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. 2016 Dec;66(12):5600–5613. doi: 10.1099/ijsem.0.001501

Table 3. Nucleotide similarity obtained from the alignment of cpn60 UT sequences from reference phytoplasma strains.

cpn60 UT classification Strains 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24
1 cpn60 UT I-IA AY-Ruta 1
2 cpn60 UT I-IIA GD 0.98 1
3 cpn60 UT I-IB SF1 0.97 0.97 1
4 cpn60 UT I-IIB AY-J 0.97 0.97 0.99 1
5 cpn60 UT I-IIIB MBS-Ver 0.97 0.97 0.99 0.99 1
6 cpn60 UT I-IVB MBS-Pueb 0.97 0.97 0.99 0.99 0.99 1
7 cpn60 UT I-VB IPY 0.97 0.97 0.99 0.99 0.99 0.99 1
8 cpn60 UT I-VIB ED 0.97 0.97 0.99 0.99 0.99 0.99 0.99 1
9 cpn60 UT I-IC AY-Col 0.98 0.98 0.97 0.97 0.97 0.97 0.97 0.97 1
10 cpn60 UT I-IE BbSP 0.97 0.97 0.97 0.96 0.97 0.97 0.97 0.97 0.98 1
11 cpn60 UT I-IF AY-A 0.97 0.97 0.97 0.96 0.97 0.97 0.97 0.97 0.98 0.98 1
12 cpn60 UT I-IP PopD 0.94 0.94 0.94 0.93 0.94 0.94 0.94 0.94 0.94 0.94 0.94 1
13 cpn60 UT II-IA PnWB 0.65 0.65 0.65 0.65 0.65 0.65 0.65 0.65 0.65 0.65 0.66 0.65 1
14 cpn60 UT IX-IA Cr 0.7 0.7 0.7 0.7 0.7 0.7 0.7 0.7 0.7 0.71 0.7 0.69 0.66 1
15 cpn60 UT V-IA FD 0.66 0.66 0.65 0.65 0.65 0.65 0.65 0.65 0.66 0.66 0.66 0.66 0.64 0.69 1
16 cpn60 UT VII-IA AshY 0.62 0.63 0.62 0.62 0.62 0.62 0.62 0.62 0.63 0.63 0.63 0.63 0.63 0.7 0.83 1
17 cpn60 UT X-IA AP 0.76 0.76 0.76 0.76 0.76 0.76 0.76 0.76 0.76 0.76 0.76 0.75 0.64 0.74 0.71 0.69 1
18 cpn60 UT X-IC 12MG305 0.75 0.76 0.76 0.76 0.76 0.76 0.76 0.76 0.76 0.75 0.76 0.76 0.64 0.73 0.7 0.69 0.94 1
19 cpn60 UT X-IF ESFY 0.77 0.78 0.78 0.78 0.78 0.78 0.78 0.78 0.78 0.78 0.78 0.77 0.65 0.74 0.71 0.69 0.95 0.95 1
20 cpn60 UT XII-IA BN44948 0.8 0.79 0.8 0.8 0.8 0.8 0.8 0.8 0.8 0.79 0.79 0.81 0.63 0.69 0.61 0.61 0.74 0.74 0.75 1
21 cpn60 UT XII-IB SYL 0.8 0.79 0.8 0.8 0.8 0.8 0.8 0.8 0.8 0.79 0.79 0.81 0.63 0.68 0.61 0.61 0.74 0.74 0.75 0.99 1
22 cpn60 UT XIII-IA MPV-S83 0.82 0.82 0.82 0.82 0.82 0.82 0.82 0.82 0.83 0.82 0.82 0.84 0.64 0.71 0.65 0.64 0.76 0.78 0.78 0.81 0.81 1
23 cpn60 UT XIV-IA AL85/11 0.69 0.69 0.7 0.7 0.7 0.7 0.7 0.7 0.69 0.7 0.7 0.7 0.67 0.75 0.72 0.71 0.76 0.76 0.76 0.67 0.67 0.69 1
24 cpn60 UT XIV-IC RS59/11 0.68 0.69 0.7 0.7 0.7 0.7 0.7 0.7 0.69 0.7 0.69 0.69 0.67 0.75 0.71 0.7 0.75 0.75 0.76 0.67 0.67 0.68 0.96 1