Skip to main content
. 2004 Sep;186(18):6159–6167. doi: 10.1128/JB.186.18.6159-6167.2004

TABLE 2.

Oligonucleotides used in this study

Amplified region Primer Nucleotide sequencea
Mutant constructions
    huvA, amino terminal HuvA.A 5′-GCTCTAGAAAGCTTTATCAACAATTGATT-3′
HuvA.B 5′-TCCCCCGGGGGAAAGCTTTGCTTGTCCGCC-3′
    huvA, carboxy terminal HuvA.C 5′-TCCCCCGGGAACGACTACTCTCAAGCTGAG-3′
HuvA.D 5′-GCGAATTCTGGGTAAAGAGGGCGAGTTAC-3′
    huvZ, amino terminal HuvZ.C 5′-GCGGATCCGACGTGCGGGTTCACCTCCAA-3′
HuvZ.D 5′-GCGAATTCTATGATTTTACGAATTTAAAA-3′
    huvZ, carboxy terminal HuvZ.A 5′-GCTCTAGAGCTTCCGTGCCCCTAACTTTA-3′
HuvZ.B 5′-GCGGATCCGACGGCTTAAGCCAGCTGCAA-3′
    huvX, amino terminal HuvX.A 5′-GCTCTAGATGTCGATATCACCGCTTACTT-3′
HuvX.B 5′-GCGGATCCTTTATGGGACGTGAAAGTCAT-3′
    huvX, carboxy terminal HuvX.C 5′-GCGGATCCCATTCCCCAATCCGCTAATGA-3′
HuvX.D 5′-GCAAGCTTGCATCGACTAATTTCGGTTGA-3′
    huvB, amino terminal HuvB.A 5′-GCTCTAGACAAGCGCCCATTGCTTTATAA-3′
HuvB.B 5′-GCGGATCCGTCATTGGAGTGCAGCACGAG-3′
    huvB, carboxy terminal HuvB.C 5′-GCGGATCCGCTCTCGTCGGCGGGTTAGGC-3′
HuvB.D 5′-GCGAATTCGTGAGTAAGAGTGCACCAAGT-3′
    huvC, amino terminal HuvC.A 5′-GCTCTAGACACGCTTTTAAAAACCGTATG-3′
HuvC.B 5′-GCGGATCCGTCATTGGAGTGCAGCACGAG-3′
    huvC, carboxy terminal HuvC.C 5′-GCGGATCCATTGTGACTGCGCTGGTGGGT-3′
HuvC.D 5′-GCGAATTCGCATTATAGCGAAGGGACGCG-3′
    huvD, amino terminal HuvD.A 5′-GCTCTAGACTTGTTGGTCGGCGCAATTTT-3′
HuvD.B 5′-GCGGATCCCTTTGCTAACTCATTCGGTTG-3′
    huvD, carboxy terminal HuvD.C 5′-GCGGATCCTCGTCGCTTGTCGCCGCACAT-3′
HuvD.D 5′-GCGAATTCGCTCGATCAGTGATGCGGTAT-3′
    huvAZXBCD tonB exbBD, carboxy terminal HuvD.C2 5′-TCCCCCGGGTCGTCGCTTGTCGCCGCACAT-3′
Gene amplification
    huvA huvA-5′ 5′-GCGAATTCTGGTGACAGCAGCGGCATCC-3′
huvA-Eco-3′ 5′-GCGAATTCAGGAGTTCATGGAACAACAAAGCC-3′
    huvX VA-huvZ-D 5′-GCGAATTCTATGATTTTACGAATTTAAAA-3′
VA-HutZ-1 5′-CTCACATTCGGACGGCCTTCA-3′
    huvZ ΔhuvX PX3 5′-GCCTTTTCTTACAATGTCC-3′
VA-TonB-4 5′-TGGTTTGGGCTTGTTGGCTC-3′
a

Restriction sites for Xbal, BamHI, HindIII, EcoRI, and Sma1 are underlined.