Table 4. Contact prediction accuracy on 398 membrane proteins.

Method	Short				Medium				Long
	L/10	L/5	L/2	L	L/10	L/5	L/2	L	L/10	L/5	L/2	L
EVfold	0.16	0.13	0.09	0.07	0.28	0.22	0.13	0.09	0.44	0.37	0.26	0.18
PSICOV	0.22	0.16	0.10	0.07	0.29	0.21	0.13	0.09	0.42	0.34	0.23	0.16
CCMpred	0.27	0.19	0.11	0.08	0.36	0.26	0.15	0.10	0.52	0.45	0.31	0.21
plmDCA	0.26	0.18	0.11	0.08	0.35	0.25	0.14	0.09	0.51	0.42	0.29	0.20
Gremlin	0.27	0.19	0.11	0.07	0.37	0.26	0.15	0.10	0.52	0.45	0.32	0.21
MetaPSICOV	0.45	0.35	0.22	0.14	0.49	0.40	0.27	0.18	0.61	0.55	0.42	0.30
Our method	0.60	0.46	0.27	0.16	0.66	0.53	0.33	0.22	0.78	0.73	0.62	0.47