Skip to main content
. 2016 Aug 30;44(22):e161. doi: 10.1093/nar/gkw757

Table 1. Rules used to define events based on distribution of variant and reference read counts in matching RNA and DNA datasets from the same individual.

RNAed T-RNAed VSE T-VSE VSL T-VSL LOH SOM
gDNA REF HOM REF HOM HET HET HET HET HET REF HOM
nRNA BiAl or VAR DOM REF DOM VAR DOM BiAl REF DOM BiAl BiAl or REF DOM or VAR DOM REF DOM
sDNA REF HOM REF HOM HET HET HET HET REF HOM or VAR HOM HET or VAR HOM
tRNA BiAl or VAR DOM BiAl or VAR DOM VAR DOM VAR DOM REF DOM REF DOM REF DOM or VAR DOM HET or VAR DOM