Table 5.

Overlap between the top subnetwork markers identified on different gene expression datasets

		Chuang	HPRD	GASOLINE	Biogrid
Greedy		5.63 %	4.05 %	4.88 %	3.96 %
AP-based		24.90 %	28.70 %	27.71 %	23.89 %
jac_p		37.89 %	29.28 %	32.01 %	31.97 %
kul_p		15.38 %	27.52 %	26.49 %	28.26 %
tve_p		25.80 %	44.15 %	50.57 %	42.33 %
jac_lc	β=0.25	39.10 %	22.54 %	26.55 %	30.20 %
	β=0.5	53.51 %	26.68 %	26.87 %	37.94 %
	β=0.75	54.55 %	31.74 %	26.67 %	40.12 %
kul_lc	β=0.25	12.73 %	24.47 %	27.90 %	28.50 %
	β=0.5	39.86 %	28.29 %	31.18 %	33.26 %
	β=0.75	50.61 %	35.53 %	31.42 %	40.73 %
tve_lc	β=0.25	27.53 %	44.47 %	46.75 %	36.57 %
	β=0.5	32.14 %	43.47 %	52.41 %	54.90 %
	β=0.75	32.99 %	50.94 %	57.71 %	69.05 %