Table 3.
Polymorphic sites found in the mtDNA D-loop region of the duck populations considered in the present study
| Nucleotide position in mtDNA D-loop region1 | |||||||||||||||||
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| Polymorphism | InDel | ||||||||||||||||
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| Haplotype | 1 | 1 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 3 | 3 | 4 | 6 | 2 |
| 8 | 9 | 0 | 0 | 1 | 2 | 4 | 5 | 5 | 7 | 7 | 9 | 2 | 4 | 3 | 0 | 5 | |
| 2 | 4 | 0 | 2 | 9 | 8 | 3 | 2 | 4 | 2 | 5 | 7 | 6 | 2 | 8 | 8 | 3 | |
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| Hap_01 | C | C | T | T | C | A | A | C | T | C | C | G | C | T | C | T | Δ |
| Hap_02 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | A | - | - | - | - | - |
| Hap_03 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | T | - | A | - | - | - | C | - |
| Hap_04 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | T | - | A | - | - | - | - | - |
| Hap_05 | - | - | - | - | - | G | - | - | - | - | - | A | T | - | - | - | - |
| Hap_06 | - | - | - | - | T | - | - | - | - | T | - | A | - | - | - | C | - |
| Hap_07 | - | - | - | - | - | G | - | - | - | - | - | A | - | - | - | - | - |
| Hap_08 | - | T | - | - | - | - | - | - | - | - | - | A | - | - | - | - | - |
| Hap_09 | - | - | - | - | - | - | - | T | - | - | - | A | - | - | - | - | - |
| Hap_10 | T | - | - | A | - | - | - | - | - | T | - | A | - | - | - | C | - |
| Hap_11 | T | - | C | - | - | - | - | - | - | - | - | A | - | C | - | - | - |
| Hap_12 | T | - | C | A | - | - | - | - | - | - | - | A | - | C | - | - | - |
| Hap_13 | T | - | - | A | - | - | - | - | - | - | - | A | - | - | - | - | - |
| Hap_14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | T | - | A | - | C | - | C | C |
| Hap_15 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | A | - | C | - | - | - |
| Hap_16 | T | - | C | - | - | - | - | - | - | T | - | A | - | - | - | C | - |
| Hap_17 | - | - | - | A | - | - | - | - | - | - | - | A | - | - | - | - | C |
| Hap_18 | - | - | - | A | - | - | - | - | - | - | - | A | - | C | - | - | - |
| Hap_19 | - | - | C | - | T | - | - | - | - | T | - | A | - | - | - | C | - |
| Hap_20 | - | - | C | - | - | - | - | - | - | - | - | A | - | - | - | - | - |
| Hap_21 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | A | - | - | - | C | - |
| Hap_22 | - | - | - | - | - | - | G | - | - | - | - | A | - | - | - | - | - |
| Hap_23 | - | - | - | A | - | - | - | - | C | - | - | A | - | - | - | - | - |
| Hap_24 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | A | - | - | T | - | - |
| Hap_25 | - | - | - | - | - | - | - | - | C | - | - | A | - | - | - | - | - |
| Hap_26 | - | - | - | - | - | - | - | T | - | - | T | A | - | - | - | - | - |
| Hap_27 | - | - | C | - | - | - | - | T | C | - | - | A | - | - | - | - | - |
| Hap_28 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | T | A | - | - | - | - | - |
1
Numbers indicate nucleotide base position in mitochondrial D-loop region;the hyphen (-) indicates that the nucleotide is identical to that in the Hap-1 sequence.