	0.016*	0.657	0.584	0.492	0.101	0.389	0.012*	0.010*	0.036*
p40	Neg	0.058	0.816	1	−0.134	0.219	0.352	0.287	0.145	0.208	0.275	Neg	Neg	0.465	0.518	0.416
	0.446	0.807	<0.001*		0.553	0.328	0.117	0.208	0.520	0.365	0.216	0.099	0.709	0.034*	0.019*	0.068
p21n	Pos	0.445	−0.026	−0.134	1	0.538	0.429	0.462	0.272	0.815	0.469	Pos	Pos	−0.319	0.228	0.333
	0.010*	0.049*	0.918	0.553		0.010*	0.052	0.035*	0.220	<0.001*	0.028*	0.253	0.546	0.159	0.334	0.152
p21c	Pos	0.467	0.364	0.219	0.538	1	0.543	0.570	0.285	0.518	0.381	Pos	Pos	0.056	0.449	0.483
	0.090	0.038*	0.137	0.328	0.010*		0.011*	0.007*	0.198	0.016	0.080	0.543	0.116	0.809	0.047*	0.031*
p27n	Pos	0.534	0.514	0.352	0.429	0.543	1	0.806	0.155	0.624	0.511	Pos	Pos	−0.104	0.815	0.887
	0.022*	0.015*	0.029*	0.117	0.052	0.011*		<0.001	0.503	0.002*	0.018*	0.140	0.136	0.654	<0.001*	<0.001*
p27c	Pos	0.463	0.560	0.287	0.462	0.570	0.806	1	0.171	0.580	0.426	Pos	Pos	0.093	0.590	0.666
	0.047*	0.040*	0.016*	0.208	0.035*	0.007*	<0.001*		0.458	0.006*	0.054	0.435	0.192	0.690	0.006	0.001
p53	Pos	0.149	0.112	0.145	0.272	0.285	0.155	0.171	1	0.346	−0.008	Pos	Pos	0.167	0.289	0.261
	0.190	0.530	0.657	0.520	0.220	0.198	0.503	0.458		0.125	0.972	0.340	0.332	0.470	0.217	0.266
Bcl-2	Pos	0.583	0.138	0.208	0.815	0.518	0.624	0.580	0.346	1	0.548	Pos	Pos	−0.271	0.391	0.605
	<0.001*	0.007*	0.584	0.365	<0.001*	0.016	0.002	0.006*	0.125		0.010*	0.377	0.115	0.235	0.088	0.005*
Ki67	Pos	0.477	0.173	0.275	0.469	0.381	0.511	0.426	−0.008	0.548	1	Pos	Neg	−0.022	0.419	0.552
	0.105	0.033*	0.492	0.216	0.028*	0.080	0.018*	0.054	0.972	0.010*		0.113	0.365	0.926	0.066	0.012*
Podoplanin		Pos	Neg	Neg	Pos	Pos	Pos	Pos	Pos	Pos	Pos	1	1	Neg	Pos	Pos
	0.368	0.487	0.101	0.099	0.253	0.543	0.140	0.435	0.340	0.377	0.113			0.259	0.260	0.134
Synaptophysin		Pos	Pos	Neg	Pos	Pos	Pos	Pos	Pos	Pos	Neg	1	1	Neg	Pos	Pos
	0.045*	0.104	0.389	0.709	0.546	0.116	0.136	0.192	0.332	0.115	0.365			0.654	0.663	0.183
PTEN	Neg	−0.384	0.577	0.465	−0.319	0.056	−0.104	0.093	0.167	−0.271	−0.022	Neg	Neg	1	0.126	−0.029
	0.069	0.095	0.012*	0.034*	0.159	0.809	0.654	0.690	0.470	0.235	0.926	0.259	0.654		0.595	0.904
Pax8n	Pos	0.403	0.588	0.518	0.228	0.449	0.815	0.590	0.289	0.391	0.419	Pos	Pos	0.126	1	0.877
	0.353	0.078	0.010*	0.019*	0.334	0.047*	<0.001*	0.006*	0.217	0.088	0.066	0.260	0.663	0.595		<0.001
Pax8c	Pos	0.580	0.497	0.416	0.333	0.483	0.887	0.666	0.261	0.605	0.552	Pos	Pos	−0.029	0.877	1
	0.018*	0.007*	0.036*	0.068	0.152	0.031*	<0.001	0.001	0.266	0.005*	0.012*	0.134	0.183	0.904	<0.001

*, significant P value (<0.05). n, nuclear staining; c, cytoplasmic staining; Pos, positive correlation in the Mann-Whitney-U-test; Neg, negative correlation in the Mann-Whitney-U-test.