Table 3.

Impact and functional annotations of detected Indel variations.

Impact	Function	Chr	Gene	Reference	Observation	Alleles
High	FS	chr01	AHDC1	T	TG	het
High	FS	chr01	LRRIQ3	G	GT	het
High	FS	chr10	NOC3L	AT	A	het
High	FS	chr10	TFAM	CA	C	het
High	FS	chr12	TDG	G	GA	het
High	FS	chr14	CCNK	G	GC	het
High	FS	chr14	PAPOLA	TG	T	het
High	FS	chr16	IRX5	AGG	A	het
High	FS	chr17	ACSF2	T	TAA	het
High	FS	chr17	KRT10	CCGCCG	C	het
High	FS	chr17	KRT10	TG	T	het
High	FS	chr19	CAPN12	G	GC	het
High	FS	chr19	KCNC3	C	CG	het
High	FS	chr02	SNED1	A	AC	het
High	FS	chr20	C20orf132	GACCT	G	het
High	FS	chr20	C20orf132	GC	G	het
High	FS	chr20	C20orf132	GAGGAGTT	G	het
High	FS	chr20	C20orf132	CG	C	het
High	FS	chr20	C20orf132	TGG	T	het
High	FS	chr06	TBP	AGC	A	het
High	FS	chr06	TBP	AG	A	het
High	FS	chr06	TFB1M	CAA	C	het
High	FS	chr09	PHF2	A	AG	het
High	FS	chrX	PLXNA3	T	TG	het
High	FS	chrX	RBM10	CA	C	het
High	SSD	chr19	KRI1	CCATCA	C	het
High	SSD	chr19	KRI1	CCATCA	C	het
Moderate	C & D	chr11	SCUBE2	GGCA	G	het
Moderate	C & D	chr12	ATXN2	GGCT	G	het
Moderate	C & D	chr14	MAP3K9	GCCT	G	het
Moderate	C & D	chr19	SAFB2	GTAC	G	het
Moderate	C & D	chr02	GIGYF2	CACA	C	het
Moderate	C & D	chr09	TPRN	TTCC	T	het
Moderate	C & D	chrX	AR	AAGAGACTAGCCCCAG	A	het
Moderate	C & I	chr11	KRTAP5-8	T	TCCG	het
Moderate	C & I	chr14	ATXN3	C	CCTG	het
Moderate	C & I	chr14	IRF2BPL	C	CTGCTGT	het
Moderate	C & I	chr04	HTT	A	AACAGCC	het
Moderate	C & I	chr08	ATAD2	A	ATCG	het
Moderate	CD	chr16	APOBR	TGGGACAGCCTCAGGAGGGGAGGAGGCC	T	het
Moderate	CD	chr17	KDM6B	TCAC	T	het
Moderate	CD	chr18	MBD2	CGCA	C	het
Moderate	CD	chr19	ARID3A	GGGA	G	het
Moderate	CD	chr04	ADAM29	GTGACACCCTCCCAGAGGCAACCTCAGT	G	het
Moderate	CD	chr06	KCNQ5	AGCG	A	het
Moderate	CD	chr06	TBP	GCAA	G	het
Moderate	CD	chr09	RNF20	TGTTGACTCTGAAGACTCA	T	het
Moderate	CI	chr10	C10orf140	C	CCCTCCT	het
Moderate	CI	chr12	EP400	A	ACAG	het
Moderate	CI	chr12	EP400	A	ACAG	het
Moderate	CI	chr12	EP400	G	GCAA	het
Moderate	CI	chr17	KRTAP4-5	T	TGGCAGCAGCTGGGGC	het
Moderate	CI	chr19	ZNF814	C	CATA	het
Moderate	CI	chr04	HTT	A	ACCGCCGCCG	het
Moderate	CI	chr06	TBP	A	ACAG	het
Moderate	CI	chr06	TBP	A	ACAG	het

FS: frame shift, SSD: splice site donor, CD: codon deletion, CI: codon insertion, G & I: codon change plus codon insertion, G & D: codon change plus codon deletion, Chr: chromosome.