Skip to main content
. 2016 Oct 21;17:820. doi: 10.1186/s12864-016-3150-z

Table 6.

Substitutions in PEBP-family paralogous comparisons and estimated divergence time

Subfamily Species No. of pairs analyzed Localization on sister branches Divergence time (mya) Ka Ka/Ks
BFT Gm 1 yes 15.9 0.01 0.08
Ad 1 genus-specific 9.1 0.05 0.53
Ad 1 no 94.5 0.21 0.21
Ai 3 genus-specific 18.1 0.03 0.16
Ai 1 no 110.8 0.21 0.18
Ca 2 no 62.4 0.13 0.20
FTa Cc 1 no 79.6 0.13 0.15
Gm 2 no 47.3 0.08 0.16
Gm 1 yes 11.0 0.03 0.22
La 1 yes 32.6 0.06 0.18
Mt 1 no 46.0 0.12 0.26
Pv 1 no 90.8 0.13 0.14
Vr 1 no 63.2 0.13 0.20
Ad 2 no 69.0 0.14 0.21
Ai 2 no 67.3 0.14 0.21
Cc 1 no 56.5 0.16 0.28
Gm 4 no 54.0 0.19 0.34
FTb Lj 1 no 56.5 0.18 0.31
Mt 1 yes 12.2 0.04 0.34
Pv 1 no 73.2 0.19 0.25
Vr 3 no 66.7 0.22 0.32
Vr 1 yes 11.2 0.02 0.14
FTc Gm 1 yes 7.2 0.02 0.21
La 1 yes 41.4 0.11 0.26
Ad 1 no 139.3 0.37 0.26
MFT Ai 1 no 170.6 0.38 0.21
La 1 no 162.2 0.37 0.22
La 1 yes 28.0 0.09 0.32
Ad 1 no 87.2 0.20 0.22
Ai 2 no 114.3 0.24 0.22
Ca 1 no 81.9 0.16 0.19
Ca 2 yes 4.5 0.01 0.50
Cc 2 no 119.5 0.14 0.12
Gm 2 no 131.2 0.17 0.12
TFL1 Gm 2 yes 4.9 0.02 0.40
La 1 no 112.0 0.15 0.13
La 2 yes 25.0 0.04 0.17
Lj 1 no 43.0 0.17 0.38
Mt 2 no 112.4 0.19 0.16
Pv 2 no 140.6 0.13 0.09
Vr 2 no 152.8 0.15 0.10