Table III. Gene content in plastid genomes of nonphotosynthetic algae.
Parameter | Gene | Pu | He | Pw | Ela | Cpb | Pfb | Co |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Ribosomal large subunit | rpl1 | x | x | x | ||||
rpl2 | x | x | x | x | x | x | ||
rpl3 | x | x | ||||||
rpl4 | x | x | x | |||||
rpl5 | x | x | x | x | x | x | ||
rpl6 | x | x | x | |||||
rpl11 | x | x | ||||||
rpl12 | x | x | x | x | x | |||
rpl13 | x | x | ||||||
rpl14 | x | x | x | x | x | x | x | |
rpl16 | x | x | x | x | x | x | x | |
rpl18 | x | x | ||||||
rpl19 | x | x | x | |||||
rpl20 | x | x | x | x | x | x | ||
rpl21 | x | x | ||||||
rpl22 | x | x | ||||||
rpl23 | x | x | x | x | x | |||
rpl24 | x | |||||||
rpl27 | x | x | ||||||
rpl29 | x | x | ||||||
rpl31 | x | x | ||||||
rpl32 | x | x | x | |||||
rpl33 | x | |||||||
rpl34 | x | |||||||
rpl35 | x | |||||||
rpl36 | x | x | x | x | x | x | x | |
Ribosomal small subunit | rps2 | x | x | x | x | x | ||
rps3 | x | x | x | x | x | x | x | |
rps4 | x | x | x | x | x | x | x | |
rps5 | x | x | x | |||||
rps6 | x | |||||||
rps7 | x | x | x | x | x | x | x | |
rps8 | x | x | x | x | x | x | x | |
rps9 | x | x | x | x | x | |||
rps10 | x | x | ||||||
rps11 | x | x | x | x | x | x | x | |
rps12 | x | x | x | x | x | x | x | |
rps13 | x | x | ||||||
rps14 | x | x | x | x | x | x | ||
rps16 | x | x | ||||||
rps17 | x | x | ||||||
rps18 | x | x | x | |||||
rps19 | x | x | x | x | x | x | x | |
rps20 | x | x | ||||||
Transcription/translation | rpoA | x | x | x | x | x | ||
rpoB1 | x | x | x | x | x | x | x | |
rpoB2 | x | |||||||
rpoC1 | x | x | x | x | x | x | x | |
rpoC2 | x | x | x | x | x | x | x | |
infA | x | |||||||
infB | x | |||||||
infC | x | |||||||
tsf | x | x | ||||||
tufA | x | x | x | x | x | x | x | |
ATP synthase | atpA | x | x | |||||
atpB | x | x | ||||||
atpD | x | |||||||
atpE | x | x | ||||||
atpF | x | |||||||
atpG | x | |||||||
atpH | x | x | ||||||
atpI | x | x | ||||||
Other proteins | accA | x | ||||||
accB | x | |||||||
accD | x | x | ||||||
acpP | x | x | ||||||
cbbX | x | |||||||
cemA | x | |||||||
chlI | x | |||||||
clpC | x | x | ||||||
clpP | x | x | x | |||||
cysT | x | x | ||||||
dnaB | x | |||||||
dnaK | x | x | ||||||
fabH | x | |||||||
ftsH | x | x | x | x | ||||
groEL | x | |||||||
hisS | x | |||||||
ilvB | x | x | ||||||
ilvH | x | x | ||||||
minD | x | |||||||
odpA | x | |||||||
odpB | x | |||||||
petF | x | x | ||||||
psbA | x | |||||||
rbcL | x | x | ||||||
rbcS | x | |||||||
rne | x | |||||||
roaA | x | |||||||
secA | x | x | ||||||
secY | x | x | ||||||
sufB | x | |||||||
sufC | x | |||||||
tatC | x | |||||||
tilS | x | x | ||||||
trpA | x | |||||||
trpG | x | |||||||
ycf1 | x | x | x | |||||
ycf13 | x | |||||||
ycf16 | x | |||||||
ycf19 | x | |||||||
ycf20 | x | |||||||
ycf24 | x | x | ||||||
ycf29 | x | |||||||
ycf67 | x | |||||||
Ribosomal RNAs | rrnF | x | x | x | x | x | ||
rrnL | x | x | x | x | x | x | x | |
rrnS | x | x | x | x | x | x | x | |
Transfer RNAs | 27 | 25 | 27 | 28 | 29 | 34 | 24 |
Secondary plastid of green algal origin. bSecondary plastid of red algal origin.