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. 2016 Aug 12;64(8):1220–1234. doi: 10.1136/jim-2016-000240

Table 1.

Summary of quantitative real time RT-PCR oligonucleotide primers used in measuring mRNA expression in mitochondrial dynamics, mitochondrial biogenesis and synaptic genes

Gene DNA Sequence (5′-3′) PCR product size
Mitochondrial dynamics genes
 Drp1 Forward primer ATGCCAGCAAGTCCACAGAA 86
Reverse primer TGTTCTCGGGCAGACAGTTT
 Fis1 Forward primer CAAAGAGGAACAGCGGGACT 95
Reverse primer ACAGCCCTCGCACATACTTT
 MFN1 Forward primer GCAGACAGCACATGGAGAGA 83
Reverse primer GATCCGATTCCGAGCTTCCG
 MFN2 Forward primer TGCACCGCCATATAGAGGAAG 78
Reverse primer TCTGCAGTGAACTGGCAATG
 Cyclophilin D Forward primer AGATGTCAAATTGGCAGGGGG 91
Reverse primer TGCGCTTTTCGGTATAGTGCT
 Opa1 Forward primer ACCTTGCCAGTTTAGCTCCC 82
Reverse primer TTGGGACCTGCAGTGAAGAA
Mitochondrial biogenesis genes
 PGC1α Forward primer GCAGTCGCAACATGCTCAAG 83
Reverse primer GGGAACCCTTGGGGTCATTT
 Nrf1 Forward primer AGAAACGGAAACGGCCTCAT 96
Reverse primer CATCCAACGTGGCTCTGAGT
 Nrf2 Forward primer ATGGAGCAAGTTTGGCAGGA 96
Reverse primer GCTGGGAACAGCGGTAGTAT
 TFAM Forward primer TCCACAGAACAGCTACCCAA 84
Reverse primer CCACAGGGCTGCAATTTTCC
Reverse primer AGACGGTTGTTGATTAGGCGT
Synaptic genes
 Synaptophysin Forward primer CTGCGTTAAAGGGGGCACTA 81
Reverse primer ACAGCCACGGTGACAAAGAA
 PSD95 Forward primer CTTCATCCTTGCTGGGGGTC 90
Reverse primer TTGCGGAGGTCAACACCATT
Housekeeping genes
 β Actin Forward primer AGAAGCTGTGCTATGTTGCTCTA 91
Reverse primer TCAGGCAGCTCATAGCTCTTC
 GAPDH Forward primer TTCCCGTTCAGCTCTGGG 59
Reverse primer CCCTGCATCCACTGGTGC