Table 1.
Sr. no. | Primer | Sequence | Amplicon (bp) |
---|---|---|---|
1 | VaERD15-3′RACE | 5′-GTTCGTTCCGTTGGCATATCGGACGGT-3′ | |
VaERD15-5′RACE | 5′-CTCAAACTACCAGGAAACCCTAACTCGC-3′ | ||
2 | VaERD15-F(rt VaERD15 -F) | 5′-ATGGCTATGGAGGTAATTTCACGTAC -3′ | 423 |
VaERD15-R(rt VaERD15 -R) | 5′- TTACCGCGGCTGCTGAATCG -3′. | ||
3 | VaERD15- XbalI-F | 5′-GCTCTAGAATGGCTATGGAGGTAATTTCACG-3′ | 439 |
VaERD15-Kpn I -R | 5′-GGGGTACCCCGCGGCTGCTGAATC-3′ | ||
4 | VaERD15-NcoI -F(Southern) | 5′-CTAGccatgg ATGGCTATGGAGGTAATTTCACG-3′ | 442 |
VaERD15-Bglll -R | 5′-GGAagatetCTACGGCGGCTGCTGAATCG-3′ | ||
5 | Actin1-F | 5′-GATTCTGGTGATGGTGTGAGT-3′ | 168 |
Actin1-R | 5′-GACAATTTCCCGTTC AGC AGT-3′ | ||
6 | AtGAPDH-F | 5′-TTGGTGAC AAC AGGTC AAGC A-3′ | |
AtGAPDH-R | 5′-AAACTTGTCGCTCAATGCAATC-3′ | ||
7 | rt AtERD15-F | 5′-AACTTCGACTTGGTACCCTGAT-3′ | 116 |
rt AtERD15 -R | 5′-GAAGATCAGCTACATCGATATGA-3′ | ||