Table 2.
Distribution of relative elements in upstream 3000 bp sequences of soybean CYS genes.
Gene CYS | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 | 11 | 12 | 13 | 14 | 15 | 16 | 17 | 18 | 19 | 20 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ABRE | 4 | 2 | 3 | 2 | 1 | 2 | 2 | 3 | 4 | 1 | 1 | 3 | 2 | 3 | 1 | 2 | ||||
ARE | 1 | 1 | 2 | 4 | 4 | 4 | 2 | 3 | 3 | 4 | 3 | 4 | 3 | 1 | 6 | |||||
GARE-motif | 2 | 5 | 3 | 1 | 2 | 1 | 1 | 1 | 3 | 1 | 2 | 1 | ||||||||
P-box | 1 | 1 | 2 | 1 | 1 | 2 | 1 | 1 | 1 | 3 | 1 | |||||||||
HSE | 2 | 3 | 2 | 1 | 2 | 2 | 3 | 2 | 5 | 7 | 3 | 2 | 2 | 4 | 1 | 2 | 3 | 7 | ||
LTR | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | ||||||||||||||
TC-rich repeats | 4 | 3 | 7 | 2 | 3 | 3 | 3 | 2 | 2 | 5 | 2 | 6 | 4 | 3 | 4 | 5 | 1 | 5 | 5 | |
TGA-element | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | |||||||||
TGACG-motif | 3 | 2 | 3 | 3 | 3 | 3 | 4 | 2 | 7 | 3 | 3 | 1 | 1 | 1 | 1 | 2 | 3 | 4 | ||
Circadian | 4 | 5 | 5 | 1 | 1 | 3 | 5 | 5 | 6 | 2 | 4 | 4 | 4 | 4 | 2 | 1 | 3 | 4 | ||
TCA-element | 1 | 1 | 1 | 1 | 3 | 2 | 3 | 4 | 1 | 1 | 2 | 1 | 5 | 2 | 3 | 5 | ||||
MBS | 6 | 2 | 2 | 1 | 3 | 1 | 3 | 3 | 1 | 1 | 4 | 1 | 2 | 1 | ||||||
MBSI | 1 | |||||||||||||||||||
MBSII | 1 | |||||||||||||||||||
Nodule-site2 | 1 | |||||||||||||||||||
Box-W1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 2 | 1 | 2 | 2 | 1 | 1 | ||||||||||
ERE | 1 | 1 | 3 | 3 | 1 | 1 | 3 | |||||||||||||
CCAAT-box | 1 | 2 | 1 | 1 | 1 | 1 | ||||||||||||||
WUN-motif | 1 | 1 | 1 | 2 | 2 | 1 | 2 | |||||||||||||
AuxRR-core | 1 | 1 | ||||||||||||||||||
TATC-box | 1 | 1 | 1 | 1 | ||||||||||||||||
CE3 | 1 | 1 | ||||||||||||||||||
ELI-box3 | 1 | 1 | ||||||||||||||||||
TGA-box | 1 |