Table 4.
Molecular characteristics of meningococcal carriage isolates in 4 kebeles in Arba Minch, Southern Ethiopia
| Sero-group | ST-complex | ST | PorA | FetA | n | Kebelea | |||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| A | B | C | D | ||||||
| B | 35 | 35 | P1.22-1,14 | F4-1 | 1 | 1 | |||
| 10450 | P1.22-1,14 | F4-1 | 1 | 1 | |||||
| C | 103 | 11592 | P1.5-1,10-4 | F3-9 | 5 | 2 | 3 | ||
| 35 | 35 | P1.22-1,14 | F4-1 | 1 | 1 | ||||
| 175 | 8447 | P1.5-1,2-2 | F5-8 | 1 | 1 | ||||
| W | 11 | 11 | P1.5,2 | F1-1 | 26 | 12 | 7 | 5 | 2 |
| F1-7 | 1 | 1 | |||||||
| 2724 | P1.5,2 | F1-1 | 1 | 1 | |||||
| 7849 | P1.5,2 | F1-1 | 1 | 1 | |||||
| X | 181 | 181 | P1.5-1,10-1 | F3-22 | 4 | 4 | |||
| P1.5-1,10-1 | F1-7 | 2 | 2 | ||||||
| P1.5-1,10-1 | F4-23 | 1 | 1 | ||||||
| 11372 | P1.5-1,10-1 | F4-23 | 48 | 2 | 12 | 21 | 13 | ||
| 11591 | P1.5-1,10-1 | F4-23 | 6 | 1 | 5 | ||||
| 41/44 | 207 | P1.12-1,13-2 | F5-169 | 3 | 1 | 2 | |||
| F1-7 | 2 | 2 | |||||||
| F1-21 | 1 | 1 | |||||||
| F3-60 | 1 | 1 | |||||||
| 1053 | P1.12-1,13-2 | F5-169 | 1 | 1 | |||||
| Y | 167 | 2880 | P1.5-1,10-1 | F1-3 | 8 | 3 | 3 | 1 | 1 |
| 767 | P1.5-1,10-1 | F1-3 | 1 | 1 | |||||
| NG | 167 | 2880 | P1.5-1,10-8 | F1-3 | 9 | 1 | 2 | 5 | 1 |
| 175 | 175 | P1.22-11,15-25 | F5-1 | 1 | 1 | ||||
| P1.22-11,15-56 | F5-1 | 3 | 3 | ||||||
| 8447 | P1.5-1,2-2 | F5-8 | 1 | 1 | |||||
| 178 | 178 | P1.19,15 | F5-8 | 1 | 1 | ||||
| 181 | 11372 | P1.5-1,10-1 | F4-23 | 1 | 1 | ||||
| 192 | 192 | P1.18-11,42-1 | Neg | 284 | 79 | 77 | 118 | 10 | |
| 11598 | P1.18-11,42-1 | Neg | 1 | 1 | |||||
| 11642 | P1.18-11,42-1 | Neg | 1 | 1 | |||||
| 198 | 198 | P1.18,25-11 | F5-5 | 3 | 2 | 1 | |||
| P1.25-11,38-1 | F5-5 | 1 | 1 | ||||||
| 11741 | P1.18,25-37 | F1-7 | 1 | 1 | |||||
| P1.18,25-65 | F1-7 | 2 | 1 | 1 | |||||
| 35 | 35 | P1.22-1,14 | F4-1 | 4 | 1 | 3 | |||
| 53 | 53 | P1.7,3 | F1-7 | 2 | 2 | ||||
| P1.7,30 | F1-3 | 2 | 2 | ||||||
| F1-49 | 1 | 1 | |||||||
| F1-7 | 7 | 2 | 5 | ||||||
| F3-69 | 1 | 1 | |||||||
| P1.7,30-2 | F1-215 | 1 | 1 | ||||||
| F1-7 | 4 | 1 | 3 | ||||||
| F2-28 | 1 | 1 | |||||||
| F5-9 | 1 | 1 | |||||||
| P1.7,30-3 | F1-31 | 1 | 1 | ||||||
| F1-7 | 5 | 5 | |||||||
| P1.7,30-4 | F1-7 | 1 | 1 | ||||||
| P1.7,30-4 | F1-7 | 1 | 1 | ||||||
| P1.7-11,30 | F1-21 | 2 | 2 | ||||||
| F3-69 | 1 | 1 | |||||||
| F6-6 | 1 | 1 | |||||||
| P1.7-11,30-2 | F1-21 | 1 | 1 | ||||||
| P1.7-11,30-3 | F1-3 | 1 | 1 | ||||||
| P1.7-2,30 | F1-182 | 2 | 2 | ||||||
| P1.7-2,30-3 | F1-7 | 2 | 2 | ||||||
| P1.7-2,30-6 | F1-7 | 1 | 1 | ||||||
| 2075 | P1.7,30 | F1-113 | 1 | 1 | |||||
| P1.7-2,30 | F1-153 | 2 | 2 | ||||||
| F3-28 | 1 | 1 | |||||||
| P1.7-2,30-3 | F1-153 | 3 | 3 | ||||||
| P1.7-2,30-5 | F1-153 | 1 | 1 | ||||||
| P1.7-54,30 | F1-24 | 1 | 1 | ||||||
| 7389 | P1.7-2,30 | F1-7 | 1 | 1 | |||||
| 11594 | P1.7,30-2 | F1-7 | 1 | 1 | |||||
| UAb | 11587 | P1.18-1,3-8 | F4-72 | 1 | 1 | ||||
| P1.18-11,42-1 | F5-102 | 1 | 1 | ||||||
| 11595 | P1.18-1,3 | F4-72 | 4 | 4 | |||||
| 11597 | P1.22-11,15-25 | F1-36 | 2 | 2 | |||||
| 11624 | P1.18-1,3 | F4-72 | 1 | 1 | |||||
| 11638 | P1.18-1,3-8 | F4-72 | 1 | 1 | |||||
| UA | 11593 | P1.22-1,14 | F5-19 | 1 | 1 | ||||
| 11617 | P1.22-11,15-57 | F5-7 | 2 | 2 | |||||
ST sequence type, CC clonal complex, n number of isolates, NG non-groupable, UA unassigned to any clonal complex, Neg negative
aKebele: Genta Mechie (A), Zigiti Mechie (B), Gatse (C) and Kolla Shelle (D)
bUA cluster related to ST-11587