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. 2016 Apr 29;10(12):2907–2917. doi: 10.1038/ismej.2016.69

Table 2. Distribution of type-4 pilus protein-encoding orthologs in V. fischeri strainsa.

PILUS LOCIb MshA PilT FlplA PilA1 PilA PilA2 Flp1 Tcp cluster
 VirB2
  VF0355-VF0371 VF0431-VF0432 VF0510-VF0523 VF0571-VF0572 VF2184-VF2191 VFA0148 VFA0217-VFA0232 VF1138 VFA0473-VFA0474 VFA0865-VFA0875 VFB38-VFB44 VFB54-VFB55
STRAINS
 ES114 + + + + + + + + + +    
 MB13B3c + + + + + + + + +      
 MB11B1 + + + + + + + + +      
 KB2B1 + + + + + + + + +      
 MB13B2 + + + + + + + + +     +
 ES213 + + + + + + + + +   + +
 MB14A3 + + +   + + + + +      
 KB4B5 + + + + + + + + +      
 MB15A5 + + +   + + + + +      
 KB1A98 + + +   + + + + +      
 MB13B1 + + +   + + + + +      
 MB15A4 + + +   + + + + +      
 MJ11 + + +   + + + + +      
a

Putative type-4 pilus proteins encoded by V. fischeri strain ES114 that have orthologs in other genome-sequenced squid symbiont strains.

b

+, ortholog present; blank, ortholog absent.

c

Bold indicates the five D-type strains.