Table 1. Number of bands produced by RFLP analysis of cpn60 UT sequences from reference phytoplasma strains of cpn60 UT groups.
No. of bands generated | ||||||||
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cpn60 UT group | Strain | AluI | BfaI | HinfI | HpaI | MseI | RsaI | TaqI |
cpn60 UT I | ||||||||
cpn60 UT I-IA | AY-Ruta | 6 | 2 | 3 | 1 | 6 | 4 | 1 |
cpn60 UT I-IIA | GD | 5 | 2 | 3 | 2 | 7 | 4 | 1 |
cpn60 UT I-IB | SF1 | 7 | 2 | 3 | 1 | 6 | 5 | 1 |
cpn60 UT I-IIB | AY-J | 5 | 2 | 3 | 1 | 7 | 5 | 1 |
cpn60 UT I-IIIB | MBS-Ver | 6 | 2 | 3 | 1 | 7 | 5 | 1 |
cpn60 UT I-IVB | MBS-Pueb | 5 | 2 | 4 | 1 | 7 | 5 | 1 |
cpn60 UT I-VB | IPY | 7 | 2 | 3 | 1 | 6 | 4 | 1 |
cpn60 UT I-VIB | ED | 6 | 2 | 3 | 1 | 6 | 4 | 1 |
cpn60 UT I-IC | AY-Col | 6 | 2 | 4 | 1 | 5 | 4 | 1 |
cpn60 UT I-IE | BbSP | 6 | 2 | 4 | 1 | 7 | 4 | 1 |
cpn60 UT I-IF | AY-A | 5 | 2 | 4 | 1 | 6 | 5 | 1 |
cpn60 UT I-IP | PopD | 6 | 1 | 4 | 1 | 5 | 4 | 1 |
cpn60 UT II | ||||||||
cpn60 UT II-IA | PnWB | 6 | 1 | 5 | 1 | 9 | 1 | 1 |
cpn60 UT V | ||||||||
cpn60 UT V-IA | FD | 5 | 2 | 3 | 1 | 14 | 1 | 3 |
cpn60 UT VII | ||||||||
cpn60 UT VII-IA | AshY | 5 | 1 | 3 | 1 | 12 | 1 | 1 |
cpn60 UT IX | ||||||||
cpn60 UT IX-IH | Cr | 6 | 1 | 3 | 1 | 6 | 1 | 2 |
cpn60 UT IX-IB | SA213 | 6 | 2 | 3 | 1 | 5 | 2 | 3 |
cpn60 UT X | ||||||||
cpn60 UT X-IA | AP | 3 | 1 | 4 | 2 | 6 | 1 | 2 |
cpn60 UT X-IC | 12MG305 | 3 | 2 | 4 | 1 | 5 | 1 | 2 |
cpn60 UT X-IF | ESFY | 3 | 1 | 4 | 1 | 8 | 1 | 1 |
cpn60 UT XII | ||||||||
cpn60 UT XII-IA | BN44948 | 1 | 2 | 6 | 1 | 7 | 2 | 3 |
cpn60 UT XII-IB | AT | 1 | 2 | 6 | 1 | 8 | 2 | 3 |
cpn60 UT XIII | ||||||||
cpn60 UT XIII-IA | MPV-S83 | 7 | 1 | 6 | 1 | 9 | 3 | 2 |
cpn60 UT XIV | ||||||||
cpn60 UT XIV-IA | AL85/11 | 4 | 1 | 3 | 1 | 10 | 2 | 2 |
cpn60 UT XIV-IC | RS59/11 | 4 | 1 | 4 | 1 | 9 | 2 | 2 |