Table 6. Downstream proteins ranked by number of direct interactions with ALS-causative proteins.

Classical ALS				ALS+FTD
Rank	Uniprot	Protein	Interacting #	Rank	Uniprot	Protein	Interacting #
1	POCG48	UBC	19**	1	POCG48	UBC	22**
2	Q13501	SQSTM1	11*	2	P63104	YWHAZ	10
3	P63104	YWHAZ	9	3	O60260	PARK2	9
4	Q00987	MDM2	8	4	O75323	GBAS	9
5	O00443	PIK3C2A	8	5	O95166	GABARAP	9
6	O60260	PARK2	8	6	P11021	GRP78	9
7	O75323	GBAS	8	7	P55854	SUMO3	9
8	O95166	GABARAP	8	8	Q13618	CUL3	9
9	P55854	SUMO3	8	9	Q9H492	MAP1LC3A	9
10	Q13618	CUL3	8	10	Q00987	MDM2	9
11	P60520	GABARAPL2	8	11	Q9Y4P8	WIPI2	8
12	Q86VP9	PRKAG2	7	12	Q676U5	ATG16L1	8
13	Q9BSB4	ATG101	7	13	Q14999	CUL7	8
14	Q9H1Y0	ATG5	7	14	Q15843	NEDD8	8
15	Q9H492	MAP1LC3A	7	15	P60520	GABARAPL2	8
16	P11021	GRP78	7	16	Q9H0R8	GABARAPL1	8
17	Q676U5	ATG16L1	7	17	O00443	PIK3C2A	8
18	Q9H0R8	GABARAPL1	7	18	Q9H1Y0	ATG5	8
19	P61956	SUMO2	7	19	P61956	SUMO2	8
20	Q14999	CUL7	7	20	Q13616	CUL1	8
21	Q15843	NEDD8	7	21	Q9BSB4	ATG101	7
22	Q9Y4P8	WIPI2	7	22	Q9UGJ0	PRKAG1	7
23	Q13573	SNW1	6	23	P07437	TUBB	7
24	Q99459	CDC5L	6	24	P07900	HSP90AA1	7
25	P15297.	NOF	6	25	Q13573	SNW1	7
26	P54619	PRKAG1	6	26	Q86VP9	PRKAG2	7
27	Q13286	CLN3	6	27	P54619	PRKAG1	7
28	Q9GZZ9	UBA5	6	28	Q13286	CLN3	7
29	Q9NR46	SH3GLB2	6	29	Q9GZZ9	UBA5	7
30	Q9Y484	WDR45	6	30	Q9NR46	SH3GLB2	7
31	Q9UGJ0	PRKAG2	6	31	Q99459	CDC5L	6
32	O75147	OBSL1	5	32	P15297	NOF	6
33	O75530	EED	5	33	Q9Y484	WDR45	6
34	P02751	FN1	5	34	O75147	OBSL1	6
35	P13612	ITGA4	5	35	O75530	EED	6
36	P19320	VCAM1	5	36	P02751	FN1	6
37	P27694	RPA1	5	37	P13612	ITGA4	6
38	P35244	RPA3	5	38	P19320	VCAM1	6
39	P35638	DDIT3	5	39	P35638	DDIT3	6
40	P54646	PRKAA2	5	40	P54646	PRKAA2	6
41	Q15831	STK11	5	41	Q15831	STK11	6
42	Q13616	CUL1	5	42	P62993	GRB2	6
43	O15530	PDPK1	5	43	P27694	RPA1	6
44	P62993	GRB2	5	44	P27361	MAPK3	6

** >mean ± τ ∙ SD.

* >mean ± (τ ∙ SD)/2.