TABLE 4.

Distribution of 12 regions associated with virulence among V. cholerae natural isolates as determined by PCR analysis^a

Strain type and name	VSP-I (0175-0185)	MSHA (0398-0411)	hlyA (0489)	VSP-II (0490-0516)	VPI-I (0819-0847)	PilE (0857)	RTX (1447-1451)	RS1 (1452-1455)	CTXφ (1456-1464)	TLC (1465-1480)	VPI-2 (1758-1809)	intl4 (vca0291)
O1 classical
O395	−	+	+	−	+	+	+	−	+	+	+	+
569B	−	+	+	−	+	+	+	−	+	+	+	+
C1	−	+	+	−	+	+	+	−	+	+	+	+
C14	−	+	+	−	+	+	+	−	+	+	+	+
CA401	−	+	+	−	+	+	+	−	+	+	+	+
GP12	−	+	+	−	+	+	+	−	+	+	+	+
O1 E1 Tor
GP33	+	+	+	+	+	+	+	+	+	−	+	+
GP43	+	+	+	−	+	+	+	+	+	+	+	+
GP155	−	+	+	−	+	+	+	+	+	+	+	+
N16961	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+
3038	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+
F1873	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+
F1875	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+
F1939	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+
SM115	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+
2125-98	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+
2164-78	−	+	+	−	+	+	+	+	+	−	+	+
Pre-seventh pandemic E1 Tor strains
RV79	−	+	+	−	+	+	+	+	+	+	−	+
C5	+	+	+	+	+	+	+	−	+	+	+	+
Nontoxigenic El Tor strains
2740-80	−	+	+	−	+	+	+	−	−	+	+	+
468-83	−	+	+	−	−	+	+	−	−	−	+	+
O1 strains of unknown biotype
1528-79	−	+	+	−	−	+	+	−	−	−	−	+
917-84	−	+	+	−	+	+	+	−	+	+	+	+
O139
36054-98	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+*	+
SG20	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+*	+
AS207	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+*	+
AS209	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+*	+
AS212	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+*	+
AS213	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+*	+
AS231	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+*	+
AS259	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+*	+
AS260	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+*	+
35636-97	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+*	+
MO2	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+
MO10	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+*	+
MO45	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+*	+
Non-O1/non-O139 strains
151	−	+	+	−	+	+	+	−	+	−	+	+
CO476	−	+	+	−	−	+	+	−	−	+	−	−
VO7	+	+	+	−	+	+	+	−	−	+	−	+
CO130	−	+	+	−	+	+	+	+	+	+	−	+
V45	−	+	+	−	+	+	+	−	+	+	+	+
V46	−	+	+	−	+	+	+	+	+	−	+	+
V47	−	+	+	−	+	+	+	+	+	−	+	+
V52	−	+	+	−	+	+	+	+	+	+	+	+
V53	−	+	+	−	+	+	+	+	+	+	+	+
V54	−	+	+	−	+	+	+	+	+	+	+	+
SG3	−	+	+	−	−	+	+	+	+	−	−	+
SG6	−	+	+	−	−	+	+	−	−	+	−	+
SG7	−	+	+	−	−	+	+	−	−	+	−	+
SG8	−	+	+	−	−	+	+	−	−	+	−	+
SG9	−	+	+	−	−	+	+	−	−	−	−	+
SG10	−	+	+	−	−	+	+	+	−	+	−	+
SG14	−	+	+	−	−	+	+	+	−	+	+	+
AM112	−	+	+	−	−	+	+	−	−	+	+	+
VIG1613	−	+	+	−	−	+	+	−	−	−	+	+
DK59	−	+	+	−	−	+	+	−	−	−	−	+
DK67	−	+	+	−	−	+	+	−	−	−	−	+
DK71	−	+	+	−	−	+	+	−	−	−	+	+
SCE4	−	+	+	−	+	+	+	−	−	−	+	+
SCE188	−	+	+	−	+	+	+	+	+	+	+	+
208	−	+	+	−	+	+	+	+	+	−	−	+
C43	−	+	+	−	−	+	+	−	−	−	+	+
9581	−	+	+	−	+	+	+	−	−	−	+	+
9582	−	+	+	−	+	+	+	−	−	−	+	+

^aThe numbers in parentheses. refer to the genetic organization, e.g., 0175 is VC0175. Asterisks denote strains that only contain the phage-like region of VP1-2; the nan-nag region and restriction modification system are absent. +, present; −, absent.