Table 1.

Polymorphism information content (PIC) of 26 markers derived from 18 starch biosynthesis related genes in rice accessions of different ancestry groups.

	Total n = 217		TRJ1n = 39		TEJ n = 32		IND n = 72		AUS n = 39		Admix n = 17		ARO n = 6		WD n = 12
	No. of alleles	PIC	No. of alleles	PIC	No. of alleles	PIC	No. of alleles	PIC	No. of alleles	PIC	No. of alleles	PIC	No. of alleles	PIC	No. of alleles	PIC
Waxy-intron 1	2	0.33	2	0.27	2	0.37	2	0.31	2	0.32	2	0.33	2	0.24	2	0.24
RM190	15	0.85	5	0.52	4	0.55	8	0.63	9	0.77	8	0.81	2	0.27	5	0.72
Waxy-exon 2	2	0.13	1	0.00	2	0.16	2	0.14	2	0.20	2	0.10	1	0.00	2	0.14
Waxy-exon 6	2	0.31	2	0.05	2	0.35	2	0.14	2	0.31	2	0.30	2	0.24	1	0.00
Waxy-exon 10	2	0.25	2	0.05	2	0.11	2	0.37	2	0.09	2	0.10	1	0.00	2	0.14
SSIIa-4329,4330	2	0.24	2	0.05	2	0.32	2	0.28	2	0.23	2	0.25	2	0.24	2	0.14
SSIIa-4198	2	0.14	1	0.00	2	0.37	2	0.03	1	0.00	2	0.10	1	0.00	2	0.14
SBEIIb (SBE3)	2	0.35	2	0.17	2	0.19	2	0.34	2	0.27	2	0.30	2	0.35	2	0.24
ISA3	2	0.37	2	0.23	2	0.06	2	0.08	1	0.00	2	0.25	2	0.24	2	0.24
ISA1	2	0.37	2	0.27	2	0.11	2	0.28	2	0.09	2	0.35	2	0.24	2	0.30
SSIVb	2	0.37	2	0.17	1	0.00	2	0.10	1	0.00	2	0.30	1	0.00	2	0.15
SSIVb-Indel	2	0.09	2	0.13	2	0.06	1	0.00	2	0.20	2	0.19	1	0.00	1	0.00
SSIIb-Indel	2	0.37	2	0.05	2	0.06	2	0.08	2	0.05	2	0.35	1	0.00	2	0.14
PUL-Indel	2	0.26	2	0.23	2	0.36	2	0.14	2	0.09	2	0.33	2	0.24	1	0.00
SSIIc (SSII-1)	2	0.37	2	0.05	1	0.00	2	0.05	2	0.17	2	0.30	1	0.00	2	0.15
SSIIIb (SSIII-1)	2	0.19	1	0.00	2	0.38	2	0.05	2	0.20	2	0.25	2	0.24	1	0.00
GBSSII	2	0.37	2	0.37	2	0.37	2	0.19	2	0.09	2	0.37	1	0.00	2	0.24
BEI (SBE1)	2	0.21	2	0.05	2	0.31	2	0.05	2	0.05	2	0.19	1	0.00	2	0.14
BEIIa (SBE4)	2	0.37	2	0.31	2	0.06	2	0.10	2	0.05	2	0.30	2	0.24	2	0.15
BEIIb (SBE3)	2	0.35	2	0.23	2	0.11	2	0.37	2	0.29	2	0.37	2	0.24	2	0.24
AGPL1	2	0.28	2	0.27	2	0.19	2	0.35	2	0.29	2	0.10	2	0.24	1	0.00
AGPS2-2	2	0.30	2	0.05	2	0.29	2	0.08	2	0.27	2	0.35	1	0.00	2	0.30
AGPL4-1	2	0.37	2	0.35	1	0.00	2	0.08	2	0.05	2	0.35	1	0.00	2	0.15
AGPS2-1	2	0.37	2	0.32	2	0.06	2	0.25	2	0.05	2	0.30	1	0.00	2	0.14
AGPS1	2	0.36	2	0.05	2	0.19	2	0.13	2	0.27	2	0.33	2	0.38	2	0.19
AGPL3	2	0.37	2	0.17	1	0.00	2	0.26	1	0.00	2	0.33	1	0.00	2	0.35
AGPS2-3	2	0.36	2	0.36	2	0.06	2	0.25	1	0.00	2	0.30	1	0.00	1	0.00

TRJ, tropical japonica; TEJ, temperate japonica; IND, indica; AUS, aus; ARO, aromatic; WD, wild rice; Admix accessions with mixed ancestry.