Table 5.

Natural prevalence of NS5B nucleotide and nonnucleoside inhibitor resistance-associated variants (RAVs) detected by population sequencing and mean fold change in resistance associated with RAVs.

Position	Variant	Resistant to	Natural prevalence in HCV genotype							Mean fold change in resistance compared to wild-type replicon		References
			1a	1b	2	3	4	5	6	Sofosbuvir	Dasabuvir
S28	2T	SOF	n.o.	n.o.	n.o.	n.o.	n.d.	n.d.	n.d.	16		[87, 142, 176–180]
M289	I/L	SOF	n.o.	1.8%	3.5%	n.d.	n.d.	n.d.	n.d.			[176]
C316	Y	DSV	0.2–1.2%	n.o.	n.d.	n.d.	n.d.	n.d.	n.d.		1472 (GT 1a) 1569 (GT 1b)	[86, 87, 100, 165, 175]
C316	N	DSV/SOF	n.o.	10.9–35.6%	n.d.	n.d.	7.9%	n.d.	n.d.			[86, 87, 165, 181]
C316	H	DSV/SOF	n.o.	1.9–2.1%	n.d.	n.d.	n.d.	n.d.	n.d.			[86, 165]
L320	F	SOF	n.o.	n.o.	n.d.	n.d.	n.d.	n.d.	n.d.			[176]
S368	T	DSV	n.o.	n.o.	n.d.	n.d.	n.d.	n.d.	n.d.			[86]
N411	S	DSV	n.o.	n.o.	n.d.	n.d.	n.d.	n.d.	n.d.			[86, 142]
M414	T	DSV	0.5%	0.4%	n.d.	n.d.	n.d.	n.d.	n.d.		32 (GT 1b)	[87, 100, 175, 182]
M414	I	DSV	n.o.	n.o.	n.d.	n.d.	n.d.	n.d.	n.d.			[87, 142]
E446	K/Q	DSV	n.o.	n.o.	n.d.	n.d.	n.d.	n.d.	n.d.			[165]
Y448	C	DSV	n.o.	n.o.	n.d.	n.d.	n.d.	n.d.	n.d.			[86, 87, 142]
Y448	H	DSV	0.2%	1.3%	n.d.	n.d.	n.d.	n.d.	n.d.		975 (GT 1a)	[87, 144]
A553	I/T/V	DSV	6%	n.o.	n.d.	n.d.	n.d.	n.d.	n.d.			[165]
G554	S/D	DSV	n.o.	n.o.	n.d.	n.d.	n.d.	n.d.	n.d.			[86, 87, 142]
S556	G	DSV	0.6–3.1%	7.0–16%	100%	100%	97%	n.d.	n.d.		30 (GT 1a) 11 (GT 1b)	[86, 163, 181, 182]
S556	N/R	DSV	0.6–1.2%	n.o.	n.d.	n.d.	n.d.	n.d.	n.d.			[86, 87, 182]
G558	R	DSV	n.o.	n.o.	n.d.	n.d.	n.d.	n.d.	n.d.			[165]
D559	G	DSV	n.o.	n.o.	n.d.	n.d.	n.d.	n.d.	n.d.			[86, 87, 142]
Y561	H	DSV	n.o.	n.o.	n.d.	n.d.	n.d.	n.d.	n.d.			[165]

SOF: sofosbuvir; DSV: dasabuvir.

n.o.: not observed.

n.d.: no data available.

GT: genotype.