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. 2016 Dec 13;11(12):e0167966. doi: 10.1371/journal.pone.0167966

Table 3. Description of the primers and PCR conditions used for the detection of grapevine viruses.

Virus Primers Expected product size (bp) PCR cycling conditions Reference
GLRaV-1 5′ TGGCATCGTTGCTAAATTGAG 3′ A 175 95°C/15 min, 40× (94°C/30 s, 53°C/30 s, 72°C/1 min), 72°C/10 min [11]
5′ AATCCTATGCGTCAGTATGC 3′ S
GRSPaV 5′ CACATRTCATCVCCYGCAAA 3′ A 476 95°C/15 min, 40× (94°C/55 s, 50°C/55 s, 72°C/55 s), 72°C/10 min [25]
5′ AGRYTTAGRGTRGCTAARGC 3′ S
GPGV 5′ CTGAGAAGCATTGTCCCATC 3′ A 303 95°C/15 min, 40× (94°C/55 s, 55°C/55 s, 72°C/55 s), 72°C/10 min [13]
5′ ATTGCGGAGTTGCCTTCAAG 3′ S
GVA 5′ TCGAACATAACCTGTGGCTC 3′ A 271 95°C/15 min, 40× (94°C/45 s, 50°C/45 s, 72°C/1 min), 72°C/10 min [26]
5′ GAGGTAGATATAGTAGGACCT 3S
GVB 5′ GTGCTAAGAACGTCTTCACAGC 3′ A 158 95°C/15 min, 40× (94°C/45 s, 50°C/45 s, 72°C/1 min), 72°C/10 min [27]
5′ AGTAGCCCTTCGTTTAGCCGC 3′ S
GFkV 5′ CGACGCAGGCGTCATTGCG 3′ A 520 95°C/15 min, 40× (94°C/55 s, 55°C/55 s, 72°C/55 s), 72°C/10 min [28]
5′ CCGTCTGCTGACCAGCCTG 3′ S
GSyV-1 5′ CGACGCAGGCGTCATTGCG 3′ A 374 95°C/15 min, 40× (94°C/40 s, 56°C/40 s, 72°C/50 s), 72°C/10 min [29]
5′ CCGTCTGCTGACCAGCCTG 3′ S
GRVFV 5′ ATGTTGGTCTTCACGTGSAC 3′ A 266 95°C/15 min, 40× (94°C/40 s, 55°C/40 s, 72°C/50 s), 72°C/10 min this study
5′ GTCCTCGGCCCAGTGAAAA 3′ S
HSVd 5′ GTTGGAAGACGAACCGAGAG 3′ A 171 95°C/15 min, 40× (94°C/40 s, 55°C/40 s, 72°C/50 s), 72°C/10 min this study
5′ GGGCAACTCTTCTCAGAATCC 3′ S
GYSVd-1 5′ ACTTCATGGTGGTGCCGGTG 3′ A 374 95°C/15 min, 40× (94°C/55 s, 55°C/55 s, 72°C/55 s), 72°C/10 min [30]
5′ CCAATGGGTCGCACTTGTTG 3′ S

Primers: A antisense S sense