TABLE 3.

Identification of SGIV proteins corresponding to ORFs by MS

Band	ORFa	GenBank accession no.	Protein sequence coverage (%)	Confirmed by RT-PCR (48 h of infection)
1	039L	AAS18054	32	+
2	012L	AAS18027	25	+
3	078L	AAS18093	20
	039L		13
4	060R	AAS18075	15
	039L		15
5	060R		15
	052L	AAS18067	8
6	052L		5
7	012L		13
8	069L	AAS18084	24	+
9	026R	AAS18041	34	+
10	052L		6
	128R	AAS18143	9
11	072R	AAS18087	27
12	016L	AAS18031	24	+
	093L	AAS18108	22	+
13	090L	AAS18105	43	+
	089L	AAS18104	19	+
14	090L		6
15	084L	AAS18099	22
16	060R		7
	089L		14
17	072R		14
18	072R		12
19	101R	AAS18116	24	+
20	046L	AAS18061	25	+
21	018R	AAS18033	29	+
22	082L	AAS18097	47	+
	055R	AAS18070	37	+
23	055R		67
24	156L	AAS18171	30	+
25	160L	AAS18175	24	+
26	/
27	075R	AAS18090	15	+
28	075R		29
29	075R		33
30	075R		43
31	057L	AAS18072	10	+
32	012L		8
	125R	AAS18140	27	+
33	013R	AAS18028	23	+
34	050L	AAS18065	16	+
35	/
36	/
37	/
38	/
39	/

^a/ refers to protein bands that did not identify any proteins reliably.