Table 3. Affinities of APE1 for ORNs and their duplexesa.
| Ligand | IC50 (μM)a | KI (μM) | Ligand | IC50 (μM)b | KI (μM) | Ligand | IC50 (μM)b | KI (μM) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ss ORNs | ||||||||
| AMP | 1120 | 373 | UMP | 5620 | 1873 | CMP | 1340 | 447 |
| (pA)2 | 789 | 263 | (pC)2 | 949 | 316 | |||
| (pA)3 | 597 | 199 | ||||||
| (pA)4 | 550 | 183 | (pU)4 | 2100 | 700 | (pC)4 | 641 | 214 |
| (pA)6 | 300 | 100 | (pU)6 | 1129 | 339 | (pC)6 | 361 | 120 |
| (pA)8 | 110 | 36.7 | (pU)8 | 534 | 178 | (pC)8 | 212 | 70.8 |
| (pA)9 | 80.7 | 26.9 | (pU)9 | 475 | 158 | |||
| (pA)10 | 80 | 26.7 | (pU)10 | 471 | 157 | (pC)10 | 134 | 44.7 |
| (pA)12 | 90 | 30 | (pU)11 | 477 | 159 | (pC)14 | 114 | 38 |
| (pA)16 | 90 | 30 | (pU)16 | 455 | 158 | |||
| ds ORNs | ||||||||
| (pU)4·(pA)4 | 405 | 135 | (pA)4·d(pT)4 | 22.7 | 7.59 | |||
| (pU)6·(pA)6 | 49.8 | 16.6 | (pA)6·d(pT)6 | 64.1 | 21.4 | |||
| (pU)9·(pA)9 | 50 | 16.7 | (pA)8·d(pT)8 | 18.93 | 6.3 | |||
| (pU)10·(pA)10 | 30 | 10 | (pA)10·d(pT)10 | 7.5 | 2.5 | |||
| (pA)11·d(pT)11 | 7.5 | 2.5 | ||||||
| (pU)16·(pA)16 | 30 | 10 | (pA)16·d(pT)16 | 7.5 | 2.5 |
aError in directly determined KI (shown in bold) and IC50 values was 10–30%; means of three to four measurements are given.
bKI values not in bold were calculated from the respective IC50 values.