Table 1. Rules used to define events based on distribution of variant and reference read counts in matching RNA and DNA datasets from the same individual.
RNAed | T-RNAed | VSE | T-VSE | VSL | T-VSL | LOH | SOM | |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
gDNA | REF HOM | REF HOM | HET | HET | HET | HET | HET | REF HOM |
nRNA | BiAl or VAR DOM | REF DOM | VAR DOM | BiAl | REF DOM | BiAl | BiAl or REF DOM or VAR DOM | REF DOM |
sDNA | REF HOM | REF HOM | HET | HET | HET | HET | REF HOM or VAR HOM | HET or VAR HOM |
tRNA | BiAl or VAR DOM | BiAl or VAR DOM | VAR DOM | VAR DOM | REF DOM | REF DOM | REF DOM or VAR DOM | HET or VAR DOM |