Table 6.

Significant marker-trait associations (MTAs) identified for the nine quantitative traits of sugarcane

Trait/marker	2011–2012		2012–2013		2013–2014
	P value	R2 value	P value	R2 value	P value	R2 value
Corrected Brix
IISR_236_590	0.014	0.228	0.002	0.373	0.002	0.388
Commercial cane sugar
IISR_236_590	0.002	0.373	0.002	0.373	0.008	0.291
IISR_88a_300	0.016	0.166	0.025	0.140	0.012	0.183
Fibre content
ESTB157_600	0.012	0.169	0.003	0.221	0.003	0.221
Internode diameter
IISR_317_110	0.001	0.350	0.002	0.297	0.001	0.324
IISR_48_175	0.003	0.303	0.005	0.256	0.001	0.343
IISR_48_1000	0.002	0.323	0.007	0.241	0.001	0.338
Leaf blade width
IISR_140_180	0.002	0.216	0.013	0.146	0.003	0.206
ESTB145_400	0.013	0.137	0.007	0.173	0.006	0.179
Number of millable canes
SEGMS73113a_70	0.016	0.119	0.009	0.167	0.003	0.330
ESTA48_260	0.018	0.187	0.016	0.138	0.005	0.182
IISR_176c_280	0.011	0.136	0.056	0.085	0.019	0.123
Plant height
IISR_279_1100	0.003	0.216	0.000	0.375	0.008	0.186
IISR_308_250	0.019	0.193	0.016	0.231	0.011	0.238
Purity per cent
IISR_146_220	0.007	0.163	0.043	0.106	0.003	0.247
SCA01_800	0.015	0.189	0.003	0.335	0.003	0.328
SEG18_200	0.019	0.177	0.016	0.226	0.012	0.243
ESTB39_200	0.018	0.178	0.007	0.279	0.009	0.264
Sucrose content
IISR_236_590	0.007	0.297	0.003	0.362	0.005	0.327
IISR_114_150	0.012	0.180	0.013	0.179	0.010	0.195
IISR_88a_300	0.019	0.156	0.013	0.179	0.016	0.168