Table 4.

Recombination analysis between Singapore and Guangdong strains

Strain	NT position	Major parent	Minor parent	Av.P-Val methods
				RDP	GENECONV	MaxChi	Chimaera	SiScan	3Sep
FJ196847-Guangdong-1997	994–1701	EU081274	FJ196842	4.882 × 10−9	4.852 × 10−9	8.131 × 10−9	3.788 × 10−9	3.350 × 10−17	3.844 × 10−40
	2238–7197	EF025110	EU081234	3.415 × 10−13	7.161 × 10−10	7.79 × 10−19	3.318 × 10−19	1.389 × 10−28	9.458 × 10−48
	7617–8231	A75711	FJ196846	1.04 × 10−2	3.721 × 10−4	1.21 × 10−4	9.047 × 10−5	9.28 × 10−9	2.032 × 10−4
	8887–10675	FJ196844	FJ196846	6.537 × 10−25	7.002 × 10−23	3.198 × 10−10	1.354 × 10−7	7.451 × 10−35	4.79 × 10−13
FJ196848–Guangdong-1999	1187–1754	EU081274	FJ196842	4.882 × 10−9	4.582 × 10−9	80131 × 10−9	3.788 × 10−9	3.35 × 10−17	3.844 × 10−4
	1626–5978	EF025110	EU081234	3.415 × 10−13	7.161 × 10−10	7.79 × 10−19	3.318 × 10−19	1.369 × 10−28	9.458 × 10−48
	4604–4870	A75711	EU081258	4.921 × 10−3				2.891 × 10−5
	7995–8851	KF971869	FJ196847	1.061 × 10−2	1.681 × 10−4	1.286 × 10−2	2.253 × 10−3	4.58 × 10−13	2.699 × 10−2
	8914–9201	GZ02	FJ196846	3.213 × 10−4	2.303 × 10−6			2.503 × 10−8
EF032589-Guangdong-2004	1300–2514	EF025110	EU081234	3.415 × 10−13	7.161 × 10−10	7.79 × 10−19	3.318 × 10−19	1.369 × 10−28	9.458 × 10−48