Table 3. Temporal occurrence of respiratory syncytial virus A (RSV-A) variants (rows) detected in Kilifi, Kenya, 2010/2011–2014/2015.
Variant* | Genotype | Epidemic (no. variants/epidemic) |
||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
2010/2011 |
2011/2012 |
2012/2013 |
2013/2014 |
2014/2015 |
||||||
17 | 15 | 13 | 12 | 29 | ||||||
1 | ON1 | |||||||||
2 | ON1 | |||||||||
3 | ON1 | |||||||||
4 | ON1 | |||||||||
5 | ON1 | |||||||||
6 | ON1 | |||||||||
7 | ON1 | |||||||||
8 | ON1 | |||||||||
9 | ON1 | |||||||||
10 | ON1 | |||||||||
11 | ON1 | |||||||||
12 | ON1 | |||||||||
13 | ON1 | |||||||||
14 | ON1 | |||||||||
15 | ON1 | |||||||||
16 | ON1 | |||||||||
17 | ON1 | |||||||||
18 | ON1 | |||||||||
19 | ON1 | |||||||||
20 | ON1 | |||||||||
21 | ON1 | |||||||||
22 | ON1 | |||||||||
23 | ON1 | |||||||||
24 | ON1 | |||||||||
25 | ON1 | |||||||||
26 | ON1 | |||||||||
27 | ON1 | |||||||||
28 | ON1 | |||||||||
29 | ON1 | |||||||||
30 | ON1 | |||||||||
31 | ON1 | |||||||||
32 | ON1 | |||||||||
33 | ON1 | |||||||||
34 | ON1 | |||||||||
35 | GA2 | |||||||||
36 | GA2 | |||||||||
37 | GA2 | |||||||||
38 | GA2 | |||||||||
39 | GA2 | |||||||||
40 | GA2 | |||||||||
41 | GA2 | |||||||||
42 | GA2 | |||||||||
43 | GA2 | |||||||||
44 | GA2 | |||||||||
45 | GA2 | |||||||||
46 | GA2 | |||||||||
47 | GA2 | |||||||||
48 | GA2 | |||||||||
49 | GA2 | |||||||||
50 | GA2 | |||||||||
51 | GA2 | |||||||||
52 | GA2 | |||||||||
53 | GA2 | |||||||||
54 | GA2 | |||||||||
55 | GA2 | |||||||||
56 | GA2 | |||||||||
57 | GA2 | |||||||||
58 | GA2 | |||||||||
59 | GA2 | |||||||||
60 | GA2 | |||||||||
61 | GA2 | |||||||||
62 | GA2 | |||||||||
63 | GA2 | |||||||||
64 | GA2 | |||||||||
65 | GA2 | |||||||||
66 | GA2 |
*A variant was defined as a group of viruses (when group includes a singleton) within a genotype that possesses ≥4 nt differences in the G ectodomain region than other viruses (see Methods). Dark blue, GA2; green, ON1.