Table 1.
Nucleotide at -1 position of κB sites of VCAM1, CCL2 and RelB genes (10 kb upstream to and 1 kb downstream transcription start sites) in various vertebrates.
| Class | Species | VCAM1 | CCL2 | RelB | ||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Mammal | Homo sapiens | D | D | D | D | D | D | D | C | |||||||||||
| Pan troglodytes | D | D | D | D | D | D | C | |||||||||||||
| Mus musculus | D | D | D | D | D | D | D | C | ||||||||||||
| Bos taurus | D | D | D | D | D | D | D | D | C | |||||||||||
| Canis lupus familiaris | D | D | D | C | D | D | D | D | D | D | C | |||||||||
| Lipotes vexillifer | D | D | D | D | D | D | D | D | D | D | C | D | ||||||||
| Eptesicus fuscus | D | D | C | D | D | D | D | D | ||||||||||||
| Pteropus alecto | D | D | D | C/D | D | D | D | D | ||||||||||||
| Aves | Pseudopodoces humilis | D | C/D | C/D | D | C | D | D | D | D | D | C | C/D | |||||||
| Aquila chrysaetos canadensis | C/D | C/D | D | C | ||||||||||||||||
| Reptilia | Chrysemys picta | N | C | |||||||||||||||||
| Alligator mississippiensis | C | |||||||||||||||||||
| Python bivittatus | D | D | D | |||||||||||||||||
| Alligator sinensis | D | N | ||||||||||||||||||
| Amphhibia | Xenopus (Silurana) tropicalis | D | D | D | D | D | D | D | ||||||||||||
| Pisce | Notothenia coriiceps | N | D | |||||||||||||||||
| Stegastes partitus | N | C | ||||||||||||||||||
| Poecilia reticulata | D | D | C | C/D | D | |||||||||||||||
| Zebra fish | D | D | ||||||||||||||||||
C, cytosine; D, adenine, thymine or guanine; N, no any κB site; strips, no sequence information available; shadow, in CGIs.